Page 168 - 《水产学报》2025年第11期

杨锦毅，等 水产学报, 2025, 49(11): 119314

0.7
0.6

0.5

遗传距离 genetic distance 0.4 科间遗传距离

genetic distance between families
0.3
属间遗传距离
genetic distance between genera
种间遗传距离
0.2 interspecies genetic distance
0.1

0
Ac16s 科间 Ac16s 属间 Ac16s 种间 AcMDB07 科间 AcMDB07 属间 AcMDB07 种间 Mifish-U 科间 Mifish-U 属间 Mifish-U 种间 PS1 科间 PS1 属间 PS1 种间 Tele02 科间 Tele02 属间 Tele02 种间

5种基因不同处理组
5 different genetic treatment groups
图 1 5 种常用 eDNA 宏条形码片段的科、属、种间遗传距离箱型图
Fig. 1 Boxplot of genetic distance among families, genera, and species of
5 commonly used eDNA Metabarcode fragments

表 2 5 个 eDNA 条形码在种间差异阈值为 0.03、0.02、0.01 时长江鱼类种类鉴别数量及比例
Tab. 2 Number and proportion of Yangtze River fish species classified to the species level by
five eDNA metabarcoding fragments at interspecific distance thresholds of 0.03, 0.02, and 0.01
可识别种类数 distinguishable species number 分辨率/% resolution rates
引物
primer code 阈值：0.03 阈值：0.02 阈值：0.01 阈值：0.03 阈值：0.02 阈值：0.01
threshold: 0.03 threshold: 0.02 threshold: 0.01 threshold: 0.03 threshold: 0.02 threshold: 0.01
AcMDB07 100 146 200 31.25 45.63 62.50
Mifish-U 135 168 207 42.19 52.50 64.69
Tele02 137 168 223 42.81 52.50 69.69
Ac16s 132 163 196 41.25 50.94 61.25
PS1 171 194 232 53.44 60.63 72.50
腹鱼属、新银鱼属、鳜属、鮠属、纹胸鮡属、 鲤属、鲂属、小鳔鮈属、叶须鱼属、裂腹鱼属、
东方鲀属。 新银鱼属、鮠属 (表 3)。
遗 传 距 离 0.02 为 种 间 差 异 阈 值 时 ， 遗 传 距 离 0.01 为 种 间 差 异 阈 值 时 ，
AcMDB07 能够将 146 个物种识别到种，识别率 AcMDB07 能够将 200 个物种识别到种，识别率
为 45.63%。Mifish-U 可将 168 个物种识别到种， 为 62.50%。Mifish-U 可将 207 个物种识别到种，
识别率为 52.50%。Tele02 可将 168 个物种识别 识别率为 64.69%。Tele02 可将 223 个物种识别
到种，识别率为 52.50%。Ac16s 可将 163 个物 到种，识别率为 69.69%。Ac16s 可将 196 个物
种识别到种，识别率为 50.94%。PS1 可将 194 种识别到种，识别率为 61.25%。PS1 可将 232
个识别到种，识别率为 60.63%。5 种片段均不 个物种识别到种，识别率为 72.50%。5 种片段
能识别的属有 9 个，分别是金沙鳅属、沙鳅属、 均不能识别的属有 3 个，分别是金沙鳅属、新

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