Page 33 - 《水产学报》2025年第8期

陆莉莉，等 水产学报, 2025, 49(8): 089603

之间的 MSL 位点分析也表现出显著差异的结 表 2 两两组织之间 MSL 位点比较 φST 值
果 (表 2)。在二倍体群体中，鳃与性腺之间的 Tab. 2 Comparison of MSL loci between pairwise
φST 值是最高的，为 0.202 5，外套膜与闭壳肌 organizations φST value
之间的 φST 值最低，为 0.123 3，两两组织之间 外套膜 鳃 性腺 闭壳肌
表观遗传差异极显著 (P<0.000 1)。在三倍体群 mantle gill gonad adductor
外套膜 mantle * 0.146 8 0.124 2 0.123 3
体中，鳃和外套膜、性腺的差异低于二倍体，
鳃 gill 0.063 2 * 0.202 5 0.196 5
其余两两组织间的差异均高于二倍体，且差异
性腺 gonad 0.305 5 0.134 8 * 0.176 9
极显著 (P<0.000 1)。其中，鳃与闭壳肌的 φST 闭壳肌 adductor 0.231 7 0.370 9 0.305 5 *
值最高，为 0.370 9，鳃与外套膜的 φST 值最低， 注：对角线上方为二倍体，对角线下方为三倍体，组间数据显著
为 0.063 2。 差异。
PCoA 分析结果同样表现出组织间的表观 Notes: Diploid above the diagonal and triploid below the diagonal;
significant differences between groups.
遗传差异。二倍体群体不同组织的 PCoA 结果
显示，第一坐标轴和第二坐标轴分别占总方差 2 407，其中多态性位点数分别为 3 654、1 441、
的 9.3% 和 8.1%，可以识别 3 个不同的组，即 2 293、 1 844， MSL 位 点 多 态 性 水 平 分 别 为
(i) 鳃、(ii) 性腺、(iii) 外套膜和闭壳肌 (图 3-a)。 91.97%、 91.95%、 88.81%、 76.61%。 同 时 ，
可以看出鳃与其他组织明显分离，与 AMOVA
AMOVA 结果显示，福建牡蛎二倍体与三倍体
结果一致。三倍体群体中，第一坐标轴和第二
于同一组织内的表观遗传差异极显著，其中，外
坐标轴分别占总方差的 21.1% 和 8%，观察到鳃 套膜 φST= 0.070 0，鳃 φST= 0.145 4，性腺
φST=
与闭壳肌相对于其他组织有明显的分离 (图 3-b)， 0.157 7，闭壳肌 φST= 0.349 9，显著性水平均达
AMOVA 同样证实鳃与闭壳肌之间分离程度最
到 P<0.000 1。
大。其他组织也表现出轻微的分离。

福建牡蛎二倍体和三倍体闭壳肌组织的
2.3 二倍体和三倍体群体之间的表观遗传分析 PCoA 分析，二倍体组和三倍体组沿着第一坐
为进一步探讨福建牡蛎二倍体和三倍体之 标轴分离 (27.3% 差异)，这种较高的分化水平
间 CCGG 位点的胞嘧啶甲基化差异，对外套膜、 与 AMOVA 结果一致 (图 4)。外套膜、鳃和性
鳃、性腺、闭壳肌组织进行了 4 个独立分析， 腺组织，只能通过第二坐标轴观察到一些差异
检测出 MSL 位点数分别为 3 973、1 567、2 582、 (分别为 9%、11.3% 和 11% 差异)。

20 20

性腺 gonad
C2(8.1%) 鳃 gill
闭壳肌 adductor C2 (8%)
外套膜 mantle
10 10

0 0
−10 −5 0 5 10 15 20 −30 −20 −10 0 10 20
C1(9.3%) C1 ( 21.1 %)

−10 −10

−20 −20

(a) (b)
图 3 四种组织之间表观遗传分化的的主坐标分析
(a) 二倍体组，(b) 三倍体组。
Fig. 3 Principal coordinate analysis of epigenetic differentiation between four types of organizations
(a) diploid group, (b) triploid group.

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