Page 47 - 《中国药科大学学报》2026年第1期
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第  57 卷第  1 期               邴天德,等:乳酸脱氢酶       A  抑制剂的设计、合成与生物活性                             41


               LDHA  和 底 物 复 合 物 的 均 方 根 偏 差 ( root  mean       Table 3    Enzyme inhibitory activity of 8−25 against LDHA ( x ± s,
                                                                n = 3)
               square  deviation,  RMSD) 通 过  GROMACS  的  rms
                                                                  Compd.   IC 50 /(μmol/L)  Compd.  IC 50 /(μmol/L)
               命令得到。通过分子力学泊松-玻尔兹曼表面积
                                                                    8       330.4 ± 15.4   18     246.1 ± 15.8
               (molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area,  9      180.5 ± 8.9    19     173.7 ± 15.8
               MM-PBSA)计算结合自由能,使用              g_mmpbsa 进行          10      323.1 ± 6.9    20     206.5 ± 8.5
                             [21]
               MM-PBSA   计算 。                                       11      156.9 ± 7.7    21     11.59 ± 3.45
                2.6    理化性质以及药代动力学参数模拟预测实验                          12      99.12 ± 7.27   22     325.2 ± 14.1
                                                                    13      112.5 ± 10.3   23     80.44 ± 10.35
                    使 用   SwissADME( http://www.swissadme.ch/)
                                                                    14      18.08 ± 8.00   24     11.52 ± 4.32
               预测化合物      25 的理化性质及药代动力学性质,具体
                                                                    15      27.06 ± 6.09   25      1.59 ± 1.33
               指标包括与肠道吸收性相关的                6 种性质(亲脂性、              16      14.35 ± 5.27   4       0.06 ± 0.03
               相对分子质量、拓扑极性表面积、溶解度、饱和度                               17      26.33 ± 6.23
               和灵活性)、血脑屏障通透性、P-糖蛋白酶底物和类
                                                                氧基取代的化合物         12 的抑制活性较化合物           8 略有
               药活性分析(Lipinski 规则)。
                                                                提升,IC  = 99.12 μmol/L;吸电子基团取代的化合
                2.7    细胞毒性实验                                           50
                                                                物中,三氟甲基取代的化合物               13 和三氟甲氧基取
                    通过  MTT  比色法测定癌细胞生长抑制情况和
                                                                代的化合物       14 的抑制活性均较化合物            8 有所提
               正常细胞的存活情况。胰腺癌细胞                Mia PaCa-2 在含
                                                                升,其中化合物        14 的抑制活性提升了一个数量级,
               有  10%  胎牛血清的    DMEM   培养基中培养。HUVEC
                                                                IC  = 18.08 μmol/L;酰胺取代的化合物         15 的抑制
                                                                  50
               细胞在     RPMI-1640 培养基中用       10%  胎牛血清培
                                                                活性与化合物        14 相近,而磺酰胺取代的化合物
                                   4
               养。细胞以每毫升         110 个细胞的密度接种在           96 孔
                                                                16 表现出最优的抑制活性,IC  = 14.35 μmol/L。
                                                                                             50
               板中,并在      37 ℃  的含  5% CO 的湿润空气中孵育
                                          2
                                                                     为了进一步探究该类化合物的构效关系,将化
               16 h。将   3 倍浓度梯度稀释的待测化合物              25 溶液      合物   8、14、15 和  16 与  LDHA  蛋白进行分子对接
               加入培养基中,在         37 ℃  的含  5% CO 的湿润空气           (图  3)。对比分析发现,噻唑甲酸均与                  Arg168、
                                                2
               中孵育    72 h。加入   MTT  溶液(5 mg/mL),再孵育细           Thr247 残基形成氢键相互作用。其中,化合物                   14
               胞  4 h。抽吸混合溶液,并向每孔加入                DMSO 150     的苯环对位引入的三氟甲氧基会与                 Arg105 残基形
               μL  溶解甲臜。酶标仪(TECAN SPARK)记录               570    成氢键相互作用,化合物            15 苯环对位引入的酰胺
               nm  处的吸收度(A)。以培养液处理的副孔为对照                        基会与     Arg105 残基形成氢键相互作用,化合物
               组,计算化合物对癌细胞的抑制率和对正常细胞的                           16 的苯环对位引入的磺酰胺基会与               Arg105 残基形
               存活率:抑制率=(对照组平均             A–给药组平均      A)/对     成氢键相互作用,这导致其活性相较于苯环无取代
               照组平均     A×100%;细胞存活率=(给药组平均             A–空     的化合物     8 提升一个数量级。
               白组平均     A)/(对照组平均      A–空白组平均      A)×100%,         在三氮唑类化合物中,为了探索苯环对位不同
               并使用    GraphPad Prism 8 计算  IC 。                 取代基对活性的影响,仍用吸电子或给电子基团取
                                            50
                                                                代,设计并合成了化合物            17~25。无取代的化合物
                3    生物活性实验结果与构效关系讨论
                                                                17 较之前的化合物活性有了一定的提升,约是原来
                    为了研究目标化合物对             LDHA  酶的抑制活          的  5 倍,IC  = 26.33 μmol/L。卤素取代的化合物
                                                                          50
               性,采用检测      NADH   在  340 nm  处的吸收度来评价           18~20 的活性较无取代的化合物            17 有所下降,强吸
               化合物    8~25 对  LDHA  酶的抑制活性。实验结果如                电子基团三氟甲基取代的化合物                22 和三氟甲氧基
               表  3 所示。                                         取代的化合物       23 抑制活性均发生下降,其中             22 抑
                    为系统探究苯环对位取代基对脲类化合物活                         制活性下降幅度较大。这表明,在三氮唑类化合物
               性的影响,在苯环对位引入吸电子或给电子基团进                           中,苯环对位引入吸电子基团不利于提升抑制活
               行取代修饰,设计并合成了化合物                8~16。活性测试         性。甲基取代的化合物            21 活性约为无取代化合物
               结果显示,卤素取代的化合物               9~11 的抑制活性与          17 的两倍,IC  = 11.59 μmol/L。这表明,苯环对位
                                                                            50
               无取代的化合物        8 相比无显著变化;给电子基团甲                  引入给电子基团有利于提升抑制活性。酰氨基取
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