Page 22 - 《渔业研究》2026年第3期
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第 3 期              张澳晴等: 鲤疱疹病毒        3  型  RAA-CRISPR/Cas12a  检测方法的建立                 315

               2.4 CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a 反应条件的优化            行  CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a 反应,以无    RNA  酶
                  为 进 一 步 提 高    CyHV-3  RAA-CRISPR/Cas12a     水为阴性对照,通过比较不同反应条件下最小模板
              的扩增效率,分别采用不同浓度的标准质粒(1.24×                        检出情况确定最佳反应温度和反应时间,结果如
              10 ~1.24×10  拷贝/μL)作为模板,以不同反应温度                  图  3  所示,最佳反应温度为         39 ℃,最佳反应时间
                         0
                3
              (37、39、42 ℃)和反应时间(10、20、30 min)进                 为  30 min。


                                                                 b)  1    2    3    4   NC
                                a)   1   2    3     4   NC
                               37 ℃                           10 min

                               39 ℃                           20 min



                               42 ℃                           30 min


                               图 3    不同温度和时间条件下     CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a 反应的荧光结果图
               Fig. 3    Fluorescence results of CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a reaction under different temperature and time conditions
                                                                                    3
                                                                                           0
                  注:a. 1~4  表示不同温度(37、39、42 ℃)条件下以        4  个不同拷贝数标准质粒(1.24×10  ~1.24×10 拷贝/μL)为模版的
              CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a 反应的荧光强度;b. 1~4  表示不同反应时间(10、20、30 min)条件下以           4  个不同拷贝数标准
              质粒(1.24×10 ~1.24×10 拷贝/μL)为模版的    CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a 反应的荧光强度。
                         3
                                0
                  Notes:a. 1−4 indicate the fluorescence intensity of the RAA-CRISPR/Cas12a reaction using 4 standard plasmids with different
                               3
                                      0
              copy numbers (1.24×10 −1.24×10  copies/μL) as templates under different temperature conditions (37, 39, 42 ℃); b. 1−4 indicate the
              fluorescence  results  of  the  CyHV-3  RAA-CRISPR/Cas12a  reaction  using  4  standard  plasmids  with  different  copy  numbers
                    3
                           0
              (1.24×10 −1.24×10  copies/μL) as templates under different reaction time conditions (10, 20, 30 min).

               2.5 CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a 灵敏性评价              PCR  检测,评价本实验建立方法的检测灵敏性。
                  为 评 价 建 立 的    CyHV-3  RAA-CRISPR/Cas12a     结果如图     4  所示,RAA-CRISPR/Cas12a 的检测限
                                                                        2
              方法的检测灵敏性,以不同浓度的标准质粒(1.24×                        为  1.24×10  拷贝/μL,与目前中华人民共和国出入
              10 ~1.24×10  拷贝/μL)作为模板,以无          RNA  酶水      境检验检疫行业标准(SN/T 1674—2014)推荐的
                6
                         0
              为 空 白 对 照 , 同 时 进 行     RAA-CRISPR/Cas12a 和      PCR  方法相比,检测灵敏性提高了            10  倍。

                                                 b)        CyHV-3      1.24×10 6  c)

                  a)  1  2  3  4  5  6  7 NC                           1.24×10 5 4  bp M  1  2  3  4  5  6  7
                                                                       1.24×10
               蓝光灯                             20 000                  1.24×10 3  2 000
                                                                             1 000
                LED                           荧光强度 Fluorescence  10 000  1.24×10 2 1  750
                                                                       1.24×10
                                                                       NC
               紫外光                                                     1.24×10 0  500
                                                                              250
                 UV                               0 0    10    20    30       100
                                                        时间/min Time
                                图 4    CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a 方法与 PCR 方法对灵敏性的检测结果
                         Fig. 4    Sensitivity detection results of CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a method and PCR method
                                                               6
                                                                      0
                  注:a. 1~7  表示在  470 nm  波长  LED  蓝光和  UV  光源下  1.24×10 ~1.24×10 拷贝/μL7  个不同拷贝数标准质粒为模版的  CyHV-3
              RAA-CRISPR/Cas12a 反应的荧光强度;b. CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a 荧光曲线;c. PCR   方法检测灵敏性实验结果;1~7        表
              示  1.24×10 ~1.24×10 拷贝/μL  标准质粒;M. DNA  标记  2000。
                             0
                      6
                  Notes:  a.  1−7  indicate  fluorescence  intensities  of  the  CyHV-3  RAA-CRISPR/Cas12a  assay  using  7  standard  plasmids  with
                                            0
                                     6
              different copy numbers (1.24×10 −1.24×10  copies/μL) as templates, measured under 470 nm wavelength LED blue light and UV light
              source; b. Fluorescence curves of the CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a assay; c. Results of the PCR-based sensitivity test; 1-7 indicate
                                                       0
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              standard plasmids with copy numbers of 1.24×10 –1.24×10  copies/μL; M. DNA marker 2000.
               2.6 CyHV-3 RAA-CRISPR/Cas12a 特异性评价              同源性的    CyHV-1  和  CyHV-2、临床上感染鲤和锦
                  为 评 价 建 立 的    CyHV-3  RAA-CRISPR/Cas12a     鲤常见病毒性病原         CEV  和  SVCV,以及与鲤(锦
              方法的检测特异性,选择与             CyHV-3  具有较高遗传          鲤)混养鲤形目鱼类常见病毒            GCRV-Ⅱ和    GCRV-Ⅰ
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