Page 201 - 《水产学报》2025年第8期
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王玲,等 水产学报, 2025, 49(8): 089417
表 2 4 种 PAMPs 刺激下长牡蛎血淋巴细胞 FPKM 变化平均值前 10 位基因
Tab. 2 The average change of FPKM of the top 10 genes after the stimulation of four PAMPs
基因名称/ID 对照组 脂多糖 肽聚糖 葡聚糖 聚肌胞苷酸 平均值
gene name control LPS PGN GLU Poly(I:C) average
CgSVIP(CGI_10 018 422) 0 29.801 8 64.900 6 42.054 290.996 106.938
CgCKS1(CGI_10 016 542) 0 21.160 4 6.306 06 37.585 8 257.15 80.551
CgORP8(CGI_10 019 515) 0 136.488 119.5 1.773 87 36.192 9 73.489
CGI_10 004 281 0 105.936 42.467 1 35.764 4 76.047 7 65.054
CGI_10 015 431 0 137.897 16.816 9 19.342 74.557 4 62.153
CGI_10 000 031 0 15.781 1 11.701 8 13.459 7 145.246 46.547
CgSTPG2(CGI_10 026 062) 0 48.506 6 54.363 5 11.510 9 68.695 5 45.769
CGI_10 004 238 0 30.501 4 79.503 6 22.672 42.120 5 43.699
CGI_10 010 288 0 34.114 5 2.315 5 10.591 93.792 9 35.203
CGI_10 000 271 0 84.930 3 11.026 1 2.037 5 17.578 1 32.665
(图 1)。结果提示,CgSVIP 的 mRNA 表达水平 分子质量大小为 8.899 ku,理论等电点为 7.76。
在不同 PAMPs 刺激后均出现显著变化,可能为 对不同物种的氨基酸序列构建系统发育树,
长牡蛎病害预警的潜在生物标志物。 CgSVIP 与无脊椎动物的 SVIP 有更密切的进化
关系,CgSVIP 首先与大堡礁海绵 (Amphimedon
3 c c queenslandica) 聚为一支,后与虾夷扇贝 (Mizu-
CgSVIP 的相对表达水平 relative expression levels of CgSVIP 2 1 a bc b 氨基酸序列比对结果显示,CgSVIP 氨基酸序列的
2)。
hopecten yessoensis) 和黑腹果蝇聚为一支(图
与大堡礁海
绵、黑腹果蝇和虾夷扇贝的
SVIP
44.71% (图
3)。
和
相似性分别为
45.68%、45.12%
黑腹果蝇 D. melanogaster
30
0
2
1
5
4
3
85 14 长牡蛎 C. gigas 虾夷扇贝 M. yessoensis
病原体相关分子模式
PAMPs 大堡礁海绵 A. queenslandica
图 1 4 种 PAMPs 刺激 12 h 后长牡蛎血淋巴细胞中
CgSVIP 的 mRNA 相对表达水平 斑马鱼 Danio rerio
1. 海水,2. 脂多糖,3. 肽聚糖,4. 葡聚糖,5. 聚肌胞苷酸。不同
热带爪蟾 Xenopus tropicalis
小写字母表示组间具有显著差异 (P<0.05),下同。
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Fig. 1 The relative mRNA expression levels of 人 H. sapiens
100
CgSVIP after the stimulation of four PAMPs in C. gigas
小鼠 M. musculus
1. SW, 2. LPS, 3. PGN, 4. GLU, 5. Poly(I:C). Different lowercase letters
indicate significant differences among groups (P<0.05), the same below. 0.1
图 2 长牡蛎与其他物种 SVIP 基因系统进化树
Fig. 2 The phylogenetic tree of SVIP gene from
2.2 CgSVIP 的分子特征及系统发育关系
C. gigas and other species
通过 4 种 PAMPs 刺激长牡蛎血淋巴细胞
转录组数据及其 mRNA 表达水平分析发现,
2.3 长牡蛎 CgSVIP mRNA 绝对定量标准曲线
CgSVIP 出现显著表达水平变化,因此对 CgS-
VIP 基因进行分子结构和进化特征分析。结果 为了解析 CgSVIP 作为长牡蛎病害预警潜
显示,CgSVIP 全长 789 bp,开放阅读框 243 bp, 在生物标志物的 mRNA 绝对表达量变化,实验
编码 80 个氨基酸 (aa) 的多肽,预测蛋白相对 构建了长牡蛎 CgSVIP mRNA 绝对定量标准曲
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