Page 41 - 《渔业研究》2026年第2期

184 渔 业 研 究 第 48 卷

GL DNA marker 5 000

5 000 bp
3 000 bp
2 000 bp
1 500 bp
1 000 bp
750 bp
500 bp
250 bp
100 bp

2% 琼脂糖
2% Agarose
图 2 铜鱼养殖群体 Cyt b 位点抽检电泳胶图
Fig. 2 Randomly sampled Cyt b loci electrophoresis gel of the cultured C. heterodon population

表 2 铜鱼养殖群体序列特征分析
Tab. 2 Analysis of sequence characteristics of the cultured C. heterodon population
项目 Items Cyt b 12S rRNA D-Loop
长度范围/bp Length range 1 110~1 147 425~445 972~1 023
平均长度/bp Average length 1 122.77 430.00 1 000.47
中位数长度/bp Median length 1 122 429 1 001
A 碱基占比/% Adenine (A) content 31.7 30.6 34.7
T 碱基占比/% Thymine (T) content 29.5 20.8 30.8
G 碱基占比/% Guanine (G) content 13.6 21.6 13.9
C 碱基占比/% Cytosine (C) content 25.3 27.0 20.5

2.2 群体遗传多样性和遗传差异性分析 鱼养殖群体的 Hd 值分别为 0.547±0.010 5、0.186±
群体遗传多样性分析结果如表 3 所示。1）Cyt b： 0.007 8 和 0.885±0.001 3，表明铜鱼养殖群体遗传
选中区域 1~1 150 bp，有效位点 1 093 个（含缺失/ 多样性处于相对较低水平。
空位位点 57 个） ，其中单型位点 1 085 个，变异 2.3 单倍型聚类分析
位点 8 个。2）12S rRNA：选中区域 1~455 bp，有 基于线粒体 DNA Cyt b、12S rRNA 和 D-loop
效位点 425 个（含缺失/空位位点 30 个） ，其中单型 序列分析的铜鱼养殖群体单倍型分析结果如图 3~
位点 424 个，变异位点 1 个。3）D-loop：选中区域 图 5 所示。
1~1 028 bp，有效位点 944 个（含缺失/空位位点 30 Cyt b：检测到 22 种单倍型，其中 18 种为独
个） ，其中单型位点 930 个，变异位点 14 个。基于 享型，4 种为共享型（图 3） ；单倍型间遗传距离
线粒体 DNA Cyt b、12S rRNA 和 D-loop 序列，铜 为 0~0.004，差异极小，未构建系统进化树。

表 3 铜鱼养殖群体遗传多样性分析
Tab. 3 Analysis of genetic diversity of the cultured C. heterodon population
项目 Items Cyt b 12S rRNA D-Loop
变异位点数/个 Number of polymorphic sites 8 1 14
单一多态位点数/个 Number of singleton sites 5 0 6
简约信息位点数/个 Parsimony-informative sites 3 1 8
单倍型数/种 Number of haplotypes 22 19 30
单倍型多样性 Haplotype diversity (Hd) 0.547±0.010 5 0.186±0.007 8 0.885±0.001 3
核苷酸多样性 Nucleotide diversity (Pi) 0.000 76 0.000 44 0.002 58
平均核苷酸差异数 Average number of nucleotide differences 0.830 0.186 2.432