Page 105 - 《渔业研究》2025年第5期
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646                                  渔  业  研  究                                     第 47 卷

                                胶原酶 vs 对照

                              Collagenase vs Control
                       a)                                b)
                                                          2.0
                         20
                                          P adj ≤0.05     1.5                     生物过程 Biological process
                      −log 10  (P adj )   |log 2  FoldChange|  −log 10  (P adj )  1.0  细胞组分 Cellular component
                                           上调 Up (78)
                                                                                  分子功能 Molecular function
                                           下调 Down (54)
                         10
                                           无变化 No change
                                           (47 398)
                                                          0.5
                       1.301
                                                           0
                           −24  −12  −1 01  12  24            1 2 3 4 5 6 7 8 9 101112131415161718192021
                                 log 2  FoldChange                       术语 Term
                                 c)
                                                 Adelin 信号通路
                                            Apelin signaling pathway
                                                                              P adj
                                                                               1.00
                                  描述 Description  Adrenergic signaling in cardiomyocytes  基因数量 Count
                                     心肌细胞中的肾上腺素能信号传导
                                                                               0.75
                                                                               0.50
                                                                               0.25
                                                                               0
                                                     心肌收缩
                                                                               1.00
                                           Cardiac muscle contraction
                                                                               1.25
                                                                               1.50
                                                                               1.75
                                           肌动蛋白细胞骨架的调控                         2.00
                                        Regulation of actin cytoskeleton
                                                               0.4  0.5  0.6
                                                              基因比例 Gene ratio
                                      图 4    胶原酶引起菲律宾蛤仔基因表达变化的转录组数据分析
                       Fig. 4    Transcriptomic analysis of gene expression changes in Manila clam induced by collagenase
                  注:a)胶原酶注射组与对照组的差异基因火山图,蓝色虚线表示差异基因筛选标准的阈值线 。b)差异基因的                                 GO  富集
              分析柱状图;横坐标为         GO 项,纵坐标为      GO  项富集的显著性水平;1. DNA       代谢过程;2. DNA     整合;3. DNA  复制;
              4. DNA  重组;5. 免疫反应;6. 免疫系统过程;7. DNA      修复;8. DNA  损伤刺激的细胞响应 ;9. 刺激的细胞响应;10. 刺激响
              应;11. 细胞核;12. 反向转运活性;13. 双链       DNA  结合活性;14. 质子跨膜转运活性;15. 肌动蛋白结合;16. 核糖核酸酶活
              性;17. 细胞因子受体结合;18. 肿瘤坏死因子受体结合;19. 肿瘤坏死因子受体超家族;20. 核酸酶活性;21. 次级主动跨膜转
              运活性。c)差异基因的        KEGG  富集散点图;横坐标为注释到        KEGG  通路上的差异基因数与差异基因总数的比值,纵坐标为
              KEGG  通路。
                  Notes: a) Volcano plot of differentially expressed genes (DEGs) between collagenase-injected and control groups; The blue dashed
              line  indicates  the  threshold  for  statistically  significant  DEG  selection.  b)  Bar  plot  of  Gene  Ontology  (GO)  enrichment  analysis  for
              DEGs. The x-axis represents GO terms, while the y-axis shows the significance level [−log 10 (P-value)] of enriched terms; 1. DNA
              metabolic process; 2. DNA integration; 3. DNA replication; 4. DNA recombination; 5. Immune response; 6. Immune system process; 7.
              DNA repair; 8. Cellular response to DAN damage stimulus; 9. Cellular response to stress; 10. Response to stress; 11. Nucleus; 12.
              Antiporter  activity;  13.  Double-stranded  DNA  binding;  14.  Proton  transmembrane  transporter  activity;  15.  Actin  binding;  16.
              Ribonuclease activity; 17. Cytokine receptor binding; 18. Tumor necrosis factor receptor binding; 19. Tumor necrosis factor receptor
              superfamily; 20. Nuclear activity; 21. Secondary active transmembrane transporter activity. c) Scatter plot of Kyoto Encyclopedia of
              Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment; The x-axis represents the ratio of DEGs annotated to a given pathway versus total
              DEGs, and the y-axis displays KEGG pathways.

               2.4 可抑制胶原酶药物的筛选                                 的抑制效果最强,其次分别为苯扎氯氨、盐酸巴马
                  添加药物后,大牡蛎弧菌              S2  胶原酶的活性          汀、2’-羟基查尔酮、氯己定、核黄素和原花青素
              均有不同程度的下降,其中姜黄素对胶原酶活性                            (图  5a) 。核黄素 、姜黄素、原花青素、盐酸巴
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