Page 105 - 《渔业研究》2025年第5期
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646 渔 业 研 究 第 47 卷
胶原酶 vs 对照
Collagenase vs Control
a) b)
2.0
20
P adj ≤0.05 1.5 生物过程 Biological process
−log 10 (P adj ) |log 2 FoldChange| −log 10 (P adj ) 1.0 细胞组分 Cellular component
上调 Up (78)
分子功能 Molecular function
下调 Down (54)
10
无变化 No change
(47 398)
0.5
1.301
0
−24 −12 −1 01 12 24 1 2 3 4 5 6 7 8 9 101112131415161718192021
log 2 FoldChange 术语 Term
c)
Adelin 信号通路
Apelin signaling pathway
P adj
1.00
描述 Description Adrenergic signaling in cardiomyocytes 基因数量 Count
心肌细胞中的肾上腺素能信号传导
0.75
0.50
0.25
0
心肌收缩
1.00
Cardiac muscle contraction
1.25
1.50
1.75
肌动蛋白细胞骨架的调控 2.00
Regulation of actin cytoskeleton
0.4 0.5 0.6
基因比例 Gene ratio
图 4 胶原酶引起菲律宾蛤仔基因表达变化的转录组数据分析
Fig. 4 Transcriptomic analysis of gene expression changes in Manila clam induced by collagenase
注:a)胶原酶注射组与对照组的差异基因火山图,蓝色虚线表示差异基因筛选标准的阈值线 。b)差异基因的 GO 富集
分析柱状图;横坐标为 GO 项,纵坐标为 GO 项富集的显著性水平;1. DNA 代谢过程;2. DNA 整合;3. DNA 复制;
4. DNA 重组;5. 免疫反应;6. 免疫系统过程;7. DNA 修复;8. DNA 损伤刺激的细胞响应 ;9. 刺激的细胞响应;10. 刺激响
应;11. 细胞核;12. 反向转运活性;13. 双链 DNA 结合活性;14. 质子跨膜转运活性;15. 肌动蛋白结合;16. 核糖核酸酶活
性;17. 细胞因子受体结合;18. 肿瘤坏死因子受体结合;19. 肿瘤坏死因子受体超家族;20. 核酸酶活性;21. 次级主动跨膜转
运活性。c)差异基因的 KEGG 富集散点图;横坐标为注释到 KEGG 通路上的差异基因数与差异基因总数的比值,纵坐标为
KEGG 通路。
Notes: a) Volcano plot of differentially expressed genes (DEGs) between collagenase-injected and control groups; The blue dashed
line indicates the threshold for statistically significant DEG selection. b) Bar plot of Gene Ontology (GO) enrichment analysis for
DEGs. The x-axis represents GO terms, while the y-axis shows the significance level [−log 10 (P-value)] of enriched terms; 1. DNA
metabolic process; 2. DNA integration; 3. DNA replication; 4. DNA recombination; 5. Immune response; 6. Immune system process; 7.
DNA repair; 8. Cellular response to DAN damage stimulus; 9. Cellular response to stress; 10. Response to stress; 11. Nucleus; 12.
Antiporter activity; 13. Double-stranded DNA binding; 14. Proton transmembrane transporter activity; 15. Actin binding; 16.
Ribonuclease activity; 17. Cytokine receptor binding; 18. Tumor necrosis factor receptor binding; 19. Tumor necrosis factor receptor
superfamily; 20. Nuclear activity; 21. Secondary active transmembrane transporter activity. c) Scatter plot of Kyoto Encyclopedia of
Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment; The x-axis represents the ratio of DEGs annotated to a given pathway versus total
DEGs, and the y-axis displays KEGG pathways.
2.4 可抑制胶原酶药物的筛选 的抑制效果最强,其次分别为苯扎氯氨、盐酸巴马
添加药物后,大牡蛎弧菌 S2 胶原酶的活性 汀、2’-羟基查尔酮、氯己定、核黄素和原花青素
均有不同程度的下降,其中姜黄素对胶原酶活性 (图 5a) 。核黄素 、姜黄素、原花青素、盐酸巴

