Page 40 - 《渔业研究》2025年第3期
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第 3 期 吴隐生等: 基于 RAA-LbCas12a 技术的有毒(害)赤潮快速检测产品应用效果评估 297
LbCas12a 未能在检测样品中发现靶标物种 DNA, 载体(TaKaRa ) ,构建重组质粒,并转化至感受
因此未能激活报告基团显色,结果判定为阴性。 态大肠杆菌细胞中。随机挑选了 55 个克隆,送往
3)无效:若检测线与质控线位置均未出现红色条 生工生物工程(上海)有限公司进行测序。测序结
带,提示检测过程中可能操作不当或试纸条已失 果通过 NCBI 数据库(National Center for Biotech-
效,建议重新进行检测。 nology Information, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)
1.4 胶体金免疫层析检测流程 进行 BLAST 比对分析。序列比对及手动调整使用
基于胶体金免疫技术的赤潮快速检测试纸条由 MEGA 11.0 软件完成,并采用邻接法(Neighbor-
厦门大学 Fang 等 [12-13] 、Li 等 [14] 制备并提供。在检 joining,NJ)进行系统发育分析,进行 1 000 次
测过程中,首先将待测水样充分混匀,然后吸取 bootstrap 重复抽样,以评估分支支持度。
60 μL 样品,无需预处理,直接滴加到试纸条的样 1.5.4 连江赤潮水样 RAA-LbCas12a 检测
品垫上。在 5~10 min 内,根据检测线和质控线是 赤潮水样混匀后,按照 1.2 所示方法,取 50 mL
否出现红色条带进行结果判读。具体判读标准如 样品进行检测。同时,将 1 mL 靶标藻种培养物
下:若质控线和检测线均在 10 min 内出现红色条 (500 个/mL)加入到 49 mL 样品中,以制备靶细
带,则结果为阳性,表明样品中赤潮藻浓度高于检 胞浓度为 10 个/mL 的阳性加标对照样本。对于
测限;若仅质控线出现红色条带而检测线不显色, RAA-LbCas12a 检测的阴性对照实验,则以无酶水
则结果为阴性,表明样品中赤潮藻浓度低于检测限 代替 DNA 模板进行检测。
或不存在相应藻类;若质控线未显色,则表明试纸 1.6 RAA-LbCas12a 分子快检的试点应用
条无效,需重新进行检测。 为评估 RAA-LbCas12a 方法在实际应用中的综
1.5 基于现场赤潮样品的产品验证 合性能,本研究于 2024 年 4 月 10 日至 2024 年 6 月
1.5.1 现场赤潮样品采集 15 日,在连江黄歧湾(26.317449°N、119.821438°E)
和 平 潭 桃 澳 底 澳 ( 25.635253°N、 119.748664°E)
为评估 RAA-LbCas12a 在化学组分和生物组分
(图 3)开展了为期 65 d 的赤潮藻种分子快检试点
更加复杂的赤潮水样中的性能,本研究于 2024 年
应用。按照 1.2 和 1.3 的方法,分别对水样进行
5 月 20 日从福建省连江县采集了赤潮样品,并进
RAA-LbCas12a 检测、胶体金免疫层析检测以及显
行了 RAA-LbCas12a 检测。为验证该方法对赤潮水
微镜观察。
样的检测准确性,本研究同时采用光学显微镜对样
N
品进行了鉴定与计数,获得了水样中优势物种的图
像信息与生物密度数据。此外,还对赤潮水样的基
因组 DNA 进行了测序和系统发育分析,以确认靶 Huangqi Bay, Lianjiang
标藻种及其他藻种的存在情况。
26.2°
1.5.2 显微镜观察
藻细胞计数采用显微镜结合浮游生物计数框进
行。取 1 mL 样品,加入 10 μL 鲁格试剂(0.602 mol/L
KI;10% CH COOH;0.197 mol/L I)以固定藻细 26.0°
3
胞,并在光学显微镜(Leica,DMi1)下观察、计
数和拍摄图像。当浮游生物浓度较低时,通过截留
法从 250 mL 现场样品中富集浮游生物,并将其洗
脱至 50 mL 人工海水中。将浓缩后的 1 mL 样品转
25.8°
移至浮游生物计数框,在光学显微镜下分别以
100 倍和 400 倍放大倍率进行细胞观察。
1.5.3 分子克隆分析
Tao’aodi’ao Bay, Pingtan
将赤潮样品中的细胞富集于聚碳酸酯薄膜滤膜
25.6°
上,按照 CTAB 法提取样本 DNA。随后,使用通 119.5° 119.6° 119.7° 119.8° 119.9° 120.0° 120.1° E
用引物 18ScomF-3end 和 com28R1 扩增包含 ITS1/ 图 3 连江黄歧湾和平潭桃澳底澳采样站位图
5.8S/ITS2 以及部分 SSU 和 LSU rDNA 的 DNA 片 Fig. 3 Geographic distribution of sampling stations in
段(约 1.5 kb) [15] 。PCR 产物连接至 pMD™ 19-T Huangqi Bay of Lianjiang and Tao’aodi’ao Bay of Pingtan