Page 12 - 《中国药科大学学报》2026年第2期
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138                      学报   Journal of China Pharmaceutical University 2026, 57(2): 133 − 143  第 57 卷
                                O  H   O          O  OH                  O                O

                             HO    N    OH     HO        OH      HO        OH     HO        OH
                                  O                 OH  O           O                O
                                NOG, 1               2                 3                4
                               O                  O      O           O     O        O      O
                             HO         OH     HO          OH     HO         OH   HO         OH
                                 O                  OH                OH              N
                                    5                6                 7                8
                                             Cl              O
                                                              OH      H      O        H
                                                                      N
                             N           N      I    HO             N          OH  HO  N      OH
                                 OH          OH          N              O              O
                                9           10             11            12              13
               图 3    结构与内源性底物   2-氧戊二酸(2-oxoglutarate, 2OG)类似的  FIH  抑制剂


                 A                    PDB ID: 1H2K  B               PDB ID: 3KCY  C               PDB ID: 4AI8
                                                                              Asn205
                     Asn205                                                                      Lys214
                                        Lys214
                  Asp201   Zn                     Asp201        Fe   9
                                1                        His279               Asp201   Zn    12      Tyr145
                       His279                                                     His279
                                         Tyr145                      Ile281
                           His199                            His199                    His199  Thr196
                                   Thr196
                                     PDB ID: 2W0X                   PDB ID: 4BIO                 PDB ID: 2WA4
                     Asn205
                                                                                        Phe207
                                                                     Lys214                  13
                                                                11                              Lys214
                                      Lys214
                  Asp201
                            Fe                  Asp201     Fe                  Asp201                 Tyr145
                      His279                         His279  Ile281    Tyr145           Fe   13
                                 8
                                                                                  His279
                                         Tyr145                  Thr196
                         His199  Thr196                   His199                         His199  Thr196
               图 4    2OG  类似物与  FIH  蛋白结合模式
               A:以类似于  2OG  的模式与  FIH  结合;B:以与  2OG  不同的螯合取向占据  FIH  催化位点;C:与  FIH  结合导致关键氨基酸残基构象发生改变

               阻导致的。Daminozide(12)是一种农药,据报道其                    丙氨酸(17,NOFD)是首个报道的             FIH  选择性抑制
               对于部分      JmjC  家族的赖氨酸去甲基化酶(lysine               剂(图   5),其双甲酯化合物         DM-NOFD   能够渗透进
               demethylases,KDMs)具有一定的抑制作用 。有                   入细胞并抑制       FIH  的催化作用。化合物          17 与  FIH
                                                      [45]
               趣的是,12 与     FIH  的催化活性位点结合时会导致关                 的复合物     X  射线晶体结构显示(图           6-A),化合物
               键氨基酸残基构象发生变化,其两个氮甲基导致                            17 的苯环能够适配于由           Leu186、Leu188、Trp296
               Asn205 的侧链发生旋转(图         4-C) 。3-羟基苯甲羟           及  Tyr102 侧链形成的疏水口袋中,这种结合模式
                                            [46]
               肟酸(13)在与     FIH  的催化活性位点结合时,也表现                 可能阻碍了氧气与         FIH  的结合 。
                                                                                           [47]
               出独特的性质。X         射线显示(图      4-C),两分子的     13         将  NOFD  与  FIH  的复合物结构与      PHD2 结构
               能够结合在      FIH  的催化活性位点,这导致与             Fe(II)  进行叠合,结果(图       6-B)显示,NOFD     的苯环与    PHD2
               配位的    Asp201 侧链发生旋转而远离          Fe(II) 。        中的   Tyr310 残基之间由于立体位阻而存在不利相
                                                     [43]
                4.2    具有一定选择性的      FIH  抑制剂                   互作用,从而阻碍其与           PHD2 活性位点的结合。虽
                    2005 年,Schofield 课题组报道了一系列          N-草     然  NOFD  能够选择性地抑制          FIH  而不影响    PHDs,
               酰氨基酸衍生物,其中,具有疏水侧链的                   D  构型衍      但其双羧酸结构使其难以透过细胞膜,同时它对其
               生物表现出对于        FIH  的选择性,而其      L-对映异构体         他  JmjC  家族的加氧酶缺乏选择性,这都限制了其
               则对   FIH  和  PHDs 的抑制无明显差异。N-草酰苯                 作为工具分子进一步探索            FIH  的生物学功能。
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