Page 19 - 《中国药科大学学报》2025年第5期
P. 19
第 56 卷第 5 期 胡浙棋,等:第二代蛋白精氨酸甲基转移酶 5 抑制剂的研究进展 551
体衍射获得了 5 个复合物结构 。其中,片段 1(F1) K = 10 μmol/L; PRMT5 •SAM K = 51 μmol/L;
[18]
d
d
被选为苗头分子用于后续优化(图 3,PRMT5•MTA LE/LLE = 0.54/4.9)。
A F327 B
E435
K333
S578
MTA L437
W579
E444
图 3 片段 F1 与 PRMT5•MTA 的复合物晶体结构(PDB: 7S0U)
A:片段 F1 在 PRMT5•MTA 中的结合模式,红色圆圈表示活性口袋中的酸性“双 E 环”,即 Glu435 和 Glu444,图中绿色棍状模型为 MTA,紫
色棍状模型为片段 F1,橙色条带模型为 PRMT5 蛋白,绿色虚线表示氢键,橙色虚线表示在 π–π 堆积作用;B:蛋白表面静电势图,红色表示静
电势为负值的区域,蓝色表示静电势为正值的区域,蓝色箭头表示片段的优化方向
由晶体结构可知,F1 分别与 PRMT5 的 Glu435 细胞的增殖(IC =10,12 nmol/L)和 sDMA 生成
50
侧链与 Lys333 侧链形成氢键。此外,F1 中质子化 ( IC =3, 8 nmol/L) 均 有 较 强 的 抑 制 活 性 , 而 对
50
的伯胺分别与 Glu444 侧链形成离子键,与 Glu435 MTAP 野生型细胞的活性较弱(图 4)。在 CD-1 小
主链羰基形成氢键,同时与 MTA 的硫原子形成紧 鼠、比格犬和食蟹猴中进一步评估了 MRTX-9768
密的范德华相互作用。观察 F1 的共晶结构发现 和 MRTX-1719 的药代动力学性质,显示 MRTX-
F1 中酞嗪环的 6 位附近存在较大的空腔,适合作为 1719 具有更好的口服生物利用度,因此研究团队
片段生长点,随后他们探索了一系列五元、六元芳 最终选择 MRTX-1719 做进一步的药效实验。在
环和芳杂环,活性都有不同程度的提高,其中甲基 MTAP/CDKN2A 缺失的 Lu-99 小鼠肺癌异种移植
吡唑(1)的活性相比 F1 提高了 330 倍。通过化合 瘤模型中,MRTX-1719 剂量依赖性地抑制了小鼠
物 1 的复合物晶体结构发现,甲基吡唑的 5 位是另 体内肿瘤的生长,在 50 和 100 mg/kg 的给药剂量下
一个片段生长的位点,通过探索不同取代的芳环得 (po,qd),肿瘤生长抑制率分别达到了 86% 和 88%。
到了 MRTX-9768 和 MRTX-1719。细胞实验表明, 与体内药效结果一致,MRTX-1719 也显著降低了
MRTX-9768 和 MRTX-1719 对 于 HCT-116 MTAP-null 肿瘤组织内的 sDMA 水平 [19−20] 。
NH 2 N NH 2 N NH 2
N N
N 6 N 5 N
NH NH NH
O O O
F1 1 2
PRMT5•MTA K d =10 μmol/L PRMT5•MTA K d =5.0 nmol/L HCT-116 MTAP-null IC 50 =2 470 nmol/L
N NH 2 N NH 2 N NH 2
N N N
NC N NC N NC N
NH
F NH F F NH
O O O O
Cl
3 MRTX-9768 MRTX-1719
HCT-116 MTAP-null IC 50 =761 nmol/L HCT-116 MTAP-null IC 50 =10.0 nmol/L HCT-116 MTAP-null IC 50 =8.0 nmol/L
图 4 MRTX-1719 的结构衍变过程
HCT-116 MTAP-null :MTAP 缺失的 HCT-116 细胞

