Page 112 - 《渔业研究》2025年第6期

渔业研究 2025，47（6） ：803 − 812 http://www.hyyysci.com
Journal of Fisheries Research DOI:10.14012/j.jfr.2025080

郭 香，宁 岳，巫旗生，等. 基于 COⅠ基因的菲律宾蛤仔养殖与野生群体遗传多样性分析[J]. 渔业研究，2025，47（6） ：803 − 812.
Guo X，Ning Y，Wu Q S，et al. Genetic diversity analysis of cultured and wild populations of Ruditapes philippinarum based on COⅠ gene[J].
Journal of Fisheries Research，2025，47（6） ：803 − 812.

基于 COⅠ基因的菲律宾蛤仔养殖与野生

群体遗传多样性分析

郭 香，宁 岳，巫旗生，祁剑飞，叶 军，吴丽云，葛 辉 *

（福建省水产研究所，福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室，福建省海洋生物资源开发利用
协同创新中心，福建 厦门 361013）

摘要：【背景】菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum）是东亚地区天然分布的重要双壳贝类
之一，在中国被广泛养殖。【目的】旨在对比分析菲律宾蛤仔养殖和野生群体的遗传多样
性。【方法】本研究对 2 个来自福建的养殖群体和 3 个野生群体（中国莱州、朝鲜南浦和海
州） ，共 162 个样本的线粒体细胞色素 c 氧化酶第Ⅰ亚基（COⅠ）基因部分序列进行了扩
增和测序分析。【结果】在 646 bp 的 COⅠ基因片段上，5 个群体共检测到 63 个多态变异位
点，鉴定出 59 个单倍型。5 个群体的单倍型多样性指数（Hd）为 0.880~0.938，核苷酸多样
性指数（π）为 0.001~0.010。野生群体的单倍型多样性指数为 0.905~0.938，核苷酸多样性
为 0.005~0.010，定义了 41 个单倍型，占单倍型总数的 69.5%。养殖群体的单倍型多样性为
0.880~0.902，核苷酸多样性为 0.001~0.006，定义了 22 个单倍型，占单倍型总数的 37.3%。
分子变异分析（AMOVA）结果显示，菲律宾蛤仔养殖与野生群体间的遗传分化指数为
0.081，变异贡献率为 8.13%，但差异不显著（P>0.01） ；遗传变异主要来源于群体内部个体
之间（80.34%，P<0.001） ；群体间遗传距离（F ）分析表明，朝鲜和中国群体间的遗传距
st
离存在显著差异（P<0.01） ，而其他群体间无显著分化（P>0.01） 。单倍型分子系统进化树
和网络进化图显示，5 个群体的单倍型形成了 2 个遗传分支，但这种遗传分化的形成主要与
地理隔离有关。【结论】养殖活动没有显著影响群体的遗传多样性，但相比养殖群体，野生
群体呈现了更高的遗传多样性和更多的独享单倍型。这暗示了养殖群体中的遗传多样性的降
低可能是缘于较小的有效群体和封闭循环养殖群体中的近交。研究结果有助于未来菲律宾蛤
仔养殖活动的合理规划和管理，并为其遗传育种提供理论基础。
关键词：菲律宾蛤仔；细胞色素 c 氧化酶第Ⅰ亚基（COⅠ）基因；遗传多样性；养殖和野
生群体
中图分类号：S917.4；Q953 文献标识码：A 文章编号：2096 − 9848 （2025） 06 − 0803 − 10

菲律宾蛤仔（Ruditapes philippinarum）是广布 等全球多个海域进行养殖，其环境适应性强，极其
在西太平洋地区的双壳贝类，现已在欧洲和北美洲 适合高密度的人工养殖，具有很高的经济价值。作

收稿日期：2025-07-29 修回日期：2025-10-14
基金项目：国家重点研发计划项目（2024YFD 2401703） ；国家贝类产业技术体系项目（CARS-49） ；国家海洋水产种质资源库（2025） ；
福建省海洋服务与渔业高质量发展专项资金项目（FJHY-YYKJ-2024-1-13） ；福建省区域发展项目（2025N31010036）
第一作者：郭 香，女，助理研究员，研究方向为水产遗传育种。E-mail: guoxiang432@163.com
通信作者：葛 辉，男，副研究员，研究方向为水产生物疾病防治。E-mail: 717764449@qq.com
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