Page 5 - 《渔业研究》2026年第3期
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298                                  渔  业  研  究                                     第 48 卷

              要太平洋鲑属鱼类——大麻哈鱼(O. keta) 、大鳞大                     育系   F 代陆封型马苏大麻哈鱼体质量为                 1 000~
                                                                     5
              麻哈鱼(O. tshawytscha)、银大麻哈鱼(O. kisutch)、马          1 100 g,为  2  龄性成熟雌鱼;非选育系陆封型马苏
              苏大麻哈鱼、细鳞大麻哈鱼(O. gorbusha)和红大麻                    大麻哈鱼体质量为          700~800 g,为  2  龄性成熟雌
                                                        [5]
              哈鱼(O. nerka)的养殖量和产值也在不断提高 。                      鱼。分别选取       15  尾生殖孔外凸红肿、呈粉红色或
                  近  15  年间,中国已开展陆封型马苏大麻哈鱼                     深红色、轻压腹部时卵粒可自然流出的性成熟选育
              人工繁殖和养殖技术方面的研究               [6-11] ,以规模化生       系  F 代陆封型马苏大麻哈鱼(LBSMS             组)和非选
                                                                  5
              产为前提,鱼类的全人工繁殖可以保证鱼种来源不                           育系陆封型马苏大麻哈鱼(LLMS              组)作为样品,
              受野生种群的限制。同时,三倍体诱导                  [12]  和杂交     在养殖场直接解剖采集每尾鱼相同质量的卵,每种
              育种  [13]  等技术的应用,为解决该鱼种个体小、生                     类型各得到     5  组样品(分别为       LBSMS1~LBSMS5、
              长慢、性成熟后死亡等制约产业发展的关键问题提                           LLMS1~LLMS5,每组由       3  个样品进行混样) ,并
              供了新的技术思路。目前,马苏大麻哈鱼繁殖亲本                           迅速放入液氮中进行速冻,随后运至实验室于−80 ℃
              仍来源于江河中直接捕捞的野生鱼,或由野生鱼繁                           冰箱保存待用。吉林农业大学实验动物福利与伦理
              殖获得的     2  代、3  代苗种养殖而成,未经针对性驯                  委员会批准动物实验,批准编号为               20250825006。
              化选育,性成熟的鱼种个体小,生长速度较慢,导                            1.2 RNA  提取及转录组测序
              致养殖风险增加,养殖效益不稳定,从而影响了养                               样本由武汉影子基因科技有限公司负责核糖核
              殖户的积极性。而马苏大麻哈鱼的鱼卵不仅用于繁                           酸(Ribonucleic acid,RNA)提取、数据指控及文
              衍后代,还具有很高的营养价值,且能够通过生产                           库测序,使用       Illumina NovaSeq 6000  平台进行测
              为鱼子酱提升其经济价值。目前对马苏大麻哈鱼的                           序。该公司对每组的          5  个  RNA  质量良好的卵组织
              研究主要集中在繁殖性能            [14] 、生态分布   [15] 、表型     进行转录组测序。使用           StringTie 软件对原始序列
              性状  [16]  和肌肉营养组成    [17]  等方面,而从基因表达            进行组装,并将每个基因中最长的转录本作为
              和代谢物水平       2  个层面,系统解析选育系           F 代与       Unigenes。通过    BUSCO(Benchmarking Universal
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              非选育系马苏大麻哈鱼卵差异的研究尚未见报道。                           Single-Copy Orthologs)评估组装转录本的质量,
              因此,本研究以生长快、体质健壮、性成熟个体大                           以分离    6  个公共数据库中的基因序列非冗余蛋
              的马苏大麻哈鱼作为亲本进行繁育,获得了陆封型                           白 序 列 数 据 库 ( Non-redundant  protein  database,
              马苏大麻哈鱼选育系          F 代,通过转录组和代谢组                 NCBI-Nr) 、蛋白质家族数据库(Protein families
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              学技术对选育系         F 代与非选育系马苏大麻哈鱼                   database,Pfam) 、直系同源蛋白分组比对数据
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              (未经过选育的亲本,一直留存并在基地养殖)进                           库(Evolutionary genealogy of genes: non-supervised
              行全面分析,通过对比两者的基因表达谱,筛选与                           orthologous groups,eggNOG) 、经过注释的蛋白
              卵发育、营养积累、抗逆性相关的差异表达基因                            质序列数据库(Swiss-prot) 、京都基因与基因组百
              (如卵黄蛋白原基因、抗氧化酶基因等) ,明确人                          科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,
              工选育如何通过遗传改良影响卵的分子基础,分析                           KEGG) 、基因本体数据库(Gene ontology,GO) 。
              卵中氨基酸、脂肪酸、核苷酸等代谢物的含量差异                           对差异基因进行功能注释和富集分析,以获得差异
              [  如二十碳五烯酸(Eicosapentaenoic acid,EPA) 、          表达基因的生成。上述所有分析中,P<0.05                  被用
              二十二碳六烯酸(Docosahexaenoic acid,DHA)                作统计学显著性的阈值。
              等关键脂肪酸       ],揭示选育系卵在能量储备、抗氧                     1.3 非靶代谢组液相色谱−质谱测序
              化能力等方面的优势,为评估卵的孵化率、仔鱼成                               样本由武汉影子基因科技有限公司负责提取,
              活率提供代谢层面的依据,从差异表达基因和特征                           上机检测,物质注释鉴定和分析。使用沃特世
              代谢物中挖掘可用于马苏大麻哈鱼良种选育的分子                           Acquity UPLC HSS T3  色谱柱(Waters Acquity UPLC
              标记,辅助建立高效的选育技术体系,加速优良品                           HSS T3 Column) 。正离子模式:流动相          A  为  0.1%
              系的培育进程。                                          甲酸水溶液,流动相          B  为  0.1%  甲酸乙腈溶液;负
                                                               离子模式:流动相        A  为  0.1%  甲酸水溶液,流动相
               1 材料与方法
                                                               B  为  0.1%  甲酸乙腈溶液(具体色谱条件见表              1) 。
               1.1 试验材料                                        使用质谱仪(Q Exactive™ Plus,Thermo Fisher Scien-
                  试验鱼来自延边马苏大麻哈鱼水产良种场。选                         tific)的  UltiMate 3000  超高效液相色谱系统(Dio-
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