Page 117 - 《水产学报》2026年第04期

4 期 水 产 学 报 50 卷

高通量筛查。相较于传统方法，eDNA 技术对稀 大河口区域鱼类群落的物种组成与多样性特征；
有物种和早期生命阶段的检测灵敏度更高，采样 (2) 评估标准化 eDNA 技术在我国典型河口渔业资
更简便且易于标准化 [5-7] ，为河口等复杂生境的生 源调查中的适用性与数据可比性。本研究旨在为
物多样性监测，尤其是标准化跨区域比较，提供 两大河口的渔业资源评估提供基于新方法的可比
了新的解决方案。近年来，针对鱼类线粒体 12S 性本底数据，并为 eDNA 技术在我国近海生物多
[8]
rRNA 等基因区域设计的通用引物 与高通量测序 样性常规监测与跨区域协同调查中的标准化应用
结合，已在实证研究中广泛应用，证实了 eDNA 提供关键案例参考。
方法在鱼类物种鉴定、群落组成分析及与传统拖
1 材料与方法
网数据关联方面的可靠性与潜力 [7-8] 。然而，该领
域内也面临一些共性的挑战：参考数据库的不完
1.1 研究区域与样本采集
整可能影响物种鉴定的准确性和分辨率；eDNA
的产生、运输与降解动态复杂，对结果的空间与 本研究于 2025 年春季在黄河口及长江口邻近
时间代表性解释带来不确定性；标准化流程的缺 海域开展水样采集工作。黄河口海域的采样时间
乏可能影响不同研究间的可比性 [5,7-8] 。因此，在河 为 4 月 11—13 日，长江口海域为 4 月 5—7 日。
口这类环境异质性高、水文条件复杂、传统调查 两个区域各设置 9 个采样站位 (图 1)。鉴于水深差
方法受限的生态系统中，系统应用 eDNA 技术进 异，黄河口各站位只采集表层和底层水样，而水
行鱼类多样性监测，不仅能够验证和优化现有技 深较大的长江口各站位则采集表层、中层和底层
术方案，其产生的标准化、高通量数据对于揭示 水样，共计获得 45 个样本。为监控潜在的环境与
不同河口生态系统的群落结构差异、评估其生态 操作污染，在每个站位同步设置了现场过滤空白
健康，以及支撑跨区域的生物多样性比较与管理 的阴性对照 (使用无菌超纯水通过同一套过滤装
具有不可替代的价值。 置)。最终在生物信息学分析中，通过比对所有阴
为此，本研究应用 eDNA 宏条形码技术，对 性对照的测序结果，应用严格的过滤阈值 (仅保留
黄河口与长江口邻近海域的鱼类多样性进行调查 在真实样本中相对丰度高于其在所有阴性对照中
与比较分析。具体目标：(1) 系统解析并比较两 最高相对丰度 10 倍以上的序列变异)。

N N
N N
40° 33°
39° 32°

38° 31°

km km
37° 30°
118° 119° 120° 121° E 121° 122° 123° 124° E
(a) (b)
图 1 黄河口 (a) 和长江口 (b) 邻近海域环境 DNA 采集站位分布
Fig. 1 The distribution of environmental DNA sampling stations in the adjacent sea areas of
the Yellow River Estuary (a) and the Yangtze River Estuary (b)
各水层水样使用 SBE-911 plus CTD 剖面仪 所有接触样本的器具 (如过滤瓶、镊子) 在每次使
(Sea Bird Scientific, 美 国 ) 采 集 。 采 样 后 ， 使 用 用前后，均使用质量分数为 0.5% 的次氯酸钠溶液
0.45 µm 玻璃纤维素滤膜 (上海兴亚净化材料厂) 进行消毒，并用去离子水冲洗以去除残留、防止
及隔膜真空泵 (天津市津腾实验设备有限公司) 对 污染。全程操作均佩戴无菌手套。过滤后的滤膜
水样进行过滤，每个样本过滤体积为 1 L。CTD 经折叠，用无菌铝箔包裹后立即置于−80 ℃ 超低
采水器在每次采样前后均用去离子水充分冲洗。 温冰箱中保存，待 DNA 提取。

https://www.china-fishery.cn 中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries
2