Page 42 - 《中国药科大学学报》2026年第1期
P. 42

36                        学报   Journal of China Pharmaceutical University 2026, 57(1): 34 − 45  第 57 卷

               通 过 与 肝 细 胞 表 面 的 去 唾 液 酸 糖 蛋 白 受 体              的同一活性口袋,且均与口袋内                Arg168 残基形成
               (asialoglycoprotein receptor, ASGPR)结合,将  siRNA  关键相互作用(图        2-A,图  2-B),揭示化合物       4 中噻
               递送至肝细胞,进而靶向降解                 LDHA  的  mRNA,     唑甲酸为与      LDHA   结合的关键药效团。进一步观
               减少肝细胞的         LDHA  的表达,降低草酸盐的生                 察发现,化合物       4 的  2-乙炔基-5-甲基噻吩的结构可
               成  [17−18] 。目前,LDHA  相关的抑制剂药物仍十分                 以伸入活性口袋的疏水性空腔,但是在化合物                      3 与
               紧缺,开发具有优良成药特性的新型骨架                      LDHA     LDHA  蛋白的结合模式中,未见基团伸入该空腔,
               抑制剂及先导化合物具有重要的科学意义和临床                            因此提示该疏水基团对抑制活性贡献较小,故将其
               价值 。                                             去除以简化分子结构。此外,化合物                 4 结构中间的
                   [19]
                    在已报道的      LDHA  抑制剂中,化合物         4 表现      吡唑连接链提供了         4 个不同取代基的朝向,其与周
               出较强的体外       LDHA  酶抑制活性,但其相对分子质                 围氨基酸残基并未形成强的关键相互作用。因此,
               量大、亲脂性高等理化性质缺陷限制了成药性,故                           本研究拟用结构简化的脲基替代原吡唑连接链,并
               将其选为先导化合物进行结构改造与优化。为明                            进一步引入刚性的三氮唑作为连接链,共设计合成
               确构效关系,首先通过分析化合物                3 和  4 与  LDHA    了  18 个目标化合物并且测试了体外              LDHA  酶的抑
               共晶复合物的结合模式,发现二者均结合于                     LDHA     制活性(图     2-C)。


                       A             Tyr238     Asp194         B            Tyr238     Asp194
                        Ser236                          Glu191  Ser236                 His192  Glu191
                                                      Asp140      Arg168                      Asp140
                           Arg168
                                               His192
                       Thr247                                   Thr247
                                                                Tyr246                         Ile141
                        Tyr246                         Ile141                        Compound 4
                                              Asn137                                   Asn137
                         Compound 3
                           Arg98         NADH                       Arg98         NADH
                       C
                             S
                                                                                   Linker:
                                                                                            O
                                                    Scaffold hopping   Linker
                                        N                                                 N   N
                            F          N                                      N           H   H
                           O              N                                 S    COOH     N  N
                            S           S                       R                            N
                           O  NH 2           COOH
                                NCATS-SM1441 (4)
                                                                   Linker investigation
                                                                   compounds 8−25
                                               Key pharmacophore

               Figure 2    Binding mode analysis of compounds 3 and 4 with LDHA and modification strategy based on compound 4
               A:  Binding  mode  analysis  of  compound  3  (PDB:  4ZVV);  B:  Binding  mode  analysis  of  compound  4  (PDB:6Q13);  C:  Design  strategy  of  target
               compounds 8−25

                1    合成路线                                       剂中,与对硝基苯基氯甲酸酯发生酰化反应,制得

                    目标化合物      8~25 的合成如路线        1 所示。首        中间体    29;之后,中间体       27 与脲中间体     29 发生亲
               先,以   3-溴丙酮酸乙酯       26 为起始原料,与硫脲经成              核取代反应,得到以脲基为连接链的酯类中间体
               环反应制得中间体          27;随后,以对位不同取代的苄                30;最后经水解反应,得到目标化合物                8~16。
               胺  28 为起始原料,在甲基叔丁基醚与水的混合溶                             目标化合物      17~25 的合成如路线       2 所示。以
   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47