Page 146 - 《渔业研究》2025年第5期
P. 146

第 5 期    魏    华等: 基于超分支滚环扩增技术对中华绒螯蟹“牛奶病”病原二尖梅奇酵母的高灵敏检测                                 687


                         a)      M   1   2  3  4   5  6   b)      M   1   2   3    4   5   6
                           长度/bp                            长度/bp
                           Length                           Length



                                                              500
                              500
                              400                             400
                              300                             300
                              200                             200
                              150                             150
                              100                             100
                              50
                                                               50




                          c)     M  1  2  3  4  5  6  7   d)      M   1  2  3  4  5  6  7  8  9
                           长度/bp                            长度/bp
                           Length                           Length



                              500
                              400
                              300                             500
                              200                             400
                                                              300
                              150                             200
                              100                             150
                              50                              100
                                                               50


                                                 图 5    HRCA  检测体系的优化
                                           Fig. 5    Optimization of HRCA detection system
                  注:a. HRCA  技术  PLP  浓度优化(M:DL 500 DNA Marker;泳道  1:100 μmol/L; 泳道  2:10 μmol/L;泳道  3:1 μmol/L;
              泳道  4:0.1 μmol/L;泳道  5:0.01 μmol/L;泳道  6:阴性) 。b. HRCA  技术扩增温度优化(M:DL 500 DNA Marker;泳道
              1:63 ℃;泳道    2:60 ℃;泳道   3:57 ℃;泳道    4:54 ℃;泳道   5:51 ℃;泳道   6:阴性) 。c. HRCA  技术扩增时间优化
              (M:DL 500 DNA Marker;泳道   1:60 min; 泳道  2:50 min;泳道  3:40 min;泳道  4:30 min;泳道  5:20 min;泳道  6:
              10 min;泳道  7:阴性) 。d. Bst DNA  聚合酶大片段浓度优化(M:DL 500 DNA Marker;泳道        1:1 U/mL;泳道  2:2 U/mL;
              泳道  3:3 U/mL;泳道   4:4 U/mL;泳道  5:5 U/mL;泳道   6:6 U/mL;泳道  7:7 U/mL;泳道   8:8 U/mL;泳道  9:阴性) 。
                  Notes: a. Optimization of HRCA PLP concentrationn (M: DL 500 DNA Marker; Lane 1: 100 μmol/L; Lane 2: 10 μmol/L; Lane
              3: 1 μmol/L; Lane 4: 0.1 μmol/L; Lane 5: 0.01 μmol/L; Lane 6: Negative). b. Optimization of HRCA amplification temperature (M: DL
              500 DNA Marker; Lane 1: 63 ℃; Lane 2: 60 ℃; Lane 3: 57 ℃; Lane 4: 54 ℃; Lane 5: 51 ℃; Lane 6: Negative) . c. Optimization of
              HRCA amplification time (M: DL 500 DNA Marker; Lane 1: 60 min; Lane 2: 50 min; Lane 3: 40 min; Lane 4: 30 min; Lane 5: 20 min;
              Lane 6: 10 min; Lane 7: Negative). d. Optimization of Bst DNA polymerase concentration(M: DL 500 DNA Marker; Lane 1: 1 U/mL;
              Lane 2: 2 U/mL; Lane 3: 3 U/mL; Lane 4: 4 U/mL; Lane 5: 5 U/mL; Lane 6: 6 U/mL; Lane 7: 7 U/mL; Lane 8: 8 U/mL; Lane 9:
              Negative).
               2.2.3 扩增温度的优化                                   明显扩增条带;从          20 min  开始,图   5c 泳道  5  显
                  如图   5b  所示,当扩增温度为         51 ℃  时,未有        示,HRCA    成功扩增出明亮条带;当扩增时间延长
              扩增条带;当扩增温度为            54 ℃  时,电泳条带亮度            至  30、40、50  和  60 min  时,扩增产物均无显著增
              开始逐渐增加;当扩增温度为               57~60 ℃  时,电泳        加。因此,为保证扩增效率,同时尽可能减少检测
              图中扩增产物的条带亮度无显著差异;当扩增温                            时间,最终扩增时间设置为            20 min。
              度达到    63 ℃  时,条带亮度明显增强。因此,认为                     2.2.5 Bst DNA  聚合酶浓度的优化
              63 ℃  为最佳扩增温度。                                       如图  5d  所示,随着     Bst DNA  聚合酶浓度的增
               2.2.4 扩增时间的优化                                   加,HRCA    反应条带的亮度也逐渐增强,当                 Bst
                  如图   5c 所示,当扩增时间为         10 min  时,未见       DNA  聚合酶浓度为       1 U/mL  时,可见条带亮度微
   141   142   143   144   145   146   147   148   149   150   151