Page 116 - 《渔业研究》2025年第6期

第 6 期 郭 香等： 基于 COⅠ基因的菲律宾蛤仔养殖与野生群体遗传多样性分析 807

10 个单倍型（19 个个体）形成了 1 个小的遗传谱 宾蛤仔养殖和野生群体间没有分别聚成单独的
系，其他的单倍型构成了 1 个大的遗传谱系。菲律 谱系。

表 3 基于 COⅠ基因的 5 个菲律宾蛤仔群体间遗传距离（对角线下）和 P 值（对角线上）
Tab. 3 Pairwise F st (below diagonal) and associated P values (above diagonal) among 5 populations of R. philippinarum
based on COⅠ gene
群体 Populations 云霄 YX 东山 DS 莱州 LZ 南浦 NP 海州 HJ
云霄 YX — 0.036 0.054 0.009 * 0.000 *
东山 DS 0.052 — 0.180 0.000 * 0.000 *
莱州 LZ 0.072 0.101 — 0.000 * 0.000 *
南浦 NP 0.096 0.260 0.197 — 0.000 *
海州 HJ 0.200 0.300 0.197 0.126 —
*
注： 表示经排列检验后差异极显著（P<0.01） 。
*
Note: means highly significant difference by the permutation test (P<0.01).

表 4 基于 COⅠ基因的 5 个菲律宾蛤仔群体遗传变异的 AMOVA 分析
Tab. 4 AMOVA analysis of genetic variation of 5 populations of R. philippinarum based on COⅠ gene
变异来源 自由度 方差总和 变异组分 变异贡献率/% 遗传分化指数
Source of Degrees of freedom Sum of squares Variance components Contribution rate of variation Φ-statistics P
variations
组间
Among groups 1 31.1 0.23 8.13 Φ CT =0.081 0.013
组内群体间
Among populations 3 36.2 0.32 11.53 Φ SC =0.125 <0.001
群体内
Within populations 157 350.3 2.23 80.34 Φ ST =0.200 <0.001
总计 Total 161 417.6 2.78

以 MJN 法构建的菲律宾蛤仔单倍型网络进化 加 [15-16] 。高繁殖力水生生物的养殖通常采用常规的
图（图 2）与系统发育树所反映的进化关系基本一 群体繁育，需要指出的是，当养殖中使用的亲本较
致。全部单倍型形成的网络图呈非典型的星状分布 少时，可能会发生遗传多样性的丢失。而这种养殖
态势，59 个单倍型形成了 2 个明显的进化分支， 方法已被证明对许多水产养殖物种如华贵栉孔扇贝
49 个单倍型形成了 1 个大的遗传分支，各个单倍 （Chlamys nobilis）和长牡蛎（Crassostrea gigas）
型交叉分布。但是，图 2 中养殖群体的单倍型较为 等的遗传变异水平和有效种群数量产生了负面
集中，主要为 Hap 2、Hap 4 和 Hap 13，而野生群 影响 [16-18] 。
体的单倍型分布更为弥散。结果表明，菲律宾蛤仔 福建省是中国菲律宾蛤仔苗种的主产区，每年
系统发育树和单倍型网络图的结果与群体遗传多样 都有大量的苗种供应到全国各地。为了保持菲律宾
性及遗传分化的分析结论相一致。 蛤仔产业的健康可持续发展，在生产中主要采用海
边围垦养殖育苗，繁育时投入的菲律宾蛤仔亲贝量
3 讨论
2
巨大，可达 2 000 kg/hm ，而且虽然传统的工厂水
3.1 群体遗传多样性 泥池育苗场只占小部分的市场份额（约 25%） ，但
遗传多样性是生物多样性的核心，高水平的遗 其使用的亲贝量也很大。本研究中，养殖和野生群
传多样性是物种进化和维持多样性的基础，它决定 体均维持较高的遗传多样性，但是两者之间的遗传
了物种对环境改变的响应能力。如果遗传多样性 分化依然被观测到。与 3 个野生群体相比，不论是
降低，物种将易受环境变化的影响，适应能力下 垦区还是工厂养殖的菲律宾蛤仔群体的遗传多样性
降，这对物种的发展进化不利。因此，在水产养殖 均降低和独享单倍型数量均减少。值得注意的是，
中，经过多年的养殖之后，养殖群体的遗传多样性 尽管育苗过程中使用的亲贝量巨大，但是通常来自
是否丢失需要着重关注。在渔业生产中，如何最大 于养殖群体。因此，福建省菲律宾蛤仔养殖群体的
限度地减少遗传多样性的损失是一个巨大的挑战， 遗传多样性下降可能是较小的有效群体和封闭循环
因为在封闭的群体中，遗传漂变的可能性将会增 群体的自交导致的。此外，Xing 等 [4] 利用微卫星