Page 196 - 《水产学报》2025年第11期
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葛恒,等 水产学报, 2025, 49(11): 119616
表 2 大口黑鲈肠道文库测序质量统计
Tab. 2 Sequencing quality statistics of libraries in the intestine of M. salmoides
时间 组别 有效读长 Q20的碱基数比例 Q30的碱基数比例
time group clean reads Q20 Q30
48 h 0 bl/s 38 203 334 97.58 95.51
2.5 bl/s 43 179 332 97.52 95.44
4.5 bl/s 42 159 222 97.65 95.67
6.5 bl/s 40 590 790 97.67 95.71
6 w 0 bl/s 41 991 394 98.06 96.29
2.5 bl/s 41 342 746 97.56 95.54
4.5 bl/s 39 325 412 97.57 95.51
6.5 bl/s 38 421 228 97.62 95.61
和生长相关的 DEGs 进行 q-PCR 验证。q-PCR
上调基因 up 171 和 相 对 于 静 水 组 dmgdh 的 表 达 上 调 ; il4i1 和
结果显示,流速处理
48 h,流速组
RNA-seq
下调基因 down
200
差异基因数量 number of differential genes 150 121 53 81 60 77 72 142 106 134 124 151 cdkn1a 表达下调;chs1 在 2.5 和 bhmt 和 cat 的表
6.5 bl/s 组中表
达下调,而在
4.5 bl/s 组表达上调。流速处理
100
6
w,流速处理组相对于静水组
50
和
0
LF
MF HF
6.5 bl/s 组表达上调,而在
4.5 bl/s 组表达下调。
48 h LF MF HF 达上调;cyp24a1 的表达下调;il4i1 在 2.5 分析
6 h
结果与大口黑鲈肠道组织
组别 q-PCR RNA-Seq
groups 结果相一致,证明 RNA-Seq 分析结果可信 (表 5)。
(a)
3 讨论
CK vs. LF CK vs. MF
12 流速在水产养殖中可直接影响养殖水体中
141 81
6 的溶解氧含量、营养物质输送、废物排放等,
15 43 与养殖水质密切相关 [15-17] 。近年来,一些研究表
86 明,适宜的水流速度还对鱼类产生积极效应,
提高摄食与生长、增强新陈代谢与免疫功能 [18-19] 。
CK VS HF
(b) 本研究中,2.5 bl/s 提高了大口黑鲈幼鱼生长速
CK vs. LF CK vs. MF 率,降低死亡率。类似地,史氏鲟 (Acipenser
31 schrenckii) 稚鱼在 0.18 m/s 流速下的特定生长率
194 109
是 0.06 m/s 流速下的 1.3 倍 。0.5~1.0 bl/s 流速
[20]
61
28 40 显著提升了北美牙鲆 (Paralichthys californicus)
的生长效率 [21] 。红鳍银鲫 (Barbodes schwanen-
147
feldi) 生长率在 0.7 bl/s 流速下显著升高,2 bl/s
CK vs. HF 流速下受到抑制 [22] 。2.5 bl/s 流速显著提高鲤
(c)
[23]
(Cyprinus carpio) 增重率和特定生长率 。(9.57±
图 5 大口黑鲈肠道差异基因数量统计 (a) 和
0.09) cm 许氏平鲉 (Sebastes schlegelii) 最佳生长
差异基因维恩图 (b)~(c)
[24]
流速为 1.5 bl/s 。溪红点鲑 (Salvelinus fontin-
Fig. 5 The differential gene counts (a) and
alus) 在 0、0.85、1.72 和 2.50 bl/s 流速下运动训
differential gene Venn diagrams (b)-(c) in
intestinal of M. salmoides 练 20 d 后,0.85 bl/s 流速组生长率最高 [25] 。大
CK. 0 bl/s, LF. 2.5 bl/s, MF. 4.5 bl/s, HF. 6.5 bl/s. 西洋鲑在 0.5 bl/s 流速下运动训练 8 w 后,生长
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