Page 212 - 《水产学报》2026年第3期
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3 期          吕彬彬,等:SGT1      介导自噬和凋亡促进罗氏沼虾抗氧化系统抵御嗜水气单胞菌感染                                50 卷

              物科技    (上海) 股份有限公司         ],兔抗   ATG5  多克       织的混合     cDNA  为模板对    MrSGT1  的序列进行特
              隆抗体和兔抗       Beclin1  多克隆抗体    (实验室前期制           异性扩增。PCR       扩增体系:cDNA 1 μL,SGT1-F
              备 ), Western  及  IP  细 胞 裂 解 液 、 β-Actin  Rabbit  2 μL,SGT1-R 2 μL,Green Taq Mix 10 μL,双蒸
              Monoclonal Antibody、碱性磷酸酯酶标记山羊抗                  水 (dd H O) 5 μL。PCR  扩增条件:94 ℃,5 min;
                                                                      2
              兔  IgG (H+L)、丙二醛     (MDA) 检测试剂盒、总抗              94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,35  个循环;72
              氧化能力检测试剂盒 (FRAP          法)、过氧化氢酶检测              ℃,10 min。使用      1%  琼脂糖凝胶电泳分离          PCR
              试剂盒    (上海碧云天生物技术股份有限公司)。                        产物,采用无菌的手术刀片将产物切胶回收,并
                                                               使用胶回收试剂盒提取            PCR  产物,将    PCR  产物
               1.2    实验方法
                                                               连接至   pMD 18-T   载体,随后转化至大肠杆菌并
                                                                          TM
                    基因克隆与生物信息学分析  根据                  RNA      培养,挑取单菌落进行菌落             PCR  验证。将验证通
              提取试剂盒说明书,从健康罗氏沼虾的不同组织                            过后的菌液送至广州艾基生物技术有限公司测序
              中提取总     RNA,并通过超微量核酸蛋白检测仪检                      验证  MrSGT1  的序列正确性。
              测  RNA  的质量和浓度。再按照            PrimeScript™ Ⅱ         MrSGT1  基因的序列相似性分析通过               NCBI
              1st Strand cDNA Synthesis Kit 试剂盒说明书将提取          数据库 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) 提供的  BLAST
              的  RNA  反转录为    cDNA  后,置于−20 ℃     保存。          程序进行。多序列比对采用                Clustal X  和  DNA-
                   从本实验室前期获得的罗氏沼虾转录组数据                         MAN  软 件 完 成 。 使 用    SWISS-PROT  在 线 工 具
              中筛选得到      MrSGT1  的基因开放阅读框 (ORF) 序              (https://web.expasy.org/cgi-bin/compute_pi/pi_tool)
              列,并基于此序列在           NCBI 中下载     MrSGT1  的基      分析蛋白的等电点         (pI) 和分子质量    (Mw)。潜在的
              因全长序列。利用          Primer Premier 5  软件设计扩增       磷 酸 化 位 点 和 糖 基 化 位 点 通 过     NetNGlyc 平 台
              MrSGT1  的特异性引物       (表  1)。以罗氏沼虾不同组             (http://www.cbs.dtu.dk/services/) 进行分析。SignalP


                                                      表 1    引物信息
                                                  Tab. 1    Primer information
                引物名称             序列 (5′―3′)           用途       引物名称             序列 (5′―3′)          用途
               primer name      sequences (5′―3′)   application  primer name  sequences (5′―3′)    application
                SGT1-F   ATGAATGAAAATGGCAGTG      基因克隆        qRT-PCR-  AAACAGTTGTGGATGGGTCTTT   实时荧光定量
                                                  gene clone  ATG5-F                             PCR
                SGT1-R   TCACTGGTTCCACTTTTTGTATTC             qRT-PCR-  TTCCCCTATGGTATCTGGTAAG   qRT-PCR
                                                              ATG5-R
                qRT-PCR-  TTATCCATCGTCTGCTTCTA    实时荧光定量      qRT-PCR-  GAAGCACGAGGAGGAGAAAGCA
                SGT1-F                            PCR         Beclin1-F
                qRT-PCR-  TGACTTATTCATTGCTCTCT    qRT-PCR     qRT-PCR-  CCGAAGTGACCGGAGTACCAGA
                SGT1-R                                        Beclin1-R
                qRT-PCR-  ATGTCATGGTGGAAGAAGAG                qRT-PCR-  CTGAATATGCAGAGAATGGAGG
                EF-1α-F [22]                                  LC3-F
                qRT-PCR-  AAAGTTGACCACCATACCAG                qRT-PCR-  GACAATGTGTAAGAACTGGGAC
                EF-1α-R [22]                                  LC3-R
                qRT-PCR-  TGAAACAGAGGAACGCAGGA                dsMrSGT1-F GATTGGTATCAAACGGAATCCCAT  RNA干扰
                bax-F                                                                            RNA
                qRT-PCR-  CTACTAAATACTTCCACGACCACG            dsMrSGT1-R TCACTGGTTCCACTTTTTGTATTCC  interference
                bax-R
                qRT-PCR-  CAGGCGGCAAACACAAGAC                 dsMrSGT1-  TAATACGACTCACTATAGGGAGAGA
                cytc-F                                        T7-F     TTGGTATCAAACGGAATCCCAT
                qRT-PCR-  AAGGTAGGCTATCAAATCGGC               dsMrSGT1-  TAATACGACTCACTATAGGGAGATC
                cytc-R                                        T7-R     ACTGGTTCCACTTTTTGTATTCC
                qRT-PCR-  TGAGGCACTGGTCTTGTCCAGAAT            dsGFP-F [23]  GTGCCCATCCTGGTCGAGCT
                caspase 3-F
                qRT-PCR-  GGCACTTGCATTGACTGCTGGATT            dsGFP-R [23]  GCACGCTGCCGTCCTCGAT
                caspase 3-R
                qRT-PCR-  TTGAAGGAGACAAACCCGT                 dsGFP-T7-F TAATACGACTCACTATAGGGAGAGT
                ATG12-F                                                GCCCATCCTGGTCGAGCT
                qRT-PCR-  CCATCTGAACCAAAGCACT                 dsGFP-T7-R TAATACGACTCACTATAGGGAGAGC
                ATG12-R                                                ACGCTGCCGTCCTCGAT

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
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