Page 223 - 《水产学报》2023年第1期
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刘绵宇,等 水产学报, 2023, 47(1): 019417
主成分 2 (6.4% 贡献率) PC2 (6.4% contribution rate) 0.1 0 population
群体
EE
PP
SS
−0.1
−0.10 −0.05 0 0.05 0.10
主成分 1 (15.6% 贡献率)
PC1 (15.6% contribution rate)
图 3 凡纳滨对虾 3 个群体 146 尾个体的主成分分析
Fig. 3 The principal component analysis of the 146 individuals in three populations of L. vannamei
1.00
0.75
0.50 str.2.Q K=2
0.25
0
1.00
0.75
0.50 str.3.Q K=3
0.25
0
1.00
0.75
0.50 str.4.Q K=4
0.25
0
1.00
0.75
0.50 str.5.Q K=5
0.25
0
1.00
0.75
0.50 str.6.Q K=6
0.25
0
EE261 EE280 EE310 EE314 EE318 EE399 EE411 EE087 EE432 EE436 EE442 EE448 EE093 EE477 EE478 EE570 EE579 EE636 EE111 EE666 EE667 EE687 EE133 EE179 EE192 EE198 EE512 EE219 EE231 EE241 EE604 EE623 EE051 EE069 EE053 EE492 EE097 EE113 EE127 EE058 EE169 EE171 EE067 EE253 EE080 EE089 EE091 EE099 EE100 EE055 EE708 EE125 EE731 EE155 EE158 EE159 EE059 EE184 EE194 EE209 EE211 EE255 EE421 EE673 EE67
EE PP SS Group
图 4 凡纳滨对虾 3 个群体 146 尾个体的遗传结构
Fig. 4 The population structure of the 146 individuals in three populations of L. vannamei
挖掘 SNP 标记 320 个,并成功区分了 4 个罗氏沼 及其子代的亲缘关系。
虾 (Macrobrachium rosenbergii) 群体;Larson 等 [23] 育种基础群体的遗传多样性越丰富,获得的
通过 RAD 测序技术获得了 10 944 个 SNP 标记, 遗传增益越大,育种项目的可持续性越强。本研
对 5 个大鳞大麻哈鱼 (Oncorhynchus tshawytscha) 群 究中 3 个群体的 H 范围为 0.25~0.29,PIC 范围
o
体进行划分的准确率均大于 90%;Massault 等 [24] 为 0.20~0.23,多态性较低 (PIC < 0.25) 。申淑慧
[17]
开发了用于大珠母贝 (Pinctada maxima) 亲子鉴定 等 [26] 利用 24 个位于生长和抗逆功能基因上的
的 SNP 芯片,准确鉴定出 79 个全同胞家系及其 SNP 标记分析了凡纳滨对虾野生和选育群体共计
父母本;Arbon 等 [25] 开发了澳大利亚绿边鲍 (Hali- 120 尾虾的遗传多样性,其中 2 个野生群体的
otis laevigata) 的 SNP 面板,重构了 16 个候选亲本 PIC 值分别为 0.258 7 和 0.276 2,略高于本研究结
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