Page 119 - 《水产学报》2026年第04期

4 期 水 产 学 报 50 卷

通量测序。经质量控制与筛选后，共获得 5 379 758 生态习性为淡水的物种、在研究海域无自然分布
条有效序列。各样本序列数量为 (118 909 ± 7 210) 记录的物种以及根据阴性对照和低读段数 (≤5) 判
条。序列平均长度为 (184.28±7.29) bp。 定的假阳性物种，最终注释确认的海洋鱼类物种
数为 57 种 (包括未鉴定到种的平鲉属)，这些物种
2.2 物种注释统计
隶属于 11 目 33 科 49 属。其中黄河口海域鉴定鱼
经 过 去 冗 余 处 理 ， 序 列 共 生 成 286 393 个 类种数为 30 种，隶属 6 目 18 科 27 属。长江口海
ASV，其中 45 218 个 ASV 被注释到物种水平。初 域鉴定鱼类种数为 43 种，隶属 10 目 28科 38 属。
步注释获得的鱼类物种数为 315 种，为获得反映 两组共有物种数为 16 种，且长江口海域的鱼类物
研究海域真实情况的海洋鱼类名录，本实验依据 种丰富度显著高于黄河口海域 (表 1)。

Mitofish 和 FishBase 数据库等资料，依次剔除了 黄河口海域每个样本检出的物种数量 2~11

表 1 基于环境 DNA 检测到的鱼类物种
Tab. 1 Fish species detected using environmental DNA metabarcoding
黄河口 长江口
目 科 属 种
Yellow River Yangtze River
order family genus species
Estuary Estuary
鮟鱇目 Lophiiformes 鮟鱇科 Lophiidae 鮟鱇属 Lophius 黄鮟鱇 L. litulon + +
灯笼鱼目 Myctophiformes 灯笼鱼科 Myctophidae 底灯鱼属 Benthosema 七星底灯鱼 B. pterotum +
鲽形目 Pleuronectiformes 鲽科 Pleuronectidae 高眼鲽属 Cleisthenes 高眼鲽 C. herzensteini +
黄盖鲽属 Pseudopleuronectes 尖吻黄盖鲽 P. herzensteini +
钝吻黄盖鲽 P. yokohamae +
石鲽属 Kareius 石鲽 K. bicoloratus +
舌鳎科 Cynoglossidae 舌鳎属 Cynoglossus 短吻红舌鳎 C. joyneri +
半滑舌鳎 C. semilaevis +
鲱形目 Clupeiformes 鲱科 Clupeidae 斑鰶属 Konosirus 斑鰶 K. punctatus +
花鰶属 Clupanodon 花鰶 C. thrissa +
小沙丁鱼属 Sardinella 青鳞小沙丁鱼 S. zunasi + +
隆背小沙丁鱼 S. gibbosa +
锯腹鳓科 Pristigasteridae 鳓属 Ilisha 鳓 I. elongata +
鳀科 Engraulidae 黄鲫属 Setipinna 黄鲫 S. taty +
鲚属 Coilia 凤鲚 C. mystus + +
棱鳀属 Thryssa 赤鼻棱鳀 T. kammalensis + +
鳀属 Engraulis 鳀 E. japonicus +
钩鱼目 Kurtiformes 天竺鲷科 Apogonidae 银口天竺鲷属 Jaydia 细条银口天竺鲷 J. lineata +
黑边银口天竺鲷 J. truncata +
鹦天竺鲷属 Ostorhinchus 中线鹦天竺鲷 O. kiensis +
颌针鱼目 Beloniformes 飞鱼科 Exocoetidae 拟飞鱼属 Parexocoetus 短鳍拟飞鱼 P. brachypterus +
长颌拟飞鱼 P. mento +
鱵科 Hemiramphidae 下鱵鱼属 Hyporhamphus 日本下鱵鱼 H. sajori +
鲈形目 Perciformes 鲳科 Stromateidae 鲳属 Pampus 银鲳 P. argenteus + +
带鱼科 Trichiuridae 沙带鱼属 Lepturacanthus 沙带鱼 L. savala + +
鲷科 Sparidae 棘鲷属 Acanthopagrus 黄鳍棘鲷 A. latus +
黑棘鲷 A. schlegelii +
金钱鱼科 Scatophagidae 金钱鱼属 Scatophagus 金钱鱼 S. argus +
锦鳚科 Pholidae 云鳚属 Pholis 方氏云鳚 P. fangi +

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