Page 135 - 《中国药科大学学报》2026年第1期
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第  57 卷第  1 期                      陈 青,等:核糖体肽中的环芳基交联                                       129


                            DarE ...AWNWSKSF
                                                         NH                          NH
                           NH 2
                         O            OH                    O                           O         O
                        O      H  O     H  O                         OH                     N
                    H 2 N  N   N   N    N    S F                           NH 2             H
                          H  O     H  O                   Darobactin衍生物1              Darobactin衍生物2
                            NH
                               O
                                    N         NH 2                NH
                                    H
                           R1        R2      R3          N     H 2 N  NH  NH 2
                               Darobactin                H Darobactin衍生物3


                            NH 2                                  H
                         O             OH                 NH O    N                  NH O
                         O     H  O      H  O
                     H 2 N  N  N    N    N                        N       NH 2             N H         OH
                           H  O     H  O      S F         Darobactin衍生物5              Darobactin衍生物6
                            NH  O
                                                     O
                                       OH     NH 2         NH
                                                                 NH 2
                                                                O
                            Darobactin衍生物4                Darobactin衍生物7  NH 2
               图 9    Darobactin  及其衍生物
               完成,而不互相依赖。交联的类型取决于修饰残基                           基酸间介导交联,并且成键方式也常常发生变化。
               的 性 质 , 芳 香 氨 基 酸 和 芳 香 氨 基 酸 之 间 形 成            Californibin、 pseudosporamide 和  micitide 等 类 似
               C–O–C  交联,而芳香族和非芳香氨基酸之间形成                        RiPP  的前体肽序列的        C  末端具有保守的       YPW  基
               C–C  交联,这两种交联都不是形成另一种交联的先                        序 , 该 类 型  RiPP  通 常 在  Tyr 和  Trp 残 基 间 形 成
               决条件,并且这两种交联都可以在残基                  1-残基   3 或    C–C  交联 。然而,戈惠明课题组通过异源表达                   sal
                                                                         [44]
               残基   3-残基  5 间形成。                                BGC,发现    californibin 中  Tyr 和  Trp 间并非  C–C  交
                    值得注意的是,当       Trp3 突变为  Tyr 时(darobactin   联,而是     C–N  交联(图    10-A)。更特殊的例子是
               衍生物    1 和  4)时,不仅可以形成        Trp1-Tyr3 C–O–C    olivorubin A/B,其中,负责催化       Tyr-Trp C–O  交联
               交联和    Tyr3-Lys5 C–C  键(稠合双环,darobactin 衍        (olivorubin B)的  P450 酶同样可以催化        C–C  交联
               生物   1),还会形成缺失       Tyr3-Lys5 C–C  交联的单环        (olivorubin A),从而产生两种具有不同交联模式的
               产物,以及含有        3 位  β-氧代酪氨酸修饰的产物(无               产物(图    7-D)。
               大环,darobactin 衍生物    4)。以上    3 种产物中,双环               Biarylitides 类产物具有迄今为止已知的最小
               产物的丰度最低,而单环产物和               β-氧代酪氨酸产物           前体肽(仅包含        5 个氨基酸残基)。这一家族大多
               的丰度分别高出         2.7 倍和  7.5 倍。此外,他们还发            数成员的前体肽具有保守的              MxYxH   基序,而最终
               现多种突变产物含有           β-氧代色氨酸、β-氧代酪氨酸              产物中通常仅含        3 个氨基酸残基,在第         1 位残基与
               或  β-氧代组氨酸修饰(darobactin 衍生物         4~7),支持      第  3 位残基间通常形成         C–C  交联(少数成员具有
               在  C–O–C  交联形成过程中,靠近           C  端的芳香氨基         C–O/C–N  交联) (图     10-B)。荷兰阿姆斯特丹大
                                                                               [48]
               酸残基的     Cβ  上加氧的机制。这些现象表明,各种                    学  Zdouc 等  [49]  从  Planomonospora  sp.  ID82291 和
               产物可能都起源于初始的烷氧基自由基,该自由基                           ID10708 中分别分离出       YYH  和  YFH  产物。YYH/
               沿着不同的途径发展。                                       YFH  产 物 在   Tyr-His 之 间 含 有  C–C  交 联 , 这 是
                4.2    环芳基交联   P450 酶的催化多样性和底物耐                 biarylitides 类产物中最常见的交联模式。德国亥
               受性                                               姆霍兹药物研究所           Hug 等 [33]  报道了黏细菌来源
                    环芳基交联      P450 酶表现出较高的催化多样性                的  biarylitides 类产物  myxarylin(MNYLH),发现其
               和底物耐受性。高度同源的基因簇的产物具有                             在  Tyr-His 之间形成     C–N  交联,而非     C–C  交联。
               不同的成键方式的情况并不罕见。前体肽突变                             Zhao 等  [50]  对 来 自  Micromonospora  sp.  MW-13 的
               研究则表明,一些         P450 酶不仅能够在不同芳香氨                biarylitides 生 物 合 成 中  P450 酶 ( P450 ) 进 行 了
                                                                                                   blt
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