Page 102 - 《水产学报》2026年第3期
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3 期 水 产 学 报 50 卷
·续表 1·
基因 上游引物 下游引物 登录号/来源
gene forward sequence (5′–3′) reverse sequence (5′–3′) accession no./source
FAS GTCTGTGATGGCGAGGTGTC CAGTCGGTATGAGGGTGTGG >XM_038735140.1
PPARα CCACCGCAATGGTCGATATG TGCTGTTGATGGACTGGGAAA >XM 038705496.1
CPT-1 CATGGAAAGCCAGCCTTTAG GAGCACCAGACACGCTAACA >XM_038713999.1
LPL ACCAAAGCAGTGGGACAGG CCAAACCAGTTATTCTTCCGA >XM_038715977.1
HSL TATTCAGGAGGAGCAAAGGG GGTATGTGTGGGTCAAAGTCA >XM_038710964.1
ATGL CCTTTAGACTCGCCGTGGA CAGGGTAGTGGCGGTTAGA >XM 038705351.1
FFAR TGCCTTCTGTGTCAAGATCCATTCC GCCTGACGCTGCCTCATACATC >XM_038739388.1
IκBβ GCCAAAACGAAGAGATCCGC ATCTTCCGATACGTCCCCCT >XM_038726829.1
P65 AACAGCGAGCCCCTTCATAG TGTCGTTGCTCTTCTCTCCG >XM_038702564.1
Iκκβ AGAGATAGATGGGCGACGGA GGACGAAGCGGATGTTCTCT >XM_038730801.1
TNF-α CTTCGTCTACAGCCAGGCATCG TTTGGCACACCGACCTCACC >XM_038710731.1
IL-1β CGTGACTGACAGCAAAAAGAGG GATGCCCAGAGCCACAGTTC >XM_038707900.1
IL-8 CGTTGAACAGACTGGGAGAGATG AGTGGGATGGCTTCATTATCTTGT >XM_038713528.1
Ef1α TGCTGCTGGTGTTGGTGAGTT TTCTGGCTGTAAGGGGGCTC >XM_038724777.1
注:IRA. 胰岛素受体异构体A;IRB. 胰岛素受体异构体B;IRS1. 胰岛素受体底物1;ADPGK. ADP依赖性葡萄糖激酶;PFKL.磷酸果糖激酶;
PK. 丙酮酸激酶;GSK3β. 糖原合成酶激酶3β;PEPCK. 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶;AKT1. 蛋白激酶B;PBP1. 磷脂酰乙醇胺结合蛋白1;PGC-
1α. 过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子1α;BNIP3. Bcl2/腺病毒E1B 19kD相互作用蛋白3;AMPKα. AMP激活蛋白激酶α;SIRT1. 沉默信
息调节2同源物1;ORAI1. ORAI钙释放激活钙调制蛋白1;MFN1. 线粒体融合蛋白1;DRP1. 动力相关蛋白1;FIS1. 线粒体分裂蛋白1;ERRA.
雌激素相关受体α;LC3. 微管相关蛋白1A/1B轻链3;P62. 隔离体1;TFAM. 线粒体转录因子a;ACC. 乙酰辅酶A羧化酶;FAS. 脂肪酸合酶;
PPARα. 过氧化物酶体增殖物激活受体α;CPT-1. 肉碱棕榈酰转移酶1;LPL. 脂蛋白脂酶;HSL. 激素敏感性脂肪酶;ATGL. 脂肪甘油三酯脂肪
酶;FFAR. 游离脂肪酸受体;Ef1α. 翻译延伸因子1α;IκBβ. 核因子κB抑制因子β;P65. 核因子NF-κB p65亚基;Iκκβ. IκB激酶β;TNF-α. 肿瘤
坏死因子-α;IL-1β. 白细胞介素-1β;IL-8. 白细胞介素-8。
Notes: IRA. insulin receptor isoform A; IRB. insulin receptor isoform B; IRS1. insulin receptor substrate 1; ADPGK. ADP-dependent glucokinase; PFKL.
phosphofructokinase; PK. pyruvate kinase; GSK3β. glycogen synthase kinase 3β; PEPCK. phosphoenolpyruvate carboxykinase; AKT1. serine/threonine-
protein kinase AKT1; PBP1. phosphatidylethanolamine binding protein 1; PGC-1α. peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-
alpha; BNIP3. bcl2/adenovirus E1B19kD interacting protein 3; AMPKα. AMP-activated protein kinase alpha; SIRT1. silent mating type information
regulation 2 homolog 1; ORAI1. orai calcium release-activated calcium modulator 1; MFN1. mitofusin 1; DRP1. dynamin-related protein 1; FIS1.
mitochondrial fission 1 protein; ERRA. estrogen-related receptor α; LC3. microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3; P62. sequestosome 1;
TFAM. mitochondrial transcription factor a; ACC. acetyl-coa carboxylase; FAS. fatty acid synthase; PPARα. peroxisome proliferator-activated receptor
alpha; CPT-1. carnitine palmitoyltransferase 1; LPL. lipoprotein lipase; HSL. hormone-sensitive lipase; ATGL. adipose triglyceride lipase; FFAR. free
fatty acid receptor; Ef1α. eukaryotic translation elongation factor 1 alpha; IκBβ. nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells
inhibitor, beta; P65. RELA proto-oncogene, NF-kB subunit; Iκκβ. inhibitor of kappaB kinase beta; TNF-α. tumor necrosis factor-α; IL-1β. iiterleukin-1
beta; IL-8. iiterleukin-8.
1.7 肝脏转录组学分析 正筛选并对差异显著的 DEGs 进行 KEGG 通路富
集分析,筛选富集程度显著的通路 (FDR<0.05),
肝脏转录组测序及原始数据处理委托北京百
并结合 GO 功能注释解析其生物学意义。
迈克生物技术有限公司完成,每组各测序 4 个样
本。使用 TRIzol 试剂提取肝脏总 RNA,将质量合 1.8 数据分析
格的 RNA 用于构建文库,并利用 PacBio Sequel
本研究所有数据均以均值±标准误表示,数
Ⅱ平台测序。原始数据按照前人研究中描述的方 据经正态分布及方差齐性检验后利用 SPSS 22.0 软
[28]
法进行处理 ,转录组分析时参照大口黑鲈基因 件进行独立样本 t 检验。
组 [29] :测序数据利用 HISAT2 软件与基因组进行
比对,比对成功后利用 StringTie 软件组装成转录 2 结果
本。在基因注释和新转录本预测之后,通过错误
2.1 肝脏糖代谢
发现率 (FDR) 校正来识别差异表达基因 (DEGs)。
DEGs 通 过 Benjamini-Hochberg 方 法 进 行 FDR 校 PAS 染色观察显示 Heat 组大口黑鲈肝脏糖原
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