Page 199 - 《水产学报》2025年第8期
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王玲,等                                                                  水产学报, 2025, 49(8): 089417


                                                     表 1    实验所用引物
                                             Tab. 1    The primers used in this study
                          引物                                序列 (5′–3′)                         用途
                         primer                           sequence (5′–3′)                     usage
                      CgSVIP-F                  ACGACATACTGCTCTGTGCT                         PCR
                      CgSVIP-R                  GGCACAAGCTCAAAAAGGCA                         PCR
                      CgSVIP-Ex-F               CGCGGATCCATGGGAATTTGTCTGCCGTGT               PCR
                      CgSVIP-Ex-R               CCGCTCGAGACTAACTTGCCACCTAAGTCC               PCR
                      CgSVIP-RT-F               AACCAAGCCCTGAGACAAGG                         RT-qPCR
                      CgSVIP-RT-R               CCTCCTGACTGCTCTGCTTT                         RT-qPCR
                      CgLC3-RT-F                AGGAACAGCAGCTACCTATGC                        RT-qPCR
                      CgLC3-RT-R                TGGAGTTCAGTGACATTCGGTT                       RT-qPCR
                      CgP62-RT-F                AAGCTGCAGACAGATGGACC                         RT-qPCR
                      CgP62-RT-R                CTTGGCTCTGGTCTGGATGG                         RT-qPCR
                      CgATG5-RT-F               GGAGGCTGACTCACTGAAGC                         RT-qPCR
                      CgATG5-RT-R               CAGAGATTGGTGGTGCCCTT                         RT-qPCR
                      CgBeclin1-RT-F            AAATGCTGCTTGGGGTCAGA                         RT-qPCR
                      CgBeclin1-RT-R            CGGAATCCACCAGACCCATA                         RT-qPCR
                      CgEF-RT-F                 AGTCACCAAGGCTGCACAGAAAG                      RT-qPCR
                      CgEF-RT-R                 TCCGACGTATTTCTTTGCGATGT                      RT-qPCR
                      CgSVIP-sense              GGAAUUUGUCUGCCGUGUUTT                        RNAi
                      CgSVIP- antisense         AACACGGCAGACAAAUUCCTT                        RNAi
                      NC-sense                  UUCUCCGAACGUGUCACGUTT                        RNAi
                      NC-antisense              ACGUGACACGUUCGGAGAATT                        RNAi

              (http://smart.embl-heidelberg.de/) 预 测  CgSVIP  的  定量的结果描述为每毫升血淋巴细胞中                    CgS-
                                                                                                        [14]
              保守结构域。利用          Gene Doc(https://genedoc.soft-  VIP  拷贝数的以    10  为底的对数     [lg(拷贝/mL)] 。

              ware.informer.com/) 程序进行氨基酸多序列比对
                                                               1.6    重组  CgSVIP  蛋白的表达和纯化及其抗体
              分 析 。 利 用      MEGA  6.0(https://www.megasoft-   制备
              ware.net) 软件进行系统进化树分析。

                                                                   使用酶切引物        CgSVIP-Ex-F  和  CgSVIP-Ex-
              1.5    CgSVIP mRNA  绝对定量标准曲线制定                   R(表  1),并由生工生物工程          (上海) 股份有限公
                   将测序正确的连接重组              pMD-19T  质粒的        司合成,扩增        CgSVIP  的开放阅读框        (ORF) 序
              Trans5α  大肠杆菌的菌液过夜培养,并利用                 San-    列。克隆得到的         CgSVIP  基因片段分别连接到
              Prep  柱式质粒    DNA  小量抽提试剂盒         [ 生工生物        带有   1  个  GST-tag (26 ku) 的  pGEX4T-1  表达载
              工程    (上海) 股份有限公司          ] 提取质粒,使用             体上,构建重组质粒           pGEX4T-1-SVIP,将构建
              Nanodrop 2000  超微量紫外可见光分光光度计测                    的 重 组 质 粒 转 化 到 感 受 态         Transetta  (DE3)
              定提取的质粒浓度,计算标准质粒浓度的基因                             (TaKaRa,日本) 中,通过         GST-tag  蛋白融合纯
              拷贝数,计算公式:标准质粒浓度的基因拷贝                             化系统以及亲和层析技术纯化蛋白。用                    BCA  试
              数 =C×6.02×10 /[(载 体 碱 基 数 +目 的 片 段 碱 基           剂盒 (Beyotime,中国) 进行浓度定量后,通过
                           23
                         9
              数)×660×10 ](C  为  1 μL  质粒浓度)。将标准质粒              12.5% SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳             (SDS-PAGE)
                      1
              按照   10 ~10 倍梯度稀释作为制定标准曲线的                       分析纯化后的重组蛋白,将纯化后的重组蛋白
                         9
              RT-qPCR  的梯度    DNA  模板。构建     C 值与  CgSVIP      储存在−80 ℃。CgSVIP       多克隆抗体制备参照实
                                              t
              初始模板浓度拷贝数的对数的标准曲线,绝对                             验室已发表方法 并利用             Western blot 分析所制
                                                                              [27]
              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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