Page 29 - 《水产学报》2025年第8期
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2025, 49(8): 089603 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA
DOI: 10.11964/jfc.20240414458
福建牡蛎二倍体和三倍体 DNA 甲基化分析
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陆莉莉 , 徐成勋 , 孔令锋 , 李 琪 1,2* 第一作者:陆莉莉,从事贝类遗传育
种研究,E-mail:lulili6526@163.com
1. 中国海洋大学,海水养殖教育部重点实验室,山东 青岛 266003;2. 青岛海洋
科学与技术试点国家实验室,海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东 青
岛 266237
摘要:
【目的】探讨福建牡蛎二倍体和三倍体不同组织中的基因组 DNA 的甲
基化状态。
【方法】实验采用荧光标记的甲基化敏感扩增多态性 (F-MSAP) 技术,
通信作者:李琪,从事贝类遗传育种
对福建牡蛎的 4 种组织 (外套膜、鳃、性腺和闭壳肌) 进行基因组 研究,E-mail:qili66@ouc.edu.cn
DNA 甲基化比较分析。 资助项目:山东省农业良种工程项目
【结果】共检测到 1 388 到 3 871 个甲基化敏感位点,二倍体和三倍体 (2022LZGCQY010);山东省重点研发
计划 (2022TZXD002)
群体的外套膜、鳃、性腺、闭壳肌 4 种组织的总甲基化水平分别为
收稿日期:2024-04-13
21.05% 和 21.73%、20.44% 和 18.65%、22.04% 和 22.55%、21.12% 和 修回日期:2024-08-28
33.56%,各组织之间有极显著的表观遗传差异。二倍体全甲基化水平 文章编号:
为 11.75%~12.84%,半甲基化水平为 7.60%~9.82%,总甲基化水平为 1000-0615(2025)08-089603-10
中图分类号:Q 75;S 968.3
20.44%~22.04%。三倍体全甲基化水平为 11.26%~30.28%,半甲基化水 文献标志码:A
平为 3.28%~10.47%,总甲基化水平为 18.65%~33.56%。三倍体的总甲 作者声明本文无利益冲突
基化水平比二倍体升高了 0.51%~12.44%,全甲基化为主要甲基化模式,
© 《水产学报》编辑部(CC BY-NC-ND 4.0)
二倍体和三倍体间的表观遗传差异极显著。 Copyright © Editorial Office of Journal of
Fisheries of China (CC BY-NC-ND 4.0)
【结论】福建牡蛎的外套膜、鳃、性腺以及闭壳肌组织具有不同程度
的甲基化水平。福建牡蛎三倍体发生了甲基化变化,这种变化可能影
响了基因表达的方式。本研究可为福建牡蛎多倍体的表观遗传研究提
供了参考资料。
关键词: 福建牡蛎;二倍体;三倍体;DNA 甲基化;荧光标记的甲基
化敏感扩增多态性 (F- MSAP)
在生物进化过程中,多倍体化是一种普遍存在的生物学现象,也
是形成新物种的重要驱动力 [1-2] 。研究发现,基因组的加倍导致大量基
因冗余,改变基因结构、表达和功能,影响遗传和表观遗传的作用机
制 [3-4] 。表观遗传学是指在基因 DNA 序列未发生改变的情况下,基因
[5]
功能发生了可遗传的变化,并最终导致表型的变化 。DNA 甲基化、
组蛋白修饰和非编码 RNA 调控是最常见的表观遗传机制 。DNA 甲
[6]
基化是表观遗传中研究最多的一种机制,其在剂量补偿、基因组印记、
染色质结构改变以及组织发育和分化等 [7-9] 过程中起着至关重要的作用,
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