Page 212 - 《水产学报》2026年第2期

2 期 水 产 学 报 50 卷

RNA 加工和修饰
RNA processing and modification
染色质结构与动力学
chromatin structure and dynamics
能量产生与转换
energy production and conversion
8.00 Mbp 细胞周期控制、细胞分裂、染色体分裂
cell cycle control, cell division, chromosome partitioning
氨基酸运输与代谢
amino acid transport and metabolism
核苷酸运输与代谢
nucleotide transport and metabolism
碳水化合物运输与代谢
7.00 Mbp 辅酶运输与代谢
carbohydrate transport and metabolism
1.00 Mbp
coenzyme transport and metabolism
脂质运输与代谢
lipid transport and metabolism
翻译、核糖体结构与生物发生
translation, ribosomal structure and biogenesis
转录
transcription
复制、重组与修复
replication, recombination and repain
细胞壁/细胞膜/包膜生物发生
cell wall/membrane/envelope biogenesis
细胞运动
cell motility
2.00 Mbp 无机离子转运与代谢
转译后修饰、蛋白质周转、分子伴侣
NS01 posttranslational modification, protein turnover, chaperones
8 104 751 bp inorganic ion transport and metabolism
次级代谢产物的生物合成、转运和分解代谢
secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism
一般功能预测
6.00 Mbp
general function prediction only
未知功能
function unknown
信号转导机制
signal transduction mechanisms
胞内运输、分泌与囊泡运输
intracellular trafficking, secretion, and vesicular transport
防御机制
defense mechanisms
胞外结构
extracellular structures
3.00 Mbp 原噬菌体、转座子
prophages, transposons
细胞核结构
nuclear structure
细胞骨架
5.00 Mbp
cytoskeleton
5S rRNA
4.00 Mbp tRNA
16S rRNA
23S rRNA
图 3 基因组圈图
圈图的最外面 1 圈为基因组大小的标识；第 2 圈和第 3 圈为正链、负链上的 CDS，不同的颜色表示 CDS 不同的 COG 的功能分类；第 4 圈
为 rRNA 和 tRNA；第 5 圈为 GC 含量 (红色部分表示 GC 含量>全基因组平均 GC 含量，蓝色部分表示 GC 含量<全基因组平均 GC 含量)；
最内一圈为 GC-Skew 值。
Fig. 3 Circular genome map
The outermost circle marks the size of the genome; the second circle and the third circle are CDS on the positive chain and the negative chain, different
colors indicate the functional classification of different COG of CDS; the fourth circle is rRNA and tRNA; the fifth circle is GC content (the red part
means GC content > genome-wide average GC content, the blue part means GC content < genome-wide average GC content); the innermost circle is the
GC-Skew value.

表 4 鰤诺卡氏菌 NS01 与其他近缘鰤诺卡氏菌全基因组基本信息
Tab. 4 Basic information of the whole genome of N. seriolae NS01 and other related N. seriolae
目科 分离源 菌株 分离地 GenBank登录号
order/family isolated source strains locatiom GenBank accession no.
鲈形目 Perciformes 黄条鰤 S. aureovittata UTF1 日本 AP017900.1
鲹科 Carangidae 高体鰤 S. dumerili KGN1266 日本 AP028458.1
鰤鱼 S. quinqueradiata NBRC15557 日本 GCA_007990715.1
卵形鲳鲹 T. ovatus ZJ0503 中国广东 GCF_000763165.1
鰤鱼 S. quinqueradiata 024013 日本 AP028459.1
黄尾鰤 S. lalandi N-2 927 日本 GCF_000583715.2
黄尾鰤 S. lalandi U-1 日本 GCA_001192935.1
镰鳍鲳鲹 Trachinotus falcatus KH_21 越南 GCA_009712555.1
镰鳍鲳鲹 T. falcatus PY_31 越南 GCA_009712165.1
镰鳍鲳鲹 T. falcatus VT_62 澳大利亚 GCA_009712405.1
https://www.china-fishery.cn 中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries
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