Page 148 - 《渔业研究》2025年第5期
P. 148

第 5 期    魏    华等: 基于超分支滚环扩增技术对中华绒螯蟹“牛奶病”病原二尖梅奇酵母的高灵敏检测                                 689


                   a)      M   1  2  3   4  5  6   7  8  9  10  11  12  b)      M  1   2  3   4  5
                    长度/bp                                                 长度/bp
                     Length                                               Length
                       500
                       400
                       300
                       200                                                  500
                       150                                                  400
                       100                                                  300
                                                                            200
                        50                                                  150
                                                                            100
                                                                             50
                                                  图 7    HRCA  技术的特异性
                                                  Fig. 7    Specificity of HRCA

                  注:a. HRCA  技术种属间特异性检测(M:DL 500 DNA Marker;泳道         1:M. bicuspidate;泳道  2:M. agaveae;泳道  3:
              M. zobellii;泳道  4:C. oleophila;泳道  5:C. opuniae;泳道  6:V. alginolyticus;泳道  7: CyHV-3;泳道  8:GCHV;泳道
              9:H. eriocheir;泳道  10:Hematodinium sp.;泳道  11:P. putida;泳道  12:阴性) ; b. HRCA  技术碱基错配特异性检测
              (M:DL 500 DNA Marker;泳道  1:靶标   ssDNA;泳道  2:S1;泳道   3:S2;泳道   4:S3;泳道   5:阴性) 。
                  Notes: a. HRCA inter species specificity detection map (M: DL 500 DNA Marker; Lane 1: M. bipipidate; Lane 2: M. agaveae;
              Lane 3: M. zobellii; Lane 4: C. oleophila; Lane 5: C. opuniae; Lane 6: V. alginolyticus;Lane 7: CyHV-3; Lane 8: GCHV; Lane 9:
              H. eriocheir; Lane 10: Hemodonium sp.; Lane 11: P. putida; Lane 12: Negative); b. HRCA base mismatch specific detection diagram
              (M: DL 500 DNA Marker; Lane 1: Target ssDNA; Lane 2: S1; Lane 3: S2; Lane 4: S3; Lane 5: Negative).


                 a)    M 1  2  3  4  M  5  6  7  8  M 9  10  11 12  b)    M  1  2   M  3  4   M  5  6
                  长度/bp                                             长度/bp
                  Length                                            Length
                     500
                     400                                              500
                     300                                              400
                     200
                     150                                              300
                     100                                              200
                     50                                               150
                                                                      100
                                                                       50


                                           图 8    HRCA  技术的重复性(a)与稳定性(b)
                                          Fig. 8    Repeatability (a) and stability (b) of HRCA
                  注:a. HRCA  技术重复性分析(M:DL 500 DNA Marker;泳道       1~4:操作人员    1;泳道  5~8:操作人员    2;泳道   9~12:
              操作人员    3;泳道  4、8、12:阴性) 。b. HRCA    技术稳定性分析(M:DL 500 DNA Marker;泳道        1:24 h;泳道  3:48 h;
              泳道  5:72 h;泳道  2、4、6:阴性) 。
                  Notes:  a.  HRCA  repeatability  analysis  (M:  DL  500  DNA  Marker;  Lane  1−4:  Operator  1;  Lane  5−8:  Operator  2;  Lane  9−12:
              Operator 3; Lane 4, 8, 12: Negative). b. HRCA stability analysis (M: DL 500 DNA Marker; Lane 1: 24 h; Lane 3: 48 h; Lane 5: 72 h;
              Lane 2, 4, 6: Negative).
               2.6.2 qPCR  技术对实际样本的检测                          R 为 2  0.997 2(图  10b) 。qPCR  技术的扩增效率为
                  如图   10a 所示,用    qPCR  技术对提取的中华绒             95.45%,熔解曲线均一性良好,如图             10c 所示。
              螯蟹肝胰腺      DNA  进行检测,DNA        模板浓度设置               采用  HRCA  技术和    qPCR  技术分别对随机抽
                                 2
                                                   0
                                          1
                       3
              为  4.13×10 、4.13×10 、4.13×10 、4.13×10 、4.13×     取的  80  只中华绒螯蟹肝胰腺         DNA  进行检测,结
              10 、4.13×10 、4.13×10  pg/μL,其中      4.13×10 、    果如表   5  所示,HRCA    技术共检测出      45  只为病蟹,
                                    −3
                −1
                                                         3
                          −2
                     2
                                        0
                                                 −1
                              1
              4.13×10 、4.13×10 、4.13×10 、4.13×10  pg/μL  均     检出率为    56.25%,与   qPCR  技术检测结果一致。
              能检测到荧光信号。当             DNA  模板浓度为       4.13×
                                                                3 讨论
                −1
              10  pg/μL  时,仍然能够检测到“S”型扩增曲线且              Ct
              值接近    30。对该   DNA  模板的浓度和反应循环数作                  3.1 HRCA  检测方法的优势
              图,呈现出良好的线性关系:y=−3.436 13x+38.119 90,                 分子生物学的核酸检测技术具有诸多优点,如
   143   144   145   146   147   148   149   150   151   152   153