Page 134 - 《中国药科大学学报》2026年第1期
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               外的   C–O/C–C  键形成,还是与另一个          P450 酶功能       的交联反应。这些例子表明              P450 酶具有多功能催
               相同、互为备份?对此,德国法兰克福大学                   Helfrich   化潜力。
               教授团队通过        laurentirubin(图  7-D)的生物合成基             Cittilins 类  RiPP  通常包含  3 个  Tyr 间(或  2 个
               因的共表达及缺失实验证实,P450 酶                1 负责催化        Tyr 和  1 个  Trp 间)的交联,包括      C–C  交联和   C–O
                                                                    [37]
               Trp1-Trp4 之 间 的   C–C  键 及  Trp4-主 链  N  之 间     交联 (图     8)。P450 酶  CitB  在前体肽   CitA  中安装
               C–N  键的形成(第Ⅲ类特征),而            P450 酶  2 则特异      Tyr1-Tyr3 间的  C–C  交联,以及    Tyr3-Tyr4 间的  C–O
               性催化新增的         C–O  交联,进一步通过前体肽与                 交联,产生      cittilin B。随后,在甲基转移酶          CitC
               P450 基因簇组合表达实验发现:仅              P450 酶  1 与前     的作用下,Tyr1 羟基发生甲基化,产生                 cittilin A。
               体肽共表达即生成三重交联产物,而                  P450 酶  2 的    与  cittilin A/B  中的  YIYY  基序类似,netropepsin [44]
               修饰严格依赖于         P450 酶  1 的修饰 。戈惠明教授             中 含 有   YSYY  的 核 心 肽 序 列 , 但    netropepsin 在
                                              [43]
               团 队 在 对    tsukirubin 和  olivorubin( 图  7-D) 基 因  Tyr1-Tyr3 间 形 成  C–O  交 联 , 而 在  Tyr3-Tyr4 间
               簇的研究中观察到类似现象               [36] 。值得注意的是,         形成   C–C  交联。与此不同的是,shandoamide 和
               spectabin (图  7-B)在第Ⅱ类产物的基础上含有额                  syrinamide A/B  包含  2 个  Tyr 和  1 个  Trp 的交联,
                       [44]
               外的   Tyr-Tyr 间  C–O  交联,但其生物合成基因簇                在  Tyr1-Tyr3 之间形成     C–C  交联,Tyr3-Tyr4 间形
               (BGC)内仅含有一个         P450 酶,即单个    P450 酶催化       成  C–O–C  交联。这些结构共同展示了环芳基交联
               了侧链-主链      C–N  键、侧链    C–N  键和侧链     C–O  键    的复杂性和灵活性。


                             O  HO                       OH  OH                            OH
                                     O                            O                    O      HO


                                                        N
                      H 2 N  H  O     H          H 2 N  H  O     H           H 2 N  H  O     H
                                      N
                                                                 N
                                                                                    N
                                                                                             N
                             N
                                                             H
                          O      N   O   COOH        O       N  O     OH        O       N  O      OH
                                 H
                                                                                        H
                                                                   O
                                                                                   HO          O
                               Cittilin A               Cittilin B                   Netropepsin
                               OH                                                     OH
                                  OH                                                     OH
                                     O                    OH  OH                             O
                                             NH                 O                                   NH
                        O     O       H                                 NH     O      O       H
                          N     O     N            O      O       H               N     O     N
                          H HN                                    N               H HN
                                  NH O    O          N      O                             NH O    O
                                       HN            H HN                                     HN
                                 OH  O                        NH O HN  O                    O
                                                                O
                                      NH                                                      NH
                                                                 OH
                                 HO   O                                                  HO   O
                               Shandoamide              Syrinamide A                  Syrinamide B
               图 8    Cittilins 类  RiPP  的各种结构

                                                                                                [47]
                4    环芳基交联酶的催化多样性和底物耐受性                         耐受性,并揭示交联形成的基本规律 。结果表明,
                                                                DarE  受底物控制,C–O–C      和  C–C  交联的形成由交
                4.1    环芳基交联   rSAM  酶的催化多样性和底物耐                联残基的性质决定。例如,当              Trp3 突变成   Tyr3 时,
               受性                                               仍然可以在       Trp1 和  Tyr3 之间形成    C–O–C  交联,
                    rSAM  酶  DarE  不仅能够在     darobactin [46]  分子  以及在  Tyr3 和  Lys5 之间形成     C–C  键(darobactin
               中同时介导芳香-芳香氨基酸间                  C–O–C  交联和       衍生物    1)。当   Lys5 突变成   Phe 5,即  3 个核心位置
               芳香-非芳香氨基酸间           C–C  交联,还具有更高的底             都 是 芳 香 氨 基 酸 时 , 将 形 成      2 个  C–O–C  交 联
               物耐受性,并表现出介导更多样结构单元形成的潜                           ( darobactin 衍 生 物  2) 。 如 果 把   Trp3 突 变 成
               力(图   9)。伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校                Mithell   Arg3 时,不再形成      C–O–C  交联,而是形成        C–C  交
               团队对    darobactin 中发生交联的      Trp1、Trp3、Lys5     联(darobactin 衍生物   3)。尽管突变导致交联更加
               进行了单位点饱和突变研究,以研究                  DarE  的底物      多样和复杂,但共同的规律是:每个交联可以独立
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