Page 135 - 《中国药科大学学报》2026年第1期
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第 57 卷第 1 期 陈 青,等:核糖体肽中的环芳基交联 129
DarE ...AWNWSKSF
NH NH
NH 2
O OH O O O
O H O H O OH N
H 2 N N N N N S F NH 2 H
H O H O Darobactin衍生物1 Darobactin衍生物2
NH
O
N NH 2 NH
H
R1 R2 R3 N H 2 N NH NH 2
Darobactin H Darobactin衍生物3
NH 2 H
O OH NH O N NH O
O H O H O
H 2 N N N N N N NH 2 N H OH
H O H O S F Darobactin衍生物5 Darobactin衍生物6
NH O
O
OH NH 2 NH
NH 2
O
Darobactin衍生物4 Darobactin衍生物7 NH 2
图 9 Darobactin 及其衍生物
完成,而不互相依赖。交联的类型取决于修饰残基 基酸间介导交联,并且成键方式也常常发生变化。
的 性 质 , 芳 香 氨 基 酸 和 芳 香 氨 基 酸 之 间 形 成 Californibin、 pseudosporamide 和 micitide 等 类 似
C–O–C 交联,而芳香族和非芳香氨基酸之间形成 RiPP 的前体肽序列的 C 末端具有保守的 YPW 基
C–C 交联,这两种交联都不是形成另一种交联的先 序 , 该 类 型 RiPP 通 常 在 Tyr 和 Trp 残 基 间 形 成
决条件,并且这两种交联都可以在残基 1-残基 3 或 C–C 交联 。然而,戈惠明课题组通过异源表达 sal
[44]
残基 3-残基 5 间形成。 BGC,发现 californibin 中 Tyr 和 Trp 间并非 C–C 交
值得注意的是,当 Trp3 突变为 Tyr 时(darobactin 联,而是 C–N 交联(图 10-A)。更特殊的例子是
衍生物 1 和 4)时,不仅可以形成 Trp1-Tyr3 C–O–C olivorubin A/B,其中,负责催化 Tyr-Trp C–O 交联
交联和 Tyr3-Lys5 C–C 键(稠合双环,darobactin 衍 (olivorubin B)的 P450 酶同样可以催化 C–C 交联
生物 1),还会形成缺失 Tyr3-Lys5 C–C 交联的单环 (olivorubin A),从而产生两种具有不同交联模式的
产物,以及含有 3 位 β-氧代酪氨酸修饰的产物(无 产物(图 7-D)。
大环,darobactin 衍生物 4)。以上 3 种产物中,双环 Biarylitides 类产物具有迄今为止已知的最小
产物的丰度最低,而单环产物和 β-氧代酪氨酸产物 前体肽(仅包含 5 个氨基酸残基)。这一家族大多
的丰度分别高出 2.7 倍和 7.5 倍。此外,他们还发 数成员的前体肽具有保守的 MxYxH 基序,而最终
现多种突变产物含有 β-氧代色氨酸、β-氧代酪氨酸 产物中通常仅含 3 个氨基酸残基,在第 1 位残基与
或 β-氧代组氨酸修饰(darobactin 衍生物 4~7),支持 第 3 位残基间通常形成 C–C 交联(少数成员具有
在 C–O–C 交联形成过程中,靠近 C 端的芳香氨基 C–O/C–N 交联) (图 10-B)。荷兰阿姆斯特丹大
[48]
酸残基的 Cβ 上加氧的机制。这些现象表明,各种 学 Zdouc 等 [49] 从 Planomonospora sp. ID82291 和
产物可能都起源于初始的烷氧基自由基,该自由基 ID10708 中分别分离出 YYH 和 YFH 产物。YYH/
沿着不同的途径发展。 YFH 产 物 在 Tyr-His 之 间 含 有 C–C 交 联 , 这 是
4.2 环芳基交联 P450 酶的催化多样性和底物耐 biarylitides 类产物中最常见的交联模式。德国亥
受性 姆霍兹药物研究所 Hug 等 [33] 报道了黏细菌来源
环芳基交联 P450 酶表现出较高的催化多样性 的 biarylitides 类产物 myxarylin(MNYLH),发现其
和底物耐受性。高度同源的基因簇的产物具有 在 Tyr-His 之间形成 C–N 交联,而非 C–C 交联。
不同的成键方式的情况并不罕见。前体肽突变 Zhao 等 [50] 对 来 自 Micromonospora sp. MW-13 的
研究则表明,一些 P450 酶不仅能够在不同芳香氨 biarylitides 生 物 合 成 中 P450 酶 ( P450 ) 进 行 了
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