Page 222 - 《水产学报》2023年第1期

刘绵宇，等 水产学报, 2023, 47(1): 019417

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EE-A01-032
SS-A28-131
SS-A28-137
EE-A01-001
SS-A28-122
SS-A28-123 PP-A25-096
SS-A28-125 PP-A25-096
SS-A28-128 PP-A25-092
SS-A28-133 PP-A23-106
SS-A28-130
SS-A29-124 PP-A25-105
SS-A29-142 PP-A23-083
PP-A23-109
SS-A29-127 PP-A21-119
SS-A29-139 SS-A31-143 PP-A24-084 PP-A18-073
SS-A29-141
SS-A31-129
PP-A21-089
SS-A31-132
PP-A21-116
SS-A31-146
PP-A21-080
SS-A31-134
SS-A31-136
PP-A22-081
SS-A31-144
PP-A24-095
SS-A30-126
PP-A24-118
SS-A30-135
PP-A24-100
PP-A15-067
PP-A24-110
PP-A15-070
PP-A15-071
PP-A17-115
PP-A15-104
PP-A17-069
PP-A26-093
PP-A18-111
PP-A18-076
PP-A19-098
PP-A19-088
PP-A19-103
SS-A30-138 PP-A15-102 PP-A15-079 PP-A15-077 PP-A15-087 PP-A15-117 PP-A20-075 PP-A20-082 PP-A20-090 PP-A20-120 PP-A16-068 PP-A16-072 PP-A16-091 PP-A16-101 PP-A16-078 PP-A16-107 PP-A16-113 PP-A16-114 PP-A27-108 PP-A19-074 PP-A19-086 PP-A19-085 PP-A19-097 PP-A18-112 PP-A26-099
图 2 凡纳滨对虾 3 个群体 146 尾个体的系统进化树
图中编号含义，以 PP-A15-071 为例，PP 为群体编号，A15 为家系编号，071 为个体编号
Fig. 2 The phylogenetic tree of the 146 individuals in three populations of L. vannamei
0.11，均为中度遗传分化；PP 群体和 SS 群体间 3 讨论
F 为 s t 0.21，遗传分化程度更大。
基因组亲缘关系与近交系数 EE、PP 和 奠基者群体的遗传背景分析对于构建育种基
础群体具有重要的意义。奠基者群体间的分化程
SS 群体的基因组近交系数均值分别为−0.05±0.06、
度越清晰，奠基者个体间的亲缘关系越明确，越
0.20±0.09 和 0.37±0.07，后两个群体内部分个体表
有利于设计优化的基础群体构建方案。在本研究
现出较高的近交水平。EE、PP 和 SS 群体内个体
中，利用液相芯片“黄海芯 1 号”提供的 38 148 个
基 因 组 近 交 系 数 的 变 异 系 数 分 别 为 −112.25%、
高质量 SNP 标记调查 3 个引进群体的遗传背景，
19.79% 和 44.88% (图 5)。EE、PP 和 SS 群体个体
其中系统进化分析和 PCA 分析将 146 尾个体划分
间的亲缘系数均值分别为 0.099±0.11、0.26±0.14、
为 3 个组，划分结果与实际引种来源高度一致。
0.47±0.20，后两个群体内个体间的亲缘关系更近
群体间的 F 系数也表明，3 个群体间存在中高度
t
(图 6)。因此在构建下一代家系时，应根据基因组 s
遗传分化。在系统进化树中，群体内同一个家系
亲缘关系矩阵设计优化方案，避免后代的近交水
的个体首先聚在一起，进而相同群体的不同家系
平进一步提升。
聚在一起。上述结果表明，可以利用 3 个奠基者
2.3 方差组分和遗传力 群体设计双列杂交方案，同时避免群体内个体间
利 用 pBLUP-GG 和 ssGBLUP-MF 模 型 ， 获 的近亲交配，构建一个遗传变异更为丰富的育种
得个体存活状态的加性遗传方差分别 0.38±0.14 基础群体。利用基因组信息，即使在奠基者个体
和 0.47±0.17， 遗 传 力 分 别 为 0.20±0.06 和 0.24± 遗传背景未知的情况下，仍然可以准确地查清个
0.07 (表 3)。相较于 pBLUP-GG 模型，利用 ssGB- 体间的亲缘关系，并对其进行群体划分，用于指
LUP-MF 模型获得的遗传力估计值更高。 导育种基础群体构建。Agarwal 等 [22] 通过转录组
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