Page 110 - 《水产学报》2025年第11期
P. 110
夏宁,等 水产学报, 2025, 49(11): 119409
表 3 脂质代谢相关泛素化修饰差异蛋白汇总
Tab. 3 Summary of lipid metabolism-related ubiquitinated differential proteins
通路描述 数据库 分支 下调蛋白 上调蛋白
description database branch down up
脂质代谢途径 GO BP ACOX1 CPLA2
lipid metabolic process HADHA DAGLα
HMGCS
FPS
细胞脂质代谢途径 GO BP ACOX1 CPLA2
cellular lipid metabolic process HADHA
HMGCS
FPS
脂肪酸代谢途径 GO BP ACOX1
fatty acid metabolic process HADHA
不饱和脂肪酸代谢途径 KEGG PATHWAY ACOX1 VLCAR
biosynthesis of unsaturated fatty acids HADHA ACAA1
脂肪消化吸收途径 KEGG PATHWAY m-AST
fat digestion and absorption ABCA1
甘油磷脂代谢途径 KEGG PATHWAY APT CPLA2
glycerophospholipid metabolism LPCAT DGKz
PLD1
脂肪酸代谢途径 KEGG PATHWAY FAS VLCAR
fatty acid metabolism ACOX1 ACAA1
HADHA
α-亚麻酸代谢途径 KEGG PATHWAY ACOX1 CPLA2
alpha-linolenic acid metabolism ACAA1
刺激对巨噬细胞脂质代谢的调控,实验鉴定并 异蛋白,其中有 94 个 N-糖基化蛋白表达显著
分析了磷酸化水平的差异蛋白及其功能和通路。 下调,274 个 N-糖基化蛋白表达显著上调 (图 3-
结果显示,与 PBS 对照组相比,poly(I:C) 刺激 a),32 个 O-糖基化表达显著下调,88 个 O-糖
后巨噬细胞中共鉴定到 139 个差异磷酸化修饰 基化蛋白表达显著上调 (图 3-b)。GO 富集通路
蛋白,其中有 37 个蛋白表达显著下调,102 个 表明 N-糖基化与 O-糖基化差异蛋白均主要参
显著上调 (图 2-a)。以 P ≤ 0.05 为阈值对鉴定 与 G 蛋白偶联受体信号通路、寡糖基转移酶复
的磷酸差异蛋白进行 GO 功能富集,结果显示, 合物代谢等调控 (图 3-c, d)。2 种糖基化组学数
磷酸化水平存在差异的蛋白质主要涉及生物过 据中并未发现糖基化差异蛋白参与排行靠前的
程和分子功能,参与翻译起始、细胞蛋白质代 脂质代谢相关通路,表明糖基化修饰似乎并不
谢过程的调节等过程 (图 2-b)。对 PBS 对照组 主要参与 poly(I:C) 调控脂质代谢的过程。
和 poly(I:C) 刺激组磷酸化差异蛋白进行 KEGG
2.5 差异蛋白表达及修饰位点分析
通路富集,结果发现,磷酸化差异蛋白主要参
通过比较差异蛋白表达的差异倍数 (FC),
与血清素传递、卵巢类固醇生成途径等 (图 2-c)。
在磷酸化差异蛋白中,通过 GO 富集与 KEGG 结 果 显 示 , ACOX1 与 HADHA 在 poly(I:C) 刺
激后巨噬细胞中泛素化修饰水平下调最为显著,
通路富集中仅筛选出 1 条与脂质代谢相关的通
路,共计 1 个差异蛋白。该通路为脂肪分解代 DAGLα、ABCA1 和 PLD1 在泛素化修饰水平上
调 最 为 显 著 (表 4), 巨 噬 细 胞 中 cPLA2 在
谢途径,仅包括 1 个上调蛋白 cPLA2。
poly(I:C) 刺激后磷酸化水平显著上调。综上,
2.4 糖基化修饰差异蛋白鉴定与表达分析
ACOX1、 HADHA、 DAGLα、 ABCA1、 PLD1
为了检测糖基化修饰是否参与 poly(I:C) 刺 与 cPLA2 可能是 poly(I:C) 通过蛋白修饰调控脂
激下巨噬细胞脂质代谢的调控,对 N-糖基化与 质代谢的关键蛋白。
O-糖基化修饰组学数据中差异蛋白的表达、功 实验进一步使用 MS/MS 蛋白组学技术分
能和通路进行分析。结果显示,与 PBS 对照组 析和鉴定差异蛋白修饰位点,通过分析修饰位
相比,poly(I:C) 刺激后巨噬细胞中共鉴定到 点上下游固定 7 个氨基酸出现频率,以预测特
368 个 N-糖基化差异蛋白与 120 个 O-糖基化差 定的修饰位点的基序。脂质代谢相关的全部 15
https://www.china-fishery.cn 中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries
6

