Page 35 - 《水产学报》2025年第8期
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陆莉莉,等 水产学报, 2025, 49(8): 089603
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蛎的全甲基化水平低于半甲基化水平 ,这表 从而使大黄鱼适应环境变化 。Gavery 等 [39] 对
[38]
明半甲基化水平与全甲基化水平在不同物种中 长牡蛎的鳃组织进行了 DNA 甲基化研究,发现
的比例会因物种的不同而发生改变。 长牡蛎在应对应激反应以及适应不同环境时
MSAP 技术是在 AFLP 技术的基础上建立 DNA 甲基化参与了调控作用。本研究中,鳃组
起来的,主要针对同裂酶对识别位点 CCGG 的 织的甲基化水平最低,暗示 DNA 甲基化可能参
胞嘧啶检测,然而并非所有胞嘧啶甲基化的类 与了福建牡蛎对盐度适应的调节过程。
型都能被检测出来 。而全基因组重亚硫酸盐 有研究表明,在基因组多倍化后,DNA 甲
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测序 (WGBS) 能够对全基因组范围内的所有胞 基化水平的变化和模式的调整与维持基因组的
嘧啶位点进行检测,包括 CpG、CHG 和 CHH 稳定性以及核质重建平衡密切相关 [40-42] 。在多
等不同类型的甲基化位点,具有较高的准确性 倍体中,其甲基化模式的调整可以诱导某些基
和单碱基分辨率 。 因的激活或沉默,进而对相关基因的表达进行
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甲基化水平的差异对组织分化与生长发育 调节,引发表型变异,使多倍体更好地适应环
调控具有重要影响。无论是同一物种的不同组 境需要 [13, 43] 。在泥鳅的研究中,当启动子区的
织,还是不同物种的相同组织之间,其在 DNA DNA 甲基化水平降低时,与之相关的基因沉默
[44]
甲基化水平上都存在差异。何暮春等 [31] 的研究 现象得以解除 ;而当 DNA 甲基化处于高水平
[11]
发现,雌性金乌贼和雄性金乌贼肌肉、心脏、 时,发现有一些基因的表达被沉默 。Han 等 [19]
胰脏和性腺组织基因组甲基化水平存在差异现 的研究结果表明,刺参三倍体基因组的甲基化
[7]
象。姜群等 对长牡蛎的研究发现,鳃、闭壳 水平和模式发生了变化,其中,基因区域的高
肌、外套膜、唇瓣、性腺、消化盲囊的甲基化 甲基化水平能够增加转录装置,增强三倍体刺
水平为 31.77%~37.92%,并观察到不同组织之 参的生长和代谢。拟南芥 (Arabidopsis thaliana)
间甲基化水平差异显著。同一物种所呈现出的 基因组经甲基化修饰后,导致许多参与生殖 (减
组织甲基化特异性可能是在组织分化过程中形 数分裂、有丝分裂) 和适应 (应激反应) 的基因
成的,不同的甲基化模式会促使基因表达量不 表达上调,这可以提高异源四倍体的育性和稳
同,进而发挥不同的功能 。本研究中,福建 定性 。在本研究中,福建牡蛎三倍体的总甲
[43]
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牡蛎不同组织的甲基化水平和模式存在差异, 基化水平比二倍体升高了 0.51%~12.44%,且二
且不同组织间的表观遗传差异极显著。AMOVA 倍体和三倍体之间的表观遗传存在显著差异,
分析显示,二倍体福建牡蛎在鳃和性腺之间存 表明福建牡蛎三倍体可能是在生长发育过程中
在明显的甲基化差异,而三倍体福建牡蛎组织 基因组 DNA 发生了甲基化修饰变化。这种变化
间最大甲基化差异存在于鳃和闭壳肌之间。二 可能诱发了某些基因的沉默,进而调控基因表
倍体、三倍体福建牡蛎在同一组织中其甲基化 达来改变生物体表型,使得三倍体福建牡蛎更
模式不同。二倍体的性腺和闭壳肌在半甲基化 好地适应环境的需求。
水平上高于三倍体,而三倍体的性腺和闭壳肌 综上所述,本研究利用 F-MSAP 技术分析
在全甲基化上高于二倍体,这与 Jiang 等 [17] 研 了福建牡蛎二倍体和三倍体 4 种组织的 DNA 甲
究长牡蛎三倍体不同组织的结果相似。三倍体 基化差异,发现不同倍性不同组织间的表观遗
牡蛎通常具有性腺滞育、生长快的优势,其较 传存在显著差异,福建牡蛎三倍体发生了 DNA
高的全甲基化水平可能参与了生殖和肌肉发育 甲基化变化。研究结果增进了对牡蛎倍性改变
相关基因的表达调控,这或许与三倍体牡蛎的 后基因组甲基化状况的了解,也为进一步研究
这些优势性状有关。但具体机制还需要通过进 福建牡蛎倍性间的表观遗传机制提供了参考。
一步深入研究。
福建牡蛎属于广盐性贝类,能够适应低盐 参考文献 (References):
和高盐环境 。鳃组织是水盐交换的主要器官, [ 1 ] Song Q X, Chen Z J. Epigenetic and developmental regulation
[36]
可以调节渗透机制以适应环境盐度的变化 [37] 。 in plant polyploids[J]. Current Opinion in Plant Biology, 2015,
对大黄鱼 (Larimichthys crocea) 鳃组织研究发现, 24: 101-109.
DNA 甲基化参与调节相关基因的转录和表达, [ 2 ] Zhou H, Ma T Y, Zhang R, et al. Analysis of different ploidy
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