Page 19 - 《中国药科大学学报》2026年第2期
P. 19

第  57 卷第  2 期               尹莹莹,等:链霉菌细胞色素         P450 酶的功能及改造和应用                          145

               P450 酶在多种链霉菌来源的天然产物生物合成中                         芽孢杆菌      (Bacillus megaterium) 来源的“明星酶”
               的催化反应类型。同时,针对               P450 酶实际应用中          P450 BM3 (CYP102A1) 为例(图   1-A),3 个平行螺旋
               存在的困境,总结相关的改造策略,为推动                    P450 酶    D、L、I 和反平行螺旋        E  组成的四螺旋束结构与催
               的工业化应用提供参考。                                      化活性密切相关。F          与  G  螺旋则是底物结合口袋
                                                                的关键组成部分,连接          F  与  G  螺旋的  F-G  环高度柔
                1    细胞色素  P450 酶概述
                                                                性,通过构象变化调节口袋的开合以协助底物的进
                    P450 酶的二级结构以         α  螺旋为主,以巨大            入和产物的释放 。
                                                                               [4]

                      A                                              B                     亚铁血红素结构域

                                                                           铁氧还蛋白
                                  D
                                     L    J
                                                                                     Heme
                                    E    I                                        C
                                          K                         连接子2
                                                                         [2Fe-2S]
                                       F                                                          底物通道
                                     G            A
                           H                                                                  N
                                      B’        B                       FMN

                                  C                                                          连接子1

                                                                         还原酶结构域
               图 1    P450  酶晶体结构
               A:P450 BM 亚铁血红素结构域  (PDB ID:7W97);B:CYP116B46  晶体结构  (PDB ID:6LAA)
                     3

                    在三维结构上,P450 酶依赖与还原伴侣蛋白或                     Ⅰ 。该复合物从底物            RH  夺取一个氢(决速步),
                                                                  [6]
               还原酶结构域的相互作用完成电子传递。以嗜热温                           形成   R•后通过自由基回弹形成最终羟基化的产
               热菌   (Tepidiphilus thermophilus) 来源的  CYP116B46  物。反应可能因各种因素导致                 NAD(P)H  解偶联
               为例 ,该蛋白是首个全长结构得以解析的“自给                           (图  2 中以虚线表示),复杂的电子传递过程是
                    [5]
               自足”型    P450 酶(图   1-B)。酶中的亚铁血红素结                P450 酶催化效率普遍较低的重要原因之一 。此
                                                                                                        [7]
               构域、含     FMN  的铁氧还蛋白还原酶             (ferredoxin  外,反应依赖的辅因子           NAD(P)H  价格昂贵,进一步
               reductase,FdR) 结构域、含     [2Fe-2S] 铁硫簇的铁氧         阻碍了    P450 酶的实际应用。过氧化物分流途径则
               还蛋白    (ferredoxin,Fdx) 结构域间由两个柔性连接              提供了一条捷径,P450 酶可直接利用                 H O 生成
                                                                                                        2
                                                                                                     2
               子  (linker) 连接,电子传递途径为        NAD(P)H→FMN        compound Ⅰ,不依赖于还原伴侣蛋白和              NAD(P)H。
               →[2Fe-2S]→heme。                                  但天然的     P450 酶利用   H O 的能力非常有限,工程
                                                                                        2
                                                                                      2
                    P450 酶可催化诸如羟基化、环氧化、脱烷基                      化改造    P450 酶为能够高效利用          H O 的过加氧酶
                                                                                                 2
                                                                                               2
               化、环芳基交联等二十余种反应,反应的区域和立                           或过氧化物酶,是提升           P450 酶应用潜力的一种策
               体选择性高,尤其在惰性           C−H  键的选择性氧化上拥             略。例如,丛志奇教授团队利用“双功能小分子策
               有众多化学催化剂无法媲美的优势,是一类在药物                           略 ”、“氧化还原敏感残基工程 ”及“H O 隧道工
                                                                  [8]
                                                                                            [9]
                                                                                                      2
                                                                                                    2
               研发、生物制造和绿色化学等领域备受关注的酶。                           程 [10-11] ”成功改造了  P450 BM3 ,实现了一系列高难度
                1.1    P450 酶的催化循环过程                            的催化反应,拓宽了         P450 酶的应用范围。
                    在  P450 酶催化反应过程中,分子氧的一个氧                     1.2    P450 酶的分类
               原子与    NAD(P)H  生成水分子,另一个氧原子则掺                        依据序列一致度         (identity) 对  P450 酶进行分
               入底物,形成羟基、环氧基等基团。在经典的                     P450    类,大于    40%  的为同一家族,以阿拉伯数字表示;大
               酶催化羟基化反应(图           2)过程中,真正发挥催化作               于  55%  的为同一亚家族,以大写字母表示;同一亚
                                                                                                           [12]
                                  4+
               用的活性形式为          Fe =O  复合物,也称       compound    家族蛋白再根据发现的先后顺序依次进行编号 ,
   14   15   16   17   18   19   20   21   22   23   24