Page 221 - 《水产学报》2023年第1期

刘绵宇，等 水产学报, 2023, 47(1): 019417

息的亲缘关系矩阵； e ijk 表示第 尾虾的随机残差， 态分布的最高点的纵坐标 。
[21]
k
¡
¢
2
2
e » 0;I¾ ，其中， ¾ 是残差方差， 是单位矩阵。
I
a
e
使用 ASReml-R V4.1 包的 ainverse 函数，生成包 2 结果
[20]
含遗传组的 A 矩阵 。利用 creatHmf 软件生成包
2.1 描述性统计
含元奠基者的 H 矩阵，计算前要求所有标记等位
基因频率的平均值为 0.5 。 Vp AHPN D 侵染共测试 930 尾虾，其中存活个
[6]
根据以下公式计算基于潜在变量的存活性状 体 466 尾，3 个群体存活率均值范围为 44.50%~
遗传力 h ( 2 u )： 57.40%，其中 PP 群体存活率最高为 57.40%，高
出 EE 群体 12.90%，高出 SS 群体 11.60%。EE 与
2
4¾ sd
2
h = SS 群体存活率相似，分别为 44.50% 和 45.80%。
u 2 2
2¾ + ¾
sd e
最小存活率 (13.30%) 家系出现在 EE 群体中，最
使用如下公式将其转换为基于观察值尺度的
大存活率 (76.70%) 家系出现在 EE 与 PP 群体中
2 [21]
遗传力 h ( ) ：
p (表 1)。不同群体内家系存活率变异系数范围为
z 2 27.23%~42.01%，其中 EE 群体的变化幅度最大，
2
2
h = h
p u
p(1 ¡ p) 群体的变化幅度最小。全部群体内家系存活率
PP
式中，p 是存活个体在全部个体中的比例，z 是正 变异系数为 34.93% (图 1)。
表 1 凡纳滨对虾不同群体存活率的描述性统计参数
Tab. 1 Descriptive statistical parameters of survival rate of different populations in L. vannamei
家系存活率
群体 存活个体数 存活率/% family survival rate
population number survival rate 家系个数 最小值/% 最大值/% 标准差/% 变异系数/%
number of families minimum maximum sd cv
EE群体 population 187 44.50 14 13.30 76.70 0.19 42.01
PP群体 population 224 57.40 13 26.70 76.70 0.16 27.23
SS群体 population 55 45.80 4 33.30 60.00 0.13 28.09
全部 total 466 50.10 31 13.30 76.70 0.18 34.93
0.8 的个体首先聚在一起；然后 PP 群体聚为一类，
EE 群体聚为一类，SS 群体聚为一类 (图 2)。这表
明通过 SNP 分型信息可以清晰地分辨出来源于不
0.6
同群体的个体。通过主成分再次分析个体间的亲
家系存活率 family survival rate 0.4 缘关系，可以将 146 尾个体分别确定为对应的 3
个类群 (图
3)。
群体结构分析 凡纳滨对虾
146
尾对虾个体的遗传结构如图 4 所示。当 3 个群体 时，
K = 2
0.2
不能明确对虾间的遗传背景，而当 K = 3 时，对
虾的遗传背景与系统进化和主成分分析的结果相
EE PP SS
符，3 个群体具有不同的遗传背景，呈现出较为
群体
population 明显的分化。当 K = 4 时，EE 群体内出现不同的
图 1 凡纳滨对虾 3 个群体内家系存活率箱线图 遗传背景，并在 K = 5 时遗传背景更加驳杂。
遗传多样性参数统计 3 个群体的 H 、H 、
Fig. 1 Box plots of survival rate of families in three o e
和 等遗传多样性统计参数见表
populations of L. vannamei PIC 2。其中，PP
群体的估计值最高，EE 群体次之，SS 群体最小。
2.2 遗传背景分析
单因素方差分析表明，不同群体间的差异达到极
系统进化与主成分分析 凡纳滨对虾 3 个 显著水平 (P < 0.01)。EE 群体和 SS 群体间遗传分
群体 146 尾个体的系统进化树显示，不同家系内 化系数 (F ) 为 0.13，EE 群体和 PP 群体间 F 为
t
st s
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