Page 38 - 《渔业研究》2026年第2期
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渔业研究 2026,48(2) :181 − 189 http://www.hyyysci.com
Journal of Fisheries Research DOI:10.14012/j.jfr.2025109
吴 斌,贺 刚,陶志英,等. 基于线粒体 DNA Cyt b、12S rRNA 和 D-loop 序列的铜鱼养殖群体遗传多样性分析[J]. 渔业研究,2026,
48(2) :181 − 189.
Wu B,He G,Tao Z Y,et al. Analysis of genetic diversity of the cultured Coreius heterodon population based on mitochondrial DNA Cyt b, 12S
rRNA, and D-loop sequences[J]. Journal of Fisheries Research,2026,48(2) :181 − 189.
基 于 线 粒 体 DNA Cyt b、 12S rRNA 和 D-loop
序列的铜鱼养殖群体遗传多样性分析
吴 斌,贺 刚,陶志英,邓勇辉 ,郭怿宁,袁嘉欣
*
(江西省水产科学研究所,江西 南昌 330039)
摘要:【目的】本研究分别利用线粒体 DNA Cyt b、12S rRNA 和 D-loop 序列对铜鱼(Coreius
heterodon)养殖群体进行遗传多样性分析,初步了解其遗传多样性。【方法】采用已报道的
特异性引物对线粒体 DNA Cyt b、12S rRNA 和 D-loop 序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩
增,并采用双脱氧测序法(Sanger)对扩增产物进行测序。遗传多样性参数由 DNASP 6.12
软件计算;采用 MEGA 11.0 软件分析 DNA 序列的碱基组成和变异位点;利用 Kimura 双参
数模型计算单倍型间的遗传距离,采用邻接法(NJ)和最大似然法(ML)构建 D-loop 全序列
单倍型系统进化树。【结果】用于分析的线粒体 DNA Cyt b、12S rRNA 和 D-loop 序列长度
分别为 1 110~1 147、425~445 和 972~1 023 bp,平均长度分别为 1 122.77、430.00 和 1 000.47 bp,
中位数长度分别为 1 122、429 和 1 001 bp。在线粒体 DNA Cyt b、12S rRNA 和 D-loop 序列
中,分别检测出 8、1 和 14 个变异位点,以及 22、19 和 30 种单倍型,单倍型间遗传距离分
别为 0~0.004、0~0.005 和 0~0.007。基于线粒体 DNA Cyt b、12S rRNA 和 D-loop 序列的平
均单倍型多样性(Hd)分别为 0.547±0.010 5、0.186±0.007 8 和 0.885±0.001 3;平均核苷酸
多样性(Pi)分别为 0.000 76、0.000 44 和 0.002 58;平均核苷酸差异数(k)为 0.830、0.186
和 2.432。同时,歧点分布分析图谱呈现单峰型,在中性检验中 Tajima’s D(D=−1.040,P>0.01)
为负值,但统计结果为不显著(P>0.01) 。【结论】铜鱼养殖群体遗传多样性相对较低,且
单倍型间存在广泛的基因交流,但铜鱼养殖群体的种群数量下降。因此,建立起遗传多样性
丰富的铜鱼人工繁殖的基础亲鱼群体,解决铜鱼亲本培育问题,持续壮大铜鱼养殖群体规模
是首要任务。
关键词:铜鱼;Cyt b;12S rRNA;D-loop 序列;遗传多样性
中图分类号:S965.117 文献标识码:A 文章编号:2096 − 9848 (2026) 02 − 0181 − 09
铜鱼(Coreius heterodon) ,俗称金鳅、尖头棒 生物群落的关键组成部分。该鱼含脂量高、肉质细
[2]
等,属鲤形目(Cypriniformes)、鲤科(Cyprinidae)、 嫩鲜美,具有颇高的开发利用价值 。
鮈亚科(Gobioninae)、铜鱼属(Coreius),是长江特 细胞色素 b(Cytochrom b,Cyt b)是线粒体
[1]
有鱼类,在长江上游分布最为集中 ,是长江水生 脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA)中
收稿日期:2025-09-11 修回日期:2025-10-28
基金项目:江西省渔业种业项目(2024yyzytg-02)
第一作者:吴 斌,男,高级水产师,博士,研究方向为数据驱动的水产种质资源保护与开发。E-mail: wubinjx@163.com
通信作者:邓勇辉,男,高级水产师,学士,研究方向为水生动物繁育。E-mail: 1628535538@qq.com
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