Page 202 - 《水产学报》2026年第3期

3 期 聂 蒙，等：罗非鱼源无乳链球菌缺失株 ΔcrRNA 与 ΔcpsE 的毒力与免疫效力 50 卷

分离时间、地理来源、血清型及多位点序列分型 多态性 (SNP) 分析，并运用 IQ-TREE 软件 (v2.3.6)
(MLST) 信息均来源于已发表文献。对于 MLST 分 基于最大似然法构建系统发育树 ，利用 tvBOT
[19]
型未明确的菌株，使用 pubMLST 数据库 (https:// 工具进行分析结果的可视化 。所有分析均遵循
[20]
pubmlst.org/) 提供的在线分析工具进行分型鉴定。 标准生物信息学流程，确保数据处理的可靠性和
采用 snippy 软件 (v4.6.0) 进行全基因组单核苷酸 可重复性。

血清型 serotype 分离地区 location 分离时间

多位点分型 NCBI登录号 isolation year
MLST NCBI accession 2005 2010 2015 2020
FNA07 GCF_000715295.1
FPrA02 GCF_000715315.1
ENC06 GCF_000714695.1
CS2108 GCF_029917085.1
WC1535 GCF_001729925.2
TFJ0901 GCF_003939065.1
HN016 GCF_001190805.1 多位点分型
YM001 GCF_001190825.1 MLST
GX064 GCF_001190845.1
GD201008-001 GCF_000299135.1 7
HZAUSC001 GCF_001675305.1 260
ZQ0910 GCF_011383065.1
QMA0271 GCA_003186145.1 261
GX026 GCA_001190865.1 552
GBS2-22 GCA_000967445.1
138P GCA_000599965.1 927
138spar GCA_000636115.1 1623
STIR-CD-17 GCA_000295815.1
SA97 GCA_002881935.1 血清型
SA102 GCA_002881395.1 serotype
SA85 GCA_002881355.1
SA53 GCA_002881235.1 Ia
SA75 GCA_002881865.1 Ib
SA136 GCA_002881415.1
SA73 GCA_002881195.1
SA132 GCA_002882035.1 分离地区
SA245 GCA_002881555.1 location
SA191 GCA_002882125.1 美国 USA
SA256 GCA_002881575.1 中国 China
SA81 GCA_002881335.1
SA20 GCA_000302475.3 泰国 Thailand
SA1 GCA_002881215.1 以色列 Israel
SA5 GCA_002881255.1
SA9 GCA_002881275.1 澳大利亚 Australia
SA212 GCA_002882275.1 巴西 Brazil
SA330 GCA_002882375.1
SA374 GCA_002881695.1 洪都拉斯 Honduras
SA623 GCA_002882835.1
SA195 GCA_002881475.1 自展值
SA16 GCA_002881295.1 bootstrap values
SA159 GCA_002881435.1 >90%
SA33 GCA_002881175.1 70~90%
SA79 GCA_002881315.1
SA341 GCA_002882555.1
S13 GCA_001908255.1
SA333 GCA_002882465.1
SA184 GCA_002881455.1
0.001 SA201 GCA_002882205.1
SA209 GCA_002881495.1
图 1 基于核心基因组 SNP 的鱼源无乳链球菌系统发育树
Fig. 1 The phylogenetic tree of piscine S. agalactiae constructed based on core-genome SNPs

1.6 荚膜染色 20% 硫酸铜洗去结晶紫染料，并立即油浸，置于
显微镜下观察拍照。
将对数生长期的新鲜菌液滴在干净的载玻片
上，均匀涂布后自然风干。使用 1% 结晶紫染色 1.7 半数致死量 (LD ) 测定
50
7 min 左右，用滤纸吸取多余染液后，再使用 实验前 1 d，取保藏于−80 ℃ 的菌种划线接种

中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries https://www.china-fishery.cn
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