Page 230 - 《水产学报》2026年第2期
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2 期          刘威彤,等:传染性胰脏坏死病毒             (IPNV) 检测及区分   1、5  基因型方法的建立及应用                 50 卷

               2.6    样本检测及基因分型                                      表 4    30  份样本荧光定量  PCR  检测结果
                   为了评估本研究建立方法的准确性,对实验                          Tab. 4    The results of fluorescence quantitative PCR
              室保存的     30  份细胞培养样本进行检测及基因分型。                    样本编号    C t 值1  C t 值2  平均值  检测结果   基因型
                                                                sample  cycles 1  cycles 2  average  detection  genogroup
              所有样本均通过         CHSE-214  细胞分离培养和        VP2        no.                 value  result
              基因   Sanger 测序预先验证其样本结果及基因型,                        1     18.65  18.56  18.61   P       1
              22  份为  IPNV  阳性,8   份为   IPNV  阴性,其中     3、        2     25.11  24.32  24.72   P       1
              9  和  17  为  IPNV 5,其余为  IPNV 1。RT-qPCR   结         3     20.68  20.49  20.59   P       5
                                               t
              果显示,1~22      号阳性样本的平均          C 值为   14.75~       4     24.42  24.57  24.50   P       1
              24.72,C 值均≤35     且出现典型的扩增曲线,另                      5     24.59  24.64  24.62   P       1
                      t
              外  8  份阴性样本均显示出了阴性结果,无                C 值和          6     14.63  14.87  14.75   P       1
                                                     t
              典型的扩增曲线        (表  4)。                              7     20.98  21.1   21.04   P       1
                                                                  8     17.23  16.49  16.86   P       1
                   PCR  分 型 结 果 显 示 , 用   IPNV  5  检 测 引 物
                                                                  9     21.94  20.99  21.47   P       5
              PCR  扩增后,编号为        3、9  和  17  泳道出现特异性
                                                                  10    21.74  21.71  21.73   P       1
              条带,与预期的目标条带              543 bp  相对应  (图  6);
                                                                  11    22.91  22.40  22.66   P       1
              用  IPNV 1  分型引物    PCR  扩增后,除编号为        3、9
                                                                  12    21.74  21.72  21.73   P       1
              和  17  泳道均出现特异性条带,与预期的目的条带
                                                                  13    20.95  21.03  20.99   P       1
              502 bp  相对应。对   22  株  IPNV  的  VP2  基因序列进行
                                                                  14    21.13  20.59  20.86   P       1
              系统发育分析,结果显示,这些毒株聚集为                    2  个不
                                                                  15    18.66  19.03  18.85   P       1
              同的基因型,19       株  IPNV 1  聚为一簇,3    株  IPNV 5
                                                                  16    20.01  19.71  19.86   P       1
              聚为一簇,与       PCR  分型鉴定结果相一致(图          7)。对
                                                                  17    21.52  21.40  21.46   P       5
              30  份样本检测结果的符合率均为              100%,说明本
                                                                  18    23.07  22.97  23.02   P       1
              研究建立的检测及分型方法具有较高的准确性。
                                                                  19    21.50  21.23  21.37   P       1
               3    讨论                                            20    22.46  22.52  22.49   P       1
                                                                  21    21.61  22.35  21.98   P       1
                   IPNV  能够通过垂直和水平传播的方式对宿                         22    17.25  16.97  17.11   P       1
              主鱼类进行感染,疾病暴发后,幸存的鱼可能会                               23      -     -      -      N       -
              成为病毒无症状携带者,终身携带病毒,对子代                               24      -     -      -      N       -
              和其他易感鱼类均造成极大的感染风险。目前,                               25      -     -      -      N       -
              根据   VP2/NS  连接区的核苷酸序列比较,水生                         26      -     -      -      N       -
              RNA  病 毒 被 分 为    7  个 基 因 型 , 基 因 型   1~6  的       27      -     -      -      N       -
                                             [9]
              IPNV  核苷酸相似性最低为          81.2% ,基因型      7  主       28      -     -      -      N       -
              要感染海洋鱼类,与基因型              1~6  的核苷酸序列差              29      -     -      -      N       -
                     [10]
              异最大 。目前,1          型和  5  型  IPNV  被普遍报道,           30      -     -      -      N       -
              于美国、加拿大、墨西哥、智利和西班牙等国家                            注:P. IPNV阳性,N. IPNV阴性,1. 基因1型,5. 基因5型,-. 无C t
                                                               值或基因型。
              分离鉴定到      IPNV 1,于土耳其、意大利、挪威、
                                                               Notes: P. IPNV positive, N. IPNV negative, 1. genogroup 1, 5.
              芬兰、苏格兰和伊朗等国家分离鉴定到                    IPNV 5,     genogroup 5, -. no C t  value or genogroup.
              且近年这两种基因型           IPNV  分离株的数量还在不
              断上升    [22–25] ,是目前威胁我国鲑鳟养殖场的主要                  点,开发特异性强、灵敏度高、快速便捷的检测
              毒株,均可导致田间鲑鳟幼鱼大量死亡 。上述                            及区分   1、5  基因型的方法对该疾病的预防和控制
                                                  [16]
              两种基因型       IPNV  毒株间核苷酸序列差异较大,                  具有重要意义。
              Tapid  等  [26]  发现虹鳟感染这两种基因型       IPNV  后表          我国   IPNV  检测的国家标准《鱼类检疫方法
              现出不同的转录组图谱及不同的死亡率和病毒载                            第一部分:传染性胰脏坏死病毒                (IPNV)》(GB/T
              量 [27] 。因此,针对     IPNV  的基因型特征和传播特               15805.1—2008) 规定,将组织样本接种到虹鳟性

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
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