Page 32 - 《水产学报》2025年第8期
P. 32
陆莉莉,等 水产学报, 2025, 49(8): 089603
Ⅰ Ⅱ Ⅲ 2 结果
100 110 120 130 140 150
2.1 二倍体和三倍体不同组织基因组 DNA 甲
基化水平差异
EH
本研究采用 12 对选择性扩增引物从 40 个
样品中总共扩增出 13 341 到 39 131 条条带,共
检测到 1 388 到 3 871 个 MSL 位点,多态性比
率为 24.67%~77.08% (483~2 823)。在半甲基化
102.9 114.9 127.6 水平上,除外套膜外,二倍体鳃、性腺和闭壳
肌组织的半甲基化水平均高于三倍体 (图 2-a)。
在全甲基化水平上,外套膜和鳃组织是二倍体
100 110 120 130 140 150
高于三倍体,而在性腺和闭壳肌组织则是二倍
体低于三倍体,二倍体和三倍体各组织的半甲
基化水平 (3.28%~10.47%) 均低于全甲基化水平
EM
(11.26%~30.28%) (图 2-b)。在总甲基化水平上,
三倍体的外套膜、性腺和闭壳肌的总甲基化水
平高于二倍体,而三倍体的鳃低于二倍体;除
92.3 106.5 116.1 147.6 外套膜外,其他相同组织间的倍性差异与全甲
152.2 基化水平的趋势大体相同 (图 2-c)。
图 1 DNA 甲基化的三种模式
2.2 二倍体和三倍体群体不同组织间的表观遗
EH. EcoR Ⅰ/Hpa Ⅱ 酶切;EM. EcoR Ⅰ/Msp Ⅰ 酶切。
传分析
Fig. 1 Three modes of DNA methylation
EH. digested by EcoR I/Hpa II; EM. digested by EcoR I/Msp I. 对福建牡蛎二倍体和三倍体分别进行独立
分析,检测出 MSL 位点数分别为 1 729、1 843,
将 MSAP 结果中的位点分为甲基化敏感位点 其中多态性位点数分别为 1 700、1 823,MSL
(MSL) 和非甲基化位点 (NML) 。根据 Bonin 位点多态性水平分别为 98.32%、98.91%。二倍
[26]
等 [27] 提出的处理方法,对 MSL 位点的表观遗 体群体和三倍体群体的 AMOVA 分析结果显示,
传变异进行分析。福建牡蛎二倍体和三倍体不 二倍体和三倍体的各自组织间存在极显著差异
同 组 织 间 的 表 观 遗 传 变 异 利 用 主 坐 标 分 析 (P<0.000 1),且三倍体的表观遗传差异 (φST=
(PCoA) 和分子方差分析 (AMOVA,φST) 计算。 0.336 1) 比二倍体的大 (φST=0.175 3)。两两组织
二倍体 diploid
11 三倍体 triploid 35 35
10 30 二倍体 diploid 30 二倍体 diploid
三倍体 triploid
三倍体 triploid
9
甲基化水平/% methylation level 7 甲基化水平/% methylation level 20 甲基化水平/% methylation level 20
8
25
25
6
5
15
15
4
3
2
5
5
1 10 10
0 0 0
1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4
组织 组织 组织
tissue tissue tissue
(a) (b) (c)
图 2 福建牡蛎二倍体、三倍体不同组织的甲基化水平变化
(a) 半甲基化,(b) 全甲基化,(c) 总甲基化;1. 外套膜,2. 鳃,3. 性腺,4. 闭壳肌。
Fig. 2 Changes in methylation levels in diploid and triploid tissues of C. angulata
(a) hemimethylation, (b) full methylation, (c) total methylation; 1. mantle, 2. gill, 3. gonad, 4. adductor.
https://www.china-fishery.cn 中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries
4