Page 102 - 《水产学报》2026年第3期
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3 期                                     水    产    学    报                                 50 卷
                                                                                                  ·续表   1·
                  基因                  上游引物                           下游引物                    登录号/来源
                  gene            forward sequence (5′–3′)       reverse sequence (5′–3′)  accession no./source
                   FAS         GTCTGTGATGGCGAGGTGTC           CAGTCGGTATGAGGGTGTGG         >XM_038735140.1
                  PPARα        CCACCGCAATGGTCGATATG           TGCTGTTGATGGACTGGGAAA        >XM 038705496.1
                  CPT-1        CATGGAAAGCCAGCCTTTAG           GAGCACCAGACACGCTAACA         >XM_038713999.1
                   LPL         ACCAAAGCAGTGGGACAGG            CCAAACCAGTTATTCTTCCGA        >XM_038715977.1
                   HSL         TATTCAGGAGGAGCAAAGGG           GGTATGTGTGGGTCAAAGTCA        >XM_038710964.1
                  ATGL          CCTTTAGACTCGCCGTGGA           CAGGGTAGTGGCGGTTAGA          >XM 038705351.1
                  FFAR       TGCCTTCTGTGTCAAGATCCATTCC       GCCTGACGCTGCCTCATACATC        >XM_038739388.1
                  IκBβ         GCCAAAACGAAGAGATCCGC           ATCTTCCGATACGTCCCCCT         >XM_038726829.1
                   P65         AACAGCGAGCCCCTTCATAG            TGTCGTTGCTCTTCTCTCCG        >XM_038702564.1
                   Iκκβ        AGAGATAGATGGGCGACGGA           GGACGAAGCGGATGTTCTCT         >XM_038730801.1
                  TNF-α       CTTCGTCTACAGCCAGGCATCG          TTTGGCACACCGACCTCACC         >XM_038710731.1
                  IL-1β       CGTGACTGACAGCAAAAAGAGG          GATGCCCAGAGCCACAGTTC         >XM_038707900.1
                   IL-8      CGTTGAACAGACTGGGAGAGATG        AGTGGGATGGCTTCATTATCTTGT       >XM_038713528.1
                  Ef1α         TGCTGCTGGTGTTGGTGAGTT          TTCTGGCTGTAAGGGGGCTC         >XM_038724777.1
              注:IRA. 胰岛素受体异构体A;IRB. 胰岛素受体异构体B;IRS1. 胰岛素受体底物1;ADPGK. ADP依赖性葡萄糖激酶;PFKL.磷酸果糖激酶;
              PK. 丙酮酸激酶;GSK3β. 糖原合成酶激酶3β;PEPCK. 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶;AKT1. 蛋白激酶B;PBP1. 磷脂酰乙醇胺结合蛋白1;PGC-
              1α. 过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子1α;BNIP3. Bcl2/腺病毒E1B 19kD相互作用蛋白3;AMPKα. AMP激活蛋白激酶α;SIRT1. 沉默信
              息调节2同源物1;ORAI1. ORAI钙释放激活钙调制蛋白1;MFN1. 线粒体融合蛋白1;DRP1. 动力相关蛋白1;FIS1. 线粒体分裂蛋白1;ERRA.
              雌激素相关受体α;LC3. 微管相关蛋白1A/1B轻链3;P62. 隔离体1;TFAM. 线粒体转录因子a;ACC. 乙酰辅酶A羧化酶;FAS. 脂肪酸合酶;
              PPARα. 过氧化物酶体增殖物激活受体α;CPT-1. 肉碱棕榈酰转移酶1;LPL. 脂蛋白脂酶;HSL. 激素敏感性脂肪酶;ATGL. 脂肪甘油三酯脂肪
              酶;FFAR. 游离脂肪酸受体;Ef1α. 翻译延伸因子1α;IκBβ. 核因子κB抑制因子β;P65. 核因子NF-κB p65亚基;Iκκβ. IκB激酶β;TNF-α. 肿瘤
              坏死因子-α;IL-1β. 白细胞介素-1β;IL-8. 白细胞介素-8。
              Notes: IRA. insulin receptor isoform A; IRB. insulin receptor isoform B; IRS1. insulin receptor substrate 1; ADPGK. ADP-dependent glucokinase; PFKL.
              phosphofructokinase; PK. pyruvate kinase; GSK3β. glycogen synthase kinase 3β; PEPCK. phosphoenolpyruvate carboxykinase; AKT1. serine/threonine-
              protein kinase AKT1; PBP1. phosphatidylethanolamine binding protein 1; PGC-1α. peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-
              alpha; BNIP3. bcl2/adenovirus E1B19kD interacting protein 3; AMPKα. AMP-activated protein kinase alpha; SIRT1. silent mating type information
              regulation 2 homolog 1; ORAI1. orai calcium release-activated calcium modulator 1; MFN1. mitofusin 1; DRP1. dynamin-related protein 1; FIS1.
              mitochondrial fission 1 protein; ERRA. estrogen-related receptor α; LC3. microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3; P62. sequestosome 1;
              TFAM. mitochondrial transcription factor a; ACC. acetyl-coa carboxylase; FAS. fatty acid synthase; PPARα. peroxisome proliferator-activated receptor
              alpha; CPT-1. carnitine palmitoyltransferase 1; LPL. lipoprotein lipase; HSL. hormone-sensitive lipase; ATGL. adipose triglyceride lipase; FFAR. free
              fatty acid receptor; Ef1α. eukaryotic translation elongation factor 1 alpha; IκBβ. nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells
              inhibitor, beta; P65. RELA proto-oncogene, NF-kB subunit; Iκκβ. inhibitor of kappaB kinase beta; TNF-α. tumor necrosis factor-α; IL-1β. iiterleukin-1
              beta; IL-8. iiterleukin-8.

               1.7    肝脏转录组学分析                                 正筛选并对差异显著的           DEGs 进行   KEGG  通路富
                                                               集分析,筛选富集程度显著的通路                  (FDR<0.05),
                   肝脏转录组测序及原始数据处理委托北京百
                                                               并结合   GO  功能注释解析其生物学意义。
              迈克生物技术有限公司完成,每组各测序                     4  个样
              本。使用     TRIzol 试剂提取肝脏总       RNA,将质量合            1.8    数据分析
              格的   RNA  用于构建文库,并利用             PacBio Sequel
                                                                   本研究所有数据均以均值±标准误表示,数
              Ⅱ平台测序。原始数据按照前人研究中描述的方                            据经正态分布及方差齐性检验后利用                 SPSS 22.0  软
                         [28]
              法进行处理 ,转录组分析时参照大口黑鲈基因                            件进行独立样本       t 检验。
              组 [29] :测序数据利用      HISAT2  软件与基因组进行
              比对,比对成功后利用            StringTie 软件组装成转录           2    结果
              本。在基因注释和新转录本预测之后,通过错误
                                                                2.1    肝脏糖代谢
              发现率    (FDR) 校正来识别差异表达基因             (DEGs)。
              DEGs 通 过   Benjamini-Hochberg  方 法 进 行  FDR  校       PAS  染色观察显示      Heat 组大口黑鲈肝脏糖原

              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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