Page 209 - 《水产学报》2026年第2期
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2 期              覃晓曼,等:基于全基因组测序分析大口黑鲈鰤诺卡氏菌致病性和耐药性                                        50 卷

              3 min,95 ℃  变性   10 s,55 ℃  退火  10 s,72 ℃  延     肾脏、脾脏等组织表面出现白色结节。采集病变
              伸  2 min,30  个循环,72 ℃    延伸   10 min。            组织进行    PCR  病原检测。结果显示,嗜水气单胞
               1.9    耐药性分析                                    菌、温和气单胞菌、维氏气单胞菌、类志贺邻单
                                                               胞菌的引物均未得到目的产物,鰤诺卡氏菌的引
                    生物被膜形成能力测定  采用                96  孔微量
                                                               物扩增得到目的产物,与鰤诺卡氏菌阳性对照一
              板结晶紫染色法测定分离菌株的生物被膜形成能
                                                               致  (图  1),表明发病大口黑鲈疑似鰤诺卡氏菌感染。
              力 [26] 。将培养  5 d  的菌液按照     1∶100  转接到   BHI

              液体培养基中,取         200 μL  加入到  96  孔微量板中,            bp  M  1  2  3 4  5     M 6  7  8  9 10
                                                                2 000
              以  BHI 液体培养基作为阴性对照;在               28 ℃  恒温
                                                                1 000
              培养箱静置培养         15 d,吸弃菌液,然后用          200 μL      750
                                                                 500
              干净的    PBS  清洗  3  次;在空气中吹干平板,每孔                   250
                                                                 100
              加  1%  结晶紫  200 μL,染色   5 min,小心清洗掉结晶
              紫染液后将培养板倒置以除去残留液体;每孔加                                     图 1    病鱼样品的特定病原检测
              入  200  μL  33%  冰 醋 酸 溶 解  0.5  h, 酶 标 仪 测      M. marker;1. 温和气单胞菌;2. 维氏气单胞菌;3. 鰤诺卡氏菌;
                                                               4. 嗜水气单胞菌;5. 类志贺邻单胞菌;6~10. 病鱼样品。
              OD 590n m  值 。 根 据  ODc 的 临 界 值   (ODc=对 照             Fig. 1 Detection of specific pathogens in
              OD 590n m  的平均值) 判断:细菌OD       590nm <ODc 时,
                                                                             diseased M. samples
              无 生 物 被 膜 形 成 力 ; ODc< 细 菌 OD          590nm ≤   M. marker; 1. A. sobria; 2. A. veronii; 3. N. seriolae; 4. A. hydrophila; 5.
              2ODc 时 , 生 物 被 膜 形 成 力 弱 ; 2ODc< 细 菌             P. shigelloides; 6-10. infected sample.
              OD 590nm ≤4ODc, 生 物 被 膜 形 成 力 中 等 ; 细 菌
              OD 590nm >4ODc,生物被膜形成力强。利用              SPSS      2.2    分离菌株生理生化鉴定
              和  GraphPad Prism 8.0  软件分别进行显著性差异分
                                                                   分离菌株氧化酶呈阴性,过氧化氢酶呈阳性,
              析及柱状图制作。
                                                               可还原硝酸盐,能产生脲酶;水解七叶灵,不水
                    耐药基因分析  利用综合性抗生素抗性
                                                               解淀粉、明胶;能以柠檬酸盐为唯一碳源生长,
              (Comprehensive  Antibiotic  Resistance  Database,
                                                               不能利用阿拉伯糖、山梨醇和甘露醇;同时该菌
              CARD) 基 因 数 据 库       (http://arpcard.Mcmaster.ca,
                                                               不能在   35 ℃  及以上温度生长;分离菌株与参照
                          [27]
              Version 1.1.3) ,对分离菌株      NS01  携带耐药基因
                                                               菌株鰤诺卡氏菌       SD1810  的理化特性相似。
              进行筛选,设定比对期望值为               1e−5。为了比较分
              离菌株    NS01  的耐药基因与其他鰤诺卡氏菌之间                      2.3    分离菌株的形态特征
              携带的耐药基因的差异,使用               CARD  数据库检索              分离菌株在     BHI 固体培养基上       28 ℃  培养  3 d,
              分离菌株     NS01  与其他   24  株鰤诺卡氏菌的抗生素
                                                               生长出淡黄色或白色小单菌落,6~8 d              后菌落表面
              耐药性相关的基因片段,以             R package 用于统计分
                                                               粗糙,呈不规则雪花状            (图版Ⅰ-1)。挑取单菌落
              析和图片绘制       (https://www.r-project.org/)。
                                                               在  BHI 液体培养基中,28 ℃        振荡培养    5 d  菌体沉
                    药物敏感性测定  药物敏感性测定采用                  K-
                                                               于底部,培养基液体清澈,振荡试管可见明显雪
              B  琼脂法。将培养        5 d  的菌株用   PBS  调整至   1.0×
                                                               花状菌落     (图版Ⅰ-2)。分离菌株纯培养物经革兰
                8
              10  CFU/mL,用无菌棉签蘸取菌液均匀涂布在
                                                               氏染色在光学显微镜下观察,可见呈蓝紫色的革
              BHI 固体培养基上,将不同抗菌药物纸片贴在培
                                                               兰氏阳性杆菌       (图版Ⅰ-3)。对分离菌株进行扫描
              养基上,28 ℃      恒温培养     6 d  后测定抑菌圈直径;
                                                               电镜观察,其形态不规则,呈分支杆状                (图版 Ⅰ-4)。
              结果判断采用杭州微生物试剂有限公司制定的药
                                                               分离菌株符合鰤诺卡氏菌的微观形态特征。
              敏标准对分离菌株         NS01  药物敏感性进行评定。
                                                                2.4    16S rRNA  和  secA1  基因序列测序分析
               2    结果
                                                                   以分离菌株基因组为模板,采用                 16S rRNA
                                                               基因和   secA1  基因引物分别扩增出       1 387 bp  和  459 bp
               2.1    病原检测结果
                                                               的特异性条带,测序后以            BLAST  在线分析工具进
                   发病大口黑鲈体表溃疡出血,剖检可见肝脏、                        行比对分析。从        GenBank  数据库中选取部分诺卡

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
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