Page 58 - 《水产学报》2026年第2期
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2 期                                     水    产    学    报                                 50 卷


                                                                        M      1             M    1
                                                                  bp                  bp

                                                                2 000               2 000
                                                                                    1 000
                                                                1 000
                                                                                     750
                                                                  750
                                                                                     500
                                                                  500
                                                                                     250
                                                                  250
                                                                  100                100

                                       (a)                                 (b)                (c)
                                                  图 1    HcNQO1  基因的克隆
              (a) HcNQO1  的核苷酸序列和推导的氨基酸序列;(b) HcNQO1    基因  5′-RACE  的  DNA  电泳图;(c) HcNQO1  基因  3′-RACE  的  DNA  电泳图。
              M. 2 000 bp DNA marker, 1. 第三轮  PCR  产物  (箭头指示)。
                                              Fig. 1 Cloning of the HcNQO1 gene
              (a) nucleotide sequences and deduced amino acid sequences of the HcNQO1; (b) DNA electropherogram of 5′-RACE for the HcNQO1 gene; (c) DNA
              electropherogram of 3′-RACE for the HcNQO1 gene. M. 2 000 bp DNA marker, 1. the third round PCR product (arrow indication).

              2  构成,但砂海螂和蚌蛎缺失             motif 2。C  端结构       显示,该分子由        264  个氨基酸残基组成,分子量
              域在脊椎动物中为          motif 8,而在无脊椎动物中则              30.48 ku,理论等电点      5.70,具弱酸性特征。氨基
              为  motif 9。值得注意的是,三角帆蚌、蚌蛎和砂                      酸组成中疏水性残基占比显著,其中亮氨酸 (Leu,
              海螂的    NQO1  蛋白共同缺失       motif 4,提示该区域          10.2%) 和苯丙氨酸 (Phe,8.7%) 含量突出,亲水
              可能在双壳类进化过程中发生功能分化,这一特                            性谷氨酸 (Glu,8.0%) 占比最高。分子式           C 1 383 H 2 092
                                                                      S 含
              征可能与其特殊的氧化还原调控机制相关 (图                    3)。     N 358 O 387 1 7  17  个硫原子,提示存在多个半胱氨
                                                               酸/甲硫氨酸残基。理化性质预测显示,不稳定性
               2.3    HcNQO1  蛋白理化性质分析
                                                               指数  (II) 41.67 (临界值>40),为不稳定蛋白;脂肪
                   通过  NCBI-CDD  数据库对     HcNQO1  保守结构         族指数    72.77  反映中等热稳定性;亲水性平均值
              域分析发现,该蛋白包含             FMN_red  超家族特征性          (GRAVY)−0.285  表明整体呈弱亲水特性 (图          4-b)。
              结构域 (图    4-a),该结构域主要参与黄素单核苷酸                        二级结构预测采用         SOPMA  算法,结果显示,
              结合及氧化还原反应调控。蛋白质基本参数分析                            该蛋白含无规卷曲 (40.91%)、α-螺旋 (37.88%)、


                                                                  紫贻贝 M. edulis (CAG2186151.1)
                                                               1
                                          0.88                      厚壳贻贝  M. coruscus (CAC5357314.1)
                                      0.79                   鸭嘴海豆芽  Lingula anatina (XP 013417651.1)
                                                                                               无脊椎动物
                                                          红鲍  Haliotis rufescens (XP 046352606.1)
                                   0.99                                                        invertebrates
                                                                     蚌蛎  M. mercenaria (XP 045205130.1)
                                                        0.97
                                                1                    砂海螂  M. arenaria (XP 052794685.1)
                                                               三角帆蚌  H. cumingii
                                             鳜  Siniperca chuatsi (XP 044073869.1)
                                           0.96
                                               大黄鱼  Larimichthys crocea (XP 010747996.2)
                                          0.91
                                             裸盖鱼  Anoplopoma fimbria (XP 054471633.1)
                                          0.78                                                  脊椎动物
                                       0.96
                                              鳃棘鲈  Plectropomus leopardus (XP 042351131.1)      vertebrates
                               0.94           白斑狗鱼  Esox lucius (XP 028969428.2)
                                               斑马鱼  D. rerio (AAH65622.1)
                         智人  Homo sapiens (AAH07659.1)
                                        0.1
                                          图 2    基于  HcNQO1  氨基酸序列的系统发育树
                             Fig. 2 Phylogenetic tree constructed based on the HcNQO1 amino acid sequences

              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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