Page 41 - 《水产学报》2026年第01期
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1 期 严孟芝,等:大口黑鲈 IL-12 表达分析及异构体组成形式鉴定 50 卷
显著,则采用 Tukey 氏多重比较来检验不同处理组 失。p40c 亚基则表现为 IG-Like 和 IL-12p40_C 双
间的差异显著性,P<0.05 为差异具有统计学意义。 结 构 域 中 第 4 号 β 折 叠 的 共 缺 失 现 象 。 使 用
MEME 分别预测不同物种 p35 和 p40 结构域中具
2 结果 体的保守基序 (图 1),发现 IL-12p35 蛋白中存在
2 个保守的基序:110-CSALRKSSFDEAKCLKNI-
2.1 大口黑鲈 IL-12 亚基基因序列特征及蛋白
YEDLKYYKLELQSYKP-143 和 175-ETVPQKVPV
结构分析 EEPSSFDDRLKLCKVLKAFHIRAITINRVLAY-215,
通过本地 Blast 分析得到大口黑鲈 IL-12α 亚 其余保守氨基酸位点均集中在 α 螺旋处。对于
基基因 p35a 和 3 个 IL-12β 亚基基因 p40a、p40b p40 蛋白,其内部均存在多个保守基序,其中纤
与 p40c,其基因和编码蛋白特征见表 2。ClustalW 维连接蛋白Ⅲ型结构域 (FN3) 中与受体激活相关
多序列比对结果显示,大口黑鲈 p35 与 p40 中存 的 WSXWS 盒子 319-WSEWS-323 基序高度保守。
在多个高度保守的半胱氨酸 (Cys,简称 C) 位点 基 于 以 上 多 序 列 比 对 、 SMART 结 构 域 预 测 及
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(图 1)。大口黑鲈 p35a 氨基酸序列中 C 、C 、C 、 MEME 预测得出,大口黑鲈 p35a 和 p40a、p40b
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C 、C 172 与其他物种 p35 的半胱氨酸位点是保守 和 p40c 亚基蛋白整体结构分别与人 p35 及 p40 亚
的。与不同进化水平的物种进行多序列比对,结 基结构高度相似,进一步推测这些亚基能够在大
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果 显 示 大 口 黑 鲈 p40a 的 C 、 C 、 C 、 C 141 和 口黑鲈体内发生相互作用,形成不同的 IL-12 二
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p40b 的 C 、C 、C 、C 142 以及 p40c 的 C 、C 、 聚体。
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C 、C 129 位点均是保守的。这些保守的半胱氨酸 2.2 大口黑鲈 IL-12 基因的组织表达水平检测
位点是 IL-12 亚基单体蛋白折叠形成自身二硫键
为探究大口黑鲈 IL-12 在各组织的表达水平,
的关键位点。
通过 qPCR 技术检测了 p35a、p40a、p40b 和 p40c
为了解大口黑鲈 IL-12 结构的保守性,通过
在健康大口黑鲈 6 个不同组织中的表达。从检测
SMART 网 站 预 测 p35a 和 p40a、 p40b 和 p40c 蛋
结果可以看出,本研究的 4 个 IL-12 亚基基因在
白质单体的结构域,结果如图 2 所示,大口黑鲈
肝脏、脾脏、头肾、体肾、肌肉、后肠组织中均
IL-12p35a 主要由 4 个 α 螺旋构成 4 束螺旋结构
都有不同程度的表达,其中 p35a 在体肾中表达量
(图 2-a),3 个 p40 亚基均由 3 个主要的结构域组
最高,头肾中最低;p40a 在后肠中的表达量最高,
成 (图 2-b~d),其中 p40a 和 p40c 蛋白 N 端到 C 端
肝脏中最低;p40b 在体肾中表达量最高,头肾中
依次由免疫球蛋白样结构域 (IG-Like)、IL-12p40_
最低;p40c 在后肠中表达量最高,头肾中最低
C 结 构 域 和 d1f4a3 构 成 。 p40b 蛋 白 N-C 端 由
(图 3)。β-actin 作为内参基因,以 IL-12 亚基在头
d1f4a1、IL-12p40_C 结构域和纤维连接蛋白Ⅲ型
肾中的表达水平为基准进行多重比较。
结 构 域 (FN3) 构 成 。 与 人 类 IL-12 结 构 (PDB:
2.3 鰤鱼诺卡氏菌感染不同阶段大口黑鲈 IL-
1F45) 相比,p35a 亚基的 4 个 α 螺旋高度保守,
而 p40a 亚基中,IG-Like 结构域的第 2 (B)、4 (d, 12 诱导表达分析
D)、5 (E) 号 β 折叠与 IL-12p40_C 结构域的第 4 鰤鱼诺卡氏菌是导致鱼类诺卡氏菌病的主要
号 β 折叠同时发生缺失。p40b 亚基的结构变异相 病原之一,为探究 IL-12 在大口黑鲈抗鰤鱼诺卡
对较少,仅在 d1f4a1 结构域出现第 4 号 β 折叠缺 氏菌的免疫反应中的表达变化,使用浓度为 1×10 3
表 2 大口黑鲈 IL-12 基因及其编码蛋白特征
Tab. 2 Characteristics of IL-12 in M. salmoides
基因 NCBI序列号 ORF长度/bp 氨基酸数量/个 分子质量/ku 等电点
gene NCBI accession no. ORF amino acids Mw pI
p35a XP_038574041.1 600 199 22.4 6.3
p40a XP_038563988.1 969 322 36.4 6.5
p40b XP_038554509.1 1 071 356 41.1 8.8
p40c XP_038560704.1 1 038 345 39.6 8.6
中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries https://www.china-fishery.cn
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