Page 170 - 《水产学报》2025年第11期

杨锦毅，等 水产学报, 2025, 49(11): 119314

118 118 127 128 128 135 200 171 177 179 181 183 186 186 188 198 205

交集大小/种 inclusive intersection size 100 90 95 95 96 交集大小/种 inclusive intersection size 150

100
50
50

0 63.3% 54.0% 67.9% 68.1% 78.1% 79.2% 72.2% 71.1% 71.9% 98.5% 0 73.7% 77.0% 82.5% 76.1% 71.5% 76.9% 75.6% 80.0% 77.0% 91.1%
(a) (a)
232 COⅠ−PS1
171 COⅠ−PS1 223 12S−Tele02
137 12S−Tele02 207 12S−Mifish−U
135 12S−Mifish−U 200 12S−AcMDB07
132 16S−Ac16s 196 16S−Ac16s
100 12S−AcMDB07 300 200 100 0
数据集组合方式 数据集组合方式
300 200 100 0 数据集大小/种
数据集大小/种 set composition set size set composition
set size (c) (c)
(b)
(b)
图 4 种间差异阈值为 0.01 时 5 种常用 eDNA 宏条形码
图 2 种间差异阈值为 0.03 时 5 种常用 eDNA 宏条形码
之间可识别物种重合物种数量与重叠度
之间可识别物种重合物种数量与重叠度
Fig. 4 At an interspecific distance threshold of 0.01,
(a) 各两两组合方式所重合的物种数量 (柱状图顶部) 与相似系数
(柱状图底部)，图 3 和图 4 同；(b) 各 eDNA 宏条形码可识别物种 the overlap species number and Jaccard index of
数；(c) 5 种常用 eDNA 宏条形码两两组合方式。 identifiable species can be discerned among
Fig. 2 At an interspecific distance threshold of 0.03, the five commonly used eDNA metabarcoding
the overlap species number and Jaccard index of 189 种 ， 提 高 6.0%~29.5%； 种 内 差 异 阈 值 为
identifiable species can be discerned among 0.01 时，可识别 217~238 种，提高−2.7%~21.4%。
the five commonly used eDNA metabarcoding
COI 的 PS1 与其余 4 个 eDNA 片段组合的识别
(a) each pair combination’s overlap species number(top of the histo-
能力得到较好的提高。其中种内差异阈值为
gram) and Jaccard index of identifiable species (bottom of the
0.03 时，可识别 176~180 种，提高 2.9%~80.0%；
histogram), the same as Fig. 3 and Fig. 4; (b) number of identifiable spe-
cies by each eDNA metabarcoding; (c) pair combinations of the five 种内差异阈值为 0.02 时，可识别 199~206 种，
commonly used eDNA metabarcoding. 提高 2.6%~41.1%；种内差异阈值为 0.01 时，可
150 141 142 142 154 156 156 168 识 别 242~257 0.01 的情况下，可识别覆盖的物
4.3%~31.1%。 阈 值 为
种 ， 提 高
和
0.03、0.02
交集大小/种 inclusive intersection size 100 131 131 131 种数量最多的均为 个 12S-Tele02 & COI-PS1，分
别为
种。
180、206、257
片段组合的识别能
进一步对
eDNA
3~5
50
种
73.6%
71.6%
75.1%
70.9%
71.6%
0.03
时，5
宏条形码最多可识别
183
eDNA
0
(a) 75.1% 75.9% 75.9% 74.8% 100% 力进行统计。种内差异阈值为 种；种内差异
194 COⅠ−PS1 阈值为 0.02 时，5 个 eDNA 宏条形码最多可识
168 12S−Tele02
168 12S−Mifish−U 别 212 种；种内差异阈值为 0.01 时，5 个 eDNA
163 16S−Ac16s
146 12S−AcMDB07
300 200 100 0 数据集组合方式 宏条形码最多可识别 264 种。3 个或 4 个片段
数据集大小/种 set composition 组合的识别数量则稍有减少，但与 12S-Tele02
set size
(c) 组合比较，识别数增加不明显。
(b) & COI-PS1
图 3 种间差异阈值为 0.02 时 5 种常用 eDNA 宏条形码 3 讨论
之间可识别物种重合物种数量与重叠度
Fig. 3 At an interspecific distance threshold of 0.02, 本研究选择的 eDNA 片段来源于长江鱼类
the overlap species number and Jaccard index of 或当前没有显示与长江鱼类群体遗传差异的鱼
identifiable species can be discerned among
类，数量占长江有记录鱼类的 72.2%，有较好
the five commonly used eDNA metabarcoding
的代表性。基于遗传距离不同阈值下的物种识
https://www.china-fishery.cn 中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries
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