Page 5 - 《渔业研究》2026年第3期
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298 渔 业 研 究 第 48 卷
要太平洋鲑属鱼类——大麻哈鱼(O. keta) 、大鳞大 育系 F 代陆封型马苏大麻哈鱼体质量为 1 000~
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麻哈鱼(O. tshawytscha)、银大麻哈鱼(O. kisutch)、马 1 100 g,为 2 龄性成熟雌鱼;非选育系陆封型马苏
苏大麻哈鱼、细鳞大麻哈鱼(O. gorbusha)和红大麻 大麻哈鱼体质量为 700~800 g,为 2 龄性成熟雌
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哈鱼(O. nerka)的养殖量和产值也在不断提高 。 鱼。分别选取 15 尾生殖孔外凸红肿、呈粉红色或
近 15 年间,中国已开展陆封型马苏大麻哈鱼 深红色、轻压腹部时卵粒可自然流出的性成熟选育
人工繁殖和养殖技术方面的研究 [6-11] ,以规模化生 系 F 代陆封型马苏大麻哈鱼(LBSMS 组)和非选
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产为前提,鱼类的全人工繁殖可以保证鱼种来源不 育系陆封型马苏大麻哈鱼(LLMS 组)作为样品,
受野生种群的限制。同时,三倍体诱导 [12] 和杂交 在养殖场直接解剖采集每尾鱼相同质量的卵,每种
育种 [13] 等技术的应用,为解决该鱼种个体小、生 类型各得到 5 组样品(分别为 LBSMS1~LBSMS5、
长慢、性成熟后死亡等制约产业发展的关键问题提 LLMS1~LLMS5,每组由 3 个样品进行混样) ,并
供了新的技术思路。目前,马苏大麻哈鱼繁殖亲本 迅速放入液氮中进行速冻,随后运至实验室于−80 ℃
仍来源于江河中直接捕捞的野生鱼,或由野生鱼繁 冰箱保存待用。吉林农业大学实验动物福利与伦理
殖获得的 2 代、3 代苗种养殖而成,未经针对性驯 委员会批准动物实验,批准编号为 20250825006。
化选育,性成熟的鱼种个体小,生长速度较慢,导 1.2 RNA 提取及转录组测序
致养殖风险增加,养殖效益不稳定,从而影响了养 样本由武汉影子基因科技有限公司负责核糖核
殖户的积极性。而马苏大麻哈鱼的鱼卵不仅用于繁 酸(Ribonucleic acid,RNA)提取、数据指控及文
衍后代,还具有很高的营养价值,且能够通过生产 库测序,使用 Illumina NovaSeq 6000 平台进行测
为鱼子酱提升其经济价值。目前对马苏大麻哈鱼的 序。该公司对每组的 5 个 RNA 质量良好的卵组织
研究主要集中在繁殖性能 [14] 、生态分布 [15] 、表型 进行转录组测序。使用 StringTie 软件对原始序列
性状 [16] 和肌肉营养组成 [17] 等方面,而从基因表达 进行组装,并将每个基因中最长的转录本作为
和代谢物水平 2 个层面,系统解析选育系 F 代与 Unigenes。通过 BUSCO(Benchmarking Universal
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非选育系马苏大麻哈鱼卵差异的研究尚未见报道。 Single-Copy Orthologs)评估组装转录本的质量,
因此,本研究以生长快、体质健壮、性成熟个体大 以分离 6 个公共数据库中的基因序列非冗余蛋
的马苏大麻哈鱼作为亲本进行繁育,获得了陆封型 白 序 列 数 据 库 ( Non-redundant protein database,
马苏大麻哈鱼选育系 F 代,通过转录组和代谢组 NCBI-Nr) 、蛋白质家族数据库(Protein families
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学技术对选育系 F 代与非选育系马苏大麻哈鱼 database,Pfam) 、直系同源蛋白分组比对数据
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(未经过选育的亲本,一直留存并在基地养殖)进 库(Evolutionary genealogy of genes: non-supervised
行全面分析,通过对比两者的基因表达谱,筛选与 orthologous groups,eggNOG) 、经过注释的蛋白
卵发育、营养积累、抗逆性相关的差异表达基因 质序列数据库(Swiss-prot) 、京都基因与基因组百
(如卵黄蛋白原基因、抗氧化酶基因等) ,明确人 科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,
工选育如何通过遗传改良影响卵的分子基础,分析 KEGG) 、基因本体数据库(Gene ontology,GO) 。
卵中氨基酸、脂肪酸、核苷酸等代谢物的含量差异 对差异基因进行功能注释和富集分析,以获得差异
[ 如二十碳五烯酸(Eicosapentaenoic acid,EPA) 、 表达基因的生成。上述所有分析中,P<0.05 被用
二十二碳六烯酸(Docosahexaenoic acid,DHA) 作统计学显著性的阈值。
等关键脂肪酸 ],揭示选育系卵在能量储备、抗氧 1.3 非靶代谢组液相色谱−质谱测序
化能力等方面的优势,为评估卵的孵化率、仔鱼成 样本由武汉影子基因科技有限公司负责提取,
活率提供代谢层面的依据,从差异表达基因和特征 上机检测,物质注释鉴定和分析。使用沃特世
代谢物中挖掘可用于马苏大麻哈鱼良种选育的分子 Acquity UPLC HSS T3 色谱柱(Waters Acquity UPLC
标记,辅助建立高效的选育技术体系,加速优良品 HSS T3 Column) 。正离子模式:流动相 A 为 0.1%
系的培育进程。 甲酸水溶液,流动相 B 为 0.1% 甲酸乙腈溶液;负
离子模式:流动相 A 为 0.1% 甲酸水溶液,流动相
1 材料与方法
B 为 0.1% 甲酸乙腈溶液(具体色谱条件见表 1) 。
1.1 试验材料 使用质谱仪(Q Exactive™ Plus,Thermo Fisher Scien-
试验鱼来自延边马苏大麻哈鱼水产良种场。选 tific)的 UltiMate 3000 超高效液相色谱系统(Dio-

