Page 209 - 《水产学报》2025年第11期
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葛辉,等                                                                 水产学报, 2025, 49(11): 119417

               1.5    RPA-CRISPR/Cas12a  荧光检测                  打开反应管,将酶切产物稀释               2~20  倍。将试纸
                                                               条结合垫     (箭头端) 插入含有酶切产物稀释液
                   CRISPR/Cas12a 检 测 体 系  (20  μL): 100
                                                               (>50 μL) 的反应管,液面不得超过结合垫最上
              nmol/L Cas12a 蛋 白  10 μL, 荧 光 探 针     0.5 μL,
                                                               端,待判读区域全部浸湿,质控线                  (C  线) 显色
              30 μmol/L crRNA 0.2 μL,5×检测缓冲液         4 μL,
                                                               后,将试纸条拿出平放,直接读取检测结果,
              扩增样本     5.3 μL,总反应体系为         20 μL。对照组
                                                               10 min  内有效,10 min   后判读无效。
              将  crRNA  换成超纯水,其余均相同。每个样品
                                                                1.7    特异性实验
              平行设置      3  组。样本置于       37 ℃  培养箱中孵育
              20 min  后,在凝胶成像仪蓝色           LED  的照射下进              选用沙氏弧菌、副溶血性弧菌、溶藻弧菌、
              行目视观察,然后将溶液置于                96  孔板中,以便          哈维氏弧菌、坎氏弧菌、溶珊瑚弧菌以及变形
              使用多功能酶标仪进行数据的量化。                                 假单胞菌     7  种病原菌进行      RPA  扩增,后续分别
                                                               进 行  CRISPR/Cas12a 荧 光 检 测 以 及 核 酸 试 纸
               1.6    RPA-CRISPR/Cas12a-LFA  试纸检测
                                                               检测,以验证        crRNA  对于   CRISPR  检测沙氏
                   RPA  扩增后的产物经        CRISPR  体系酶切后,          弧菌的特异性。病原菌培养条件见表                  2。


                                                   表 2    病原菌的培养条件
                                         Tab. 2    Culture conditions of pathogenic bacteria
                   病原菌                培养基             培养温度/℃      培养时间/h            培养条件             pH范围
                pathogenic bacteria  culture medium  culture temperature  culture time  culture conditions  pH range
               沙氏弧菌          TCBS培养基或2216E液体培养基           28        24~8   振荡培养(150~200 r/min)或静置培养  7.0~8.5
               V. chagasii
               副溶血性弧菌        TCBS培养基                      30        18~24  振荡培养(200 r/min)或静置培养      7.5~8.5
               V. parahaemolyticus
               溶藻弧菌          TCBS培养基或2216E液体培养基           28        24~48  振荡培养(200 r/min)或静置培养      7.0~8.5
               V. alginolyticus
               哈维氏弧菌         TCBS培养基或2216E液体培养基           28        24~48  振荡培养(200 r/min)或静置培养      7.0~8.5
               V. harveyi
               坎氏弧菌          TCBS培养基或2216E液体培养基           28        24~48  振荡培养(150~200 r/min)或静置培养  7.0~8.5
               V. campbellii
               溶珊瑚弧菌         TCBS培养基或2216E液体培养基           28        24~48  振荡培养(200 r/min)或静置培养      7.0~8.5
               V. coralliilyticus
               变形假单胞菌        LB培养基                        30        18~24  振荡培养(200 r/min)或静置培养      7.0~7.5
               P. aeruginosa

               1.8    CRISPR/Cas12a  检测反应条件的优化                  1.9    灵敏度实验
                   报告探针是影响         CRISPR/Cas12a 荧光检测              在  28 ℃  摇床培养沙氏弧菌,制备麦氏浊
              和试纸检测的关键因素。荧光检测体系中报告                             度约为    0.5  的菌悬液,依次吸取         100 μL 菌悬液
              探针浓度的优化:将探针浓度调整为                    0.5、1.0、     于  900 μL 磷酸盐缓冲溶液        (PBS) 中,制成梯度

              2.0、 5.0  和  10.0  μmol/L, 通 过  RPA-CRISPR/      稀释液。同时分别吸取            100 μL  菌液涂布于琼脂
              Cas12a系统对浓度为        10  CFU/mL  的沙氏弧菌样           板上,于     28 ℃  培养   24 h,对不同梯度菌液进
                                    4
                                                               行计数。最后将提取的            DNA  梯度稀释溶液作为
              本进行检测,测量           37 ℃  孵育  20 min  时的荧光
                                                               模板分析     RPA-CRISPR/Cas12a 荧光法以及        LFA
              强度。试纸检测体系中报告探针的优化:为避
                                                               试纸法的检测限,并将其与              PCR  金标准的检测
              免试纸条假阳性,同时提高低浓度模板时试纸
                                                               限作对比。
              条的显色效果,进行试纸探针浓度的优化。将
              50 μL  无酶水中的报告探针终浓度调整为                   10、      1.10    真实样本的检测
              20、30、80    和  100 nmol/L,充分混匀后,将试                   实验从福建省漳州市漳浦县的养殖渔场获
              纸条结合垫浸入溶液,记录出现假阳性结果的                             得了多个福建牡蛎幼虫真实样本,其中包括健
              试纸条报告探针的浓度。                                      康牡蛎幼虫和患病牡蛎幼虫,对其消毒处理后

              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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