Page 210 - 《水产学报》2025年第11期
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葛辉,等                                                                 水产学报, 2025, 49(11): 119417

              加入灭菌      PBS,在研磨机中进行组织研磨。为                               bp    M        1       2
              了释放细菌核酸,将悬浮液在                   95 °C  下加热
                                                                      2 000
              10 min。离心后收集上清液作为处理后的真实
              样本,取适量样本进行              RPA  扩增和     CRISPR/            1 000
              Cas12a 检测以及核酸试纸检测。反应结束后,                                 750
              在凝胶成像仪蓝色          LED  的照射下进行目视观察,                       500
              观察后将溶液置于          96  孔板中,以便使用多功能
              酶标仪进行数据的量化。                                              250
                   PCR  检测通常被认为是当前核酸检测方法
              的金标准,因此,需同时进行相关实验对照验
                                                                       100
              证。具体方法:取待测样本研磨后的上清液
              1 μL,PCR   正向引物     1 μL,PCR  反向引物     1 μL,
                                                                    图 1    沙氏弧菌  RPA  产物和  PCR  产物的
              无菌水    10 μL,然后加入       10 μL  的  2×Taq Master
                                                                             琼脂糖凝胶电泳图
              Mix,在    PCR  管中混匀,根据        PCR  仪设置好相
                                                               M. DL2000 DNA marker,1. PRA  等温扩增产物,2. PCR  扩增产物。
              关参数进行       PCR  扩增,扩增后的样本进行琼脂
                                                               Fig. 1 Agarose gel electrophoresis of PCR products and
              糖凝胶电泳检测,与酶标仪荧光强度的测量结
                                                                          RPA products of V. chagasii
              果和核酸试纸条的显色情况作对比。
                                                               M. DL2000 DNA marker, 1. PRA isothermal amplification product, 2.
                   本研究获得了福建省水产研究所实验动物
                                                               PCR amplification product.
              管理和使用伦理委员会批准                (FRIF21-2503-01),
                                                               拍摄的荧光信号照片          (图  2-a) 以及各检测组的相
              实验过程中操作人员严格遵守福建省水产研究
                                                               对荧光强度的量化柱状图             (图  2-b),上述结果均
              所伦理规范,并按照福建省水产研究所伦理委
                                                               表明,只有沙氏弧菌样本能够激活                  Cas12a 的切
              员会制定的规章制度执行。
                                                               割活性,产生显著的荧光信号增强。基于                  CRISPR/
               2    结果                                         Cas12a 系统的试纸检测法的检测结果同样支持
                                                               了上述发现,仅沙氏弧菌组显示出了清晰的检
               2.1    引物和  crRNA  的可行性验证                       测线   T  信号  (图  3)。值得注意的是,这种特异
                                                               性识别源于所设计的            crRNA  序列与沙氏弧菌
                   实验基于沙氏弧菌的           toxR  基因序列,分别
                                                               toxR  基因序列之间的高度匹配性,确保了检测
              设 计 了   RPA  引 物 和   PCR  引 物 。 通 过   RPA  和
                                                               体系在针对沙氏弧菌检测中的有效性和准确性。
              PCR  扩增目的基因,获得了大小分别为                   156  和
                                                               综上所述,本研究通过荧光检测和试纸条检测
              165 bp  的特异性条带      (图  1),验证了引物的可行
              性和特异性。根据设计的               crRNA  位点,利用           2  种方法,从不同角度证实了所构建检测体系
                                                               对沙氏弧菌具有高度的特异性识别能力。这种
              CRISPR/Cas12a 系统对     RPA  扩增的阳性产物进
                                                               特异性不仅体现在显著的荧光信号差异上,也
              行检测。荧光法和试纸条法的检测结果均显示
              清晰的阳性信号,进一步证实了                 crRNA  的有效        通过试纸条检测得到了直观验证,为后续的实
              性和检测体系的可靠性。                                      际应用奠定了可靠的基础。

               2.2    特异性分析                                     2.3    CRISPR/Cas12a  检测反应条件的优化
                   为了深入评估所构建检测体系的特异性,                              首先对荧光检测体系中的报告探针浓度进
              实验通过在       PBS  阴性对照    (NC)、沙氏弧菌、副             行了优化。随着报告探针浓度的增加,阳性样
              溶血性弧菌、溶藻弧菌、哈维氏弧菌、坎氏弧                             品和阴性对照组的荧光强度都逐渐升高                   (图  4-a)。
              菌、溶珊瑚弧菌以及变形假单胞菌的                   RPA  扩增       通过计算相对荧光强度            (待测样品荧光强度与阴
              样本中均加入靶向          toxR  基因的   crRNA,探究检          性对照组荧光强度平均值的比值),发现不同探
              测体系对目标病原体的特异性识别能力。基于                             针浓度    (0.5、1.0、2.0、5.0  和  10.0 μmol/L) 组的
              CRISPR/Cas12a 系统的荧光检测结果,生成了                      相对荧光强度平均值分别为              6.29、9.41、13.63、
              包括   8  组检测的荧光信号照片、经凝胶成像仪                        10.68  和  10.12 (图  4-a)。随报告探针浓度增加,

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
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