Page 213 - 《水产学报》2026年第2期
P. 213

2 期              覃晓曼,等:基于全基因组测序分析大口黑鲈鰤诺卡氏菌致病性和耐药性                                        50 卷
                                                                                                  ·续表   4·
                       目科                      分离源                  菌株          分离地         GenBank登录号
                     order/family           isolated source        strains     locatiom   GenBank accession no.
                                   镰鳍鲳鲹 T. falcatus           VT_45         澳大利亚        GCA_009712575.1
                                   镰鳍鲳鲹 T. falcatus           NT_50         澳大利亚        GCA_009712505.1
                                   镰鳍鲳鲹 T. falcatus           KH_11         越南          GCA_009712515.1
                                   镰鳍鲳鲹 T. falcatus           PY_37         越南          GCA_009712525.1
              鲈形目 Perciformes      乌鳢 C. argus                SDAT0011      中国山东        CP134713.1
              鳢科 Channidae         乌鳢 C. argus                CK-14 008     韩国          GCA_001885535.1
                                   乌鳢 C. argus                HSY-NS01      中国四川        GCF_003013595.1
                                   斑鳢 Channa maculata         SY-24         中国广东        GCF_002093935.1
                                   杂交鳢 C. argus♂×C. maculata♀  NK201610020  中国广东        CP063662.1
              鳗鲡目 Anguillomorpha   日本鳗鲡 Anguilla japonica     EM150506      韩国          CP017839.1
              鳗鲡科 Anguillidae      日本鳗鲡 Anguilla japonica     MH196537      韩国          CP059737.1
              鲈形目 Perciformes      大口黑鲈 M. salmoides          HSY-NS02      中国四川        GCF_003667075.1
              棘臀鱼科 Centrarchidae   大口黑鲈 M. salmoides          NS01          中国湖北        CP147977
              鲈形目 Perciformes      鳜 Siniperca chuatsi        20 230 510    中国广西        CP130742.1
              鮨鲈科 Percichthyidae
              未知 unknown                                      TL20          中国山西        CP073655.1




                             strain  CK-14008  SDAT0011  MH196537  NK201610020  HSY-NS01  SY-24  TL20  EM150506  NS01  HSY-NS02  20230510  PY-31  KH-21  VT-62  UTF1  KGN1266  ZJ0503  VT-45  NT-50  KH-11  NBRC15557  PY-37  N-2927  U-1  024013  宿主`host  ANI/%
                                                                    乌鳢   C. argus           100.00
                                                                    乌鳢   C. argus           99.95
                                                                    日本鳗鲡   A. japonica
                                                                    杂交鳢   C. argus♂×C. maculata♀
                                                                                            99.90
                          淡水鱼  freshwater fish                      乌鳢   C. argus           99.85
                                                                    斑鳢   C. maculata
                                                                    未知   unknown
                                                                                            99.80
                                                                    日本鳗鲡   A. japonica
                                                                    大口黑鲈   M. salmoides
                                                                    大口黑鲈   M. salmoides
                                                                    鳜   S. chuatsi
                                                                    镰鳍鲳鲹   T. falcatus
                                                                    镰鳍鲳鲹   T. falcatus
                                                                    镰鳍鲳鲹   T. falcatus
                                                                    黄条鰤   S. aureovittata
                                                                    高体鰤   S. dumerili
                                                                    镰鳍鲳鲹   T. falcatus
                          海水鱼  seafish                              镰鳍鲳鲹   T. falcatus
                                                                    镰鳍鲳鲹   T. falcatus
                                                                    镰鳍鲳鲹   T. falcatus
                                                                    鰤   S. quinqueradiata
                                                                    镰鳍鲳鲹   T. falcatus
                                                                    黄尾鰤   S. lalandi
                                                                    黄尾鰤   S. lalandi
                                                                    鰤   S. quinqueradiata

                                图 4    分离菌株  NS01  与其他  24  株鰤诺卡氏菌全基因组序列的         ANI 分析
                     Fig. 4 ANI Analysis of the whole Genome sequence of the isolated strain NS01 and 24 other N. Seriolae
              有明显结节,肝细胞空泡变性               (图版 Ⅲ -4);感染         力基因的    PCR  扩增结果均为阳性,目的条带大小
              组大口黑鲈的脾脏组织内细胞排列相对疏松,有                            分别为   213、1 000、1 254  和  987 bp,而分离菌株
              明显结节     (图版 Ⅲ -5),脾脏血窦膨大、有淤血;                   的  kasA、kasB、fbpA、fbpC、whiB3、mpa、pafA、
              感染组大口黑鲈的肾脏组织有明显结节和空泡状                            dop、ibeA  和  mip  的扩增结果则均为阴性          (图  7)。
              (图版 Ⅲ -6)。                                       结果显示,分离菌株            NS01  携带毒力基因       pup、
                    毒力基因检测  毒力基因检测结果显示,                        mig、mce 1A  和  gapA,不携带    kasA、kasB、fbpA、
              分离菌株      NS01  的  pup、mig、mce 1A  和  gapA  毒    fbpC、whiB3、mpa、pafA、dop、ibeA     和  mip。

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
                                                            9
   208   209   210   211   212   213   214   215   216   217   218