Page 59 - 《水产学报》2026年第2期
P. 59

2 期           杨清麟,等:三角帆蚌         NQO1  基因的克隆、表达及其与         Nrf2  信号通路的调控关系               50 卷


                            紫贻贝 M. edulis
                            厚壳贻贝  M. coruscus
                            鸭嘴海豆芽  L. anatina
                   无脊椎动物                                                                        motif 1
                   invertebrates  红鲍  H. rufescens                                              motif 2
                            蚌蛎  M. mercenaria
                                                                                                motif 3
                            砂海螂  M. arenaria                                                    motif 4
                            三角帆蚌  H. cumingii                                                   motif 5
                            鳜  S. chuatsi                                                       motif 6
                                                                                                motif 7
                            大黄鱼  L. crocea
                                                                                                motif 8
                            裸盖鱼  A. fimbria
                    脊椎动物    鳃棘鲈  P. leopardus                                                   motif 9
                    vertebrates
                            白斑狗鱼  E. lucius
                            斑马鱼  D. rerio
                            智人  H. sapiens
                                       5′                                                            3′
                                           0          100        200         300        400         500
                                               图 3    HcNQO1  蛋白的  motif 分析
                                           Fig. 3 Motif analysis of the HcNQO1 protein


                                 FMN_red superfamily
                      1 4                              213 264 0    50     100     150     200     250
                                       (a)
                                                                                  螺旋  helix  转角 turn
                                                                                  折叠  sheet  无规卷曲  coil
                                    hydropath./kyte & doolittle
                        2.5
                        2.0
                        1.5
                        1.0
                        0.5                                  0      50     100     150     200     250
                    得分  score  −0.5 0                                            (c)
                       −1.0
                       −1.5
                       −2.0
                       −2.5
                       −3.0
                           0    50    100   150   200   250
                                         位置
                                        position
                                          (b)                                    (d)
                                                图 4    HcNQO1  基因的分子表征
              (a) HcNQO1  蛋白保守结构域示意图;(b) 疏水性预测;(c) 二级结构预测;(d) 三级结构预测。
                                       Fig. 4 Molecular characterization of the HcNQO1 gene
              (a) analysis of protein structure of the HcNQO1; (b) hydrophobicity prediction; (c) secondary structure prediction; (d) tertiary structure prediction.
              延伸链 (14.02%) 及    β-转角 (7.20%),其中螺旋与             精度),显示模型可靠性良好 (图            4-d)。
              卷曲结构交替分布 (图           4-c)。信号肽预测经        Sig-
                                                                2.4    HcNQO1  的组织特异性表达
              nalP 6.0  模型验证,确定无分泌信号序列。基于
              SWISS-MODEL   同源建模平台,以          5fuq.1  为模板          RT-qPCR  结果显示,HcNQO1 mRNA        在所有
              构建三维结构,模型质量评估指标                   GMQE=0.82      检测的组织中均有表达,其中,HcNQO1在性腺
              (>0.6  为可信模型)、QMEANDisCo=0.77 (>0.7     属高       组织中的表达水平最高 (P<0.05);血淋巴、鳃和

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
                                                            7
   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64