Page 59 - 《水产学报》2026年第2期
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2 期 杨清麟,等:三角帆蚌 NQO1 基因的克隆、表达及其与 Nrf2 信号通路的调控关系 50 卷
紫贻贝 M. edulis
厚壳贻贝 M. coruscus
鸭嘴海豆芽 L. anatina
无脊椎动物 motif 1
invertebrates 红鲍 H. rufescens motif 2
蚌蛎 M. mercenaria
motif 3
砂海螂 M. arenaria motif 4
三角帆蚌 H. cumingii motif 5
鳜 S. chuatsi motif 6
motif 7
大黄鱼 L. crocea
motif 8
裸盖鱼 A. fimbria
脊椎动物 鳃棘鲈 P. leopardus motif 9
vertebrates
白斑狗鱼 E. lucius
斑马鱼 D. rerio
智人 H. sapiens
5′ 3′
0 100 200 300 400 500
图 3 HcNQO1 蛋白的 motif 分析
Fig. 3 Motif analysis of the HcNQO1 protein
FMN_red superfamily
1 4 213 264 0 50 100 150 200 250
(a)
螺旋 helix 转角 turn
折叠 sheet 无规卷曲 coil
hydropath./kyte & doolittle
2.5
2.0
1.5
1.0
0.5 0 50 100 150 200 250
得分 score −0.5 0 (c)
−1.0
−1.5
−2.0
−2.5
−3.0
0 50 100 150 200 250
位置
position
(b) (d)
图 4 HcNQO1 基因的分子表征
(a) HcNQO1 蛋白保守结构域示意图;(b) 疏水性预测;(c) 二级结构预测;(d) 三级结构预测。
Fig. 4 Molecular characterization of the HcNQO1 gene
(a) analysis of protein structure of the HcNQO1; (b) hydrophobicity prediction; (c) secondary structure prediction; (d) tertiary structure prediction.
延伸链 (14.02%) 及 β-转角 (7.20%),其中螺旋与 精度),显示模型可靠性良好 (图 4-d)。
卷曲结构交替分布 (图 4-c)。信号肽预测经 Sig-
2.4 HcNQO1 的组织特异性表达
nalP 6.0 模型验证,确定无分泌信号序列。基于
SWISS-MODEL 同源建模平台,以 5fuq.1 为模板 RT-qPCR 结果显示,HcNQO1 mRNA 在所有
构建三维结构,模型质量评估指标 GMQE=0.82 检测的组织中均有表达,其中,HcNQO1在性腺
(>0.6 为可信模型)、QMEANDisCo=0.77 (>0.7 属高 组织中的表达水平最高 (P<0.05);血淋巴、鳃和
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