Page 144 - 《渔业研究》2025年第5期
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第 5 期    魏    华等: 基于超分支滚环扩增技术对中华绒螯蟹“牛奶病”病原二尖梅奇酵母的高灵敏检测                                 685

               1.3.7 HRCA  重复性及稳定性分析                            1.3.9 qPCR  对实际样本的检测
                  以相同浓度的二尖梅奇酵母靶标                ssDNA  作为          为了验证     HRCA  技术的实用性及可靠性,采
              模板,由     3  名不同试验人员进行         HRCA  检测,通         用  qPCR  技术进行平行检测,比较          2  种方法的阳性
              过琼脂糖凝胶电泳结果评估该检测方法的重复性。                           检出率。根据二尖梅奇酵母              26S rRNA  基因序列
              将  HRCA  产物在    4 ℃  下分别放置     24、48  和  72 h    (U44822) ,使用    Primer Premier 5 软件设计特异
              后,用    2 %  的琼脂糖凝胶进行电泳分析,以此判断                    性引物,引物序列见表            4。将中华绒螯蟹肝胰腺
              扩增产物的稳定性。                                        DNA  样本进行    10  倍梯度稀释,再将各稀释度样本
               1.3.8 HRCA  对实际样本的检测                            进行  qPCR  扩增。具体反应体系为           10.0 μL 2× Taq
                  随机选取     80  个中华绒螯蟹肝胰腺组织           DNA,      Master  Mix、 10  μmol  /L  上 下 游 引 物 各  0.4  μL、
              经由   aPCR  产生的   ssDNA  作为扩增的靶标模板,               2.0 μL DNA 模板,用无菌水补充至 20.0 μL。反应
              用优化后的反应体系进行            HRCA,以评估实际样本              程序为 95 ℃ 5 min、95 ℃ 10 s、55 ℃ 30 s、72 ℃
              的检测效率。同时,通过            10  倍梯度稀释提取的中             30 s,40  个循环。最终通过监测荧光信号,基于循
              华绒螯蟹肝胰腺        DNA  样本,评定该方法对实际样                 环阈值(Cycle threshold,Ct)值绘制标准曲线并
              本的检测灵敏度。                                         计算扩增效率。

                                                    表 4    qPCR  引物序列
                                                Tab. 4    qPCR primer sequence
                              名称                             序列(5’—3’  )                    碱基数/nt
                              Name                          Sequences (5’—3’)              Base numbers
                     上游引物   A1 Forward primer A1        AAGGTGGTCTCAGTTAGTTC                   20
                     下游引物   A1 Reverse primer A1         TGTTCGCTATCGGTCTCT                    18
                注:aPCR  序列同  qPCR。
                Note: aPCR sequence is the same as qPCR.

               1.4 数据处理                                        结果(图    3a)显示,只有病蟹         DNA  样本扩增出明
                  本研究中所有组别均设置             3  个平行,以平均           亮条带,与目的片段一致,大小为               195 bp;而健康
              值±标准差(Mean ± SD)表示。所有试验数据用                       蟹未扩增出目的条带。对扩增条带进行胶回收、检
              IBM SPSS Statisitcs 27 进行处理与汇总;用       Origin    测,并分别与      GenBank  上登录的同属      26S rRNA  序
              2024  进行曲线拟合及图形绘制。                               列(U44822)进行同源性比较,测序结果显示与
                                                               二尖梅奇酵母的同源性达到            99 %(图   3b) 。
               2 结果与分析
                                                                2.2 HRCA  检测体系的建立及优化
               2.1 病蟹典型症状及        PCR  鉴定                       2.2.1 HRCA  检测体系的建立
                  在中华绒螯蟹感染二尖梅奇酵母后,可观察到                             本研究验证了       HRCA  体系的可行性,结果如
              病蟹活力明显减弱、不进食、行动迟缓、肌肉不透                           图  4  所示。体系在单一未添加          PLP、T4 DNA   连接
              明或发白、血淋巴呈现乳白色,最终因器官衰竭而                           酶、DNA    模板和   Bst DNA  聚合酶的情况下,均无
              死亡。对病蟹(图         2a)与健康蟹(图        2b)进行比         条带产生。只有在上述主要反应物都存在时,且
                                                               在  T4 DNA  连接酶的催化作用、PLP         与  DNA  模板
              较,可见患病导致蟹盖内蓄积大量白色乳状液体。
                                                               进行环化、后续       Bst DNA  聚合酶发生高效的催化反
                  对中华绒螯蟹       DNA  样本进行    PCR  检测,电泳
                                                               应条件下,体系才能够进行             HRCA,如图      泳道
                                                                                                    4     1
                 a)                 b)
                                                               所示。结果进一步证明了            HRCA  的扩增模板是环
                                                               化的  PLP,或环化的      PLP  是  HRCA  的引物模板。
                                                                2.2.2 PLP  浓度的优化
                                                                   如图  5a 所示,当  PLP  浓度为  100、10  和  1 μmol/L
                                                               时,均能够观察到清晰的梯状              DNA  条带;当    PLP
                                                               浓度为   0.1 μmol/L  时,条带的亮度明显减弱;当         PLP
                        图 2    病蟹(a)与健康蟹(b)                    浓度为   0.01 μmol/L  时,已无扩增条带出现,与对
                  Fig. 2    Diseased (a) and healthy (b) E. sinensis  照组无差异。因此,后续试验采用        1 μmol/L PLP。
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