Page 19 - 《中国药科大学学报》2025年第5期
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第  56 卷第  5 期             胡浙棋,等:第二代蛋白精氨酸甲基转移酶             5 抑制剂的研究进展                       551

               体衍射获得了       5 个复合物结构 。其中,片段             1(F1)   K   =  10  μmol/L;  PRMT5 •SAM  K   =  51  μmol/L;
                                          [18]
                                                                 d
                                                                                               d
               被选为苗头分子用于后续优化(图                3,PRMT5•MTA       LE/LLE = 0.54/4.9)。


                      A                  F327                   B
                                    E435
                                               K333
                                                  S578


                         MTA     L437
                                              W579
                                         E444


               图 3    片段  F1  与  PRMT5•MTA  的复合物晶体结构(PDB: 7S0U)
               A:片段  F1  在  PRMT5•MTA  中的结合模式,红色圆圈表示活性口袋中的酸性“双       E  环”,即  Glu435  和  Glu444,图中绿色棍状模型为  MTA,紫
               色棍状模型为片段     F1,橙色条带模型为    PRMT5  蛋白,绿色虚线表示氢键,橙色虚线表示在        π–π  堆积作用;B:蛋白表面静电势图,红色表示静
               电势为负值的区域,蓝色表示静电势为正值的区域,蓝色箭头表示片段的优化方向

                    由晶体结构可知,F1 分别与          PRMT5 的   Glu435    细胞的增殖(IC =10,12 nmol/L)和          sDMA   生成
                                                                               50
               侧链与    Lys333 侧链形成氢键。此外,F1 中质子化                  ( IC =3, 8  nmol/L) 均 有 较 强 的 抑 制 活 性 , 而 对
                                                                   50
               的伯胺分别与        Glu444 侧链形成离子键,与         Glu435    MTAP  野生型细胞的活性较弱(图             4)。在   CD-1 小
               主链羰基形成氢键,同时与             MTA  的硫原子形成紧            鼠、比格犬和食蟹猴中进一步评估了                   MRTX-9768

               密的范德华相互作用。观察               F1 的共晶结构发现            和  MRTX-1719 的药代动力学性质,显示               MRTX-
               F1 中酞嗪环的      6 位附近存在较大的空腔,适合作为                  1719 具有更好的口服生物利用度,因此研究团队
               片段生长点,随后他们探索了一系列五元、六元芳                           最终选择      MRTX-1719 做进一步的药效实验。在
               环和芳杂环,活性都有不同程度的提高,其中甲基                           MTAP/CDKN2A    缺失的    Lu-99 小鼠肺癌异种移植
               吡唑(1)的活性相比         F1 提高了    330 倍。通过化合          瘤模型中,MRTX-1719 剂量依赖性地抑制了小鼠
               物  1 的复合物晶体结构发现,甲基吡唑的                5 位是另       体内肿瘤的生长,在         50 和  100 mg/kg 的给药剂量下
               一个片段生长的位点,通过探索不同取代的芳环得                           (po,qd),肿瘤生长抑制率分别达到了              86%  和  88%。
               到了   MRTX-9768 和   MRTX-1719。细胞实验表明,             与体内药效结果一致,MRTX-1719 也显著降低了
               MRTX-9768 和    MRTX-1719 对 于    HCT-116 MTAP-null  肿瘤组织内的     sDMA  水平  [19−20] 。


                                NH 2                N         NH 2              N          NH 2
                                                   N                            N
                                N                      6      N                   5        N
                                NH                            NH                           NH
                               O                             O                           O
                              F1                         1                            2
                      PRMT5•MTA K d =10 μmol/L   PRMT5•MTA K d =5.0 nmol/L  HCT-116 MTAP-null  IC 50 =2 470 nmol/L



                           N          NH 2                N          NH 2                 N          NH 2
                          N                              N                               N
                       NC             N               NC             N                NC             N
                                                                     NH
                              F       NH                     F                               F       NH
                                    O                              O                  O            O
                                                                                            Cl
                               3                           MRTX-9768                     MRTX-1719
                     HCT-116 MTAP-null  IC 50 =761 nmol/L  HCT-116 MTAP-null  IC 50 =10.0 nmol/L  HCT-116 MTAP-null  IC 50 =8.0 nmol/L

               图 4    MRTX-1719  的结构衍变过程
               HCT-116 MTAP-null :MTAP  缺失的  HCT-116  细胞
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