Page 51 - 《水产学报》2026年第04期
P. 51

4 期                                     水    产    学    报                                 50 卷

              中的   FATTYACIDBP1/3 (PRINTS 登录号: PR00178)        两 种 形 式 , FABP10     仅 含   Motif2, FABP1  和
              (图  2)。与配体结合密切相关的             FATTYACIDBP2       FABP6  则由独特的     Motif5  构成。序列比对发现,
              在鱼类    FABP  基因中存在      4  种变异形式     (图  2-a),   位于  6  号染色体的     FABP7.1  和  FABP7.2  基因存在
              即  Motif2、Motif2+Motif3、Motif2+Motif6  和  Motif5。  Motif 3  和  Motif 4  的缺失,这主要由该区域部分
              上述   4  种变异形式与      FABP  基因进化树上的        3  个    碱基缺失导致。基因结构分析显示,大多数                    FABP
              分支高度吻合:支         2  基因包含   Motif2+Motif3  组合,    基因含有    4  个外显子,结构相对保守           (图  2-a)。
              支  3  基因包含   Motif2+Motif6组合,而支      1  分化为


                                  FABP2.1 鳀 E. japonicus                                 colored ranges
                                  FABP2b 金钱鱼 S. argus
                                    FABP2b 鳜 S. chuatsi                                     FABP1
                                    FABP2.2 鳀 E. japonicus                                  FABP2
                                    FABP2 大西洋鲑 S. salar                                     FABP3
                                    FABP2 斑马鱼 D. rerio  cluster3                            FABP4
                                                                                            FABP6

                                  FABP2 裸盖鱼 A. fimbria                                      FABP7
                                    FABP2a 金钱鱼 S. argus                                     FABP10a

                                  FABP2 日本花鲈 L. japonicus

                                  FABP2 鳜 S. chuatsi                                        Motif 1
                                  FABP10a 鳀 E. japonicus                                    Motif 2
                                  FABP10a 斑马鱼 D. rerio                                      Motif 3
                                  FABP10 鳜 S. chuatsi                                       Motif 4

                                  FABP10 线鳢 C. striata                                      Motif 5

                                  FABP1 蟾蜍 R. arenarum                                      Motif 6

                                  FABP1 狭口短唇沟鲨 S. bivius

                                  FABP1 美洲肺鱼 L. paradoxa                                    FABP superfamily
                                  FABP1 乌鳢 C. argus
                                  FABP1a 斑马鱼 D. rerio  cluster1
                                  FABP1 大西洋鲑 S. salar
                                  FABP1b 斑马鱼 D. rerio
                                  FABP1 ޣᶺתٚ吟 T. rubripes

                                  FABP1 ׄջെϪ჈ E. coioides

                                  FABP1 鳜 S. chuatsi
                                  FABP1.1 鳀 E. japonicus
                                  FABP1.2 鳀 E. japonicus
                                  FABP6 鳀 E. japonicus
                                  FABP4 斑马鱼 D. rerio
                                  FABP4 鳜 S. chuatsi
                                  FABP4 鳀 E. japonicus

                                  FABP4 鲤 C. carpio
                                  FABP3 斑马鱼 D. rerio

                                  FABP3 黄颡鱼 T. fulvidraco

                                  FABP3 白斑狗鱼 E. lucius
                                  FABP3 大西洋鲑 S. salar
                                  FABP3.1 鳀 E. japonicus
                                  FABP3 鳜 S. chuatsi

                                  FABP3b 革首南极鱼 N. coriiceps

                                  FABP3b 驼背  南极鱼 G. gibberifrons

                                  FABP3b 扁嘴副带腭鱼 P. charcoti

                                  FABP3b 黑鳍冰鱼 C. aceratus

                                  FABP3b 南极小带腭鱼 P. antarcticus
                                  FABP3.2 鳀 E. japonicus
                                  FABP3.3 鳀 E. japonicus
                                  FABP3 翘嘴鲌 C. alburnus  cluster2

                                  FABP3 鲫 C. auratus
                                  FABP3.4 鳀 E. japonicus

                                  FABP3 虹鳟 O. mykiss

                                  FABP3a 大西洋鲑 S. salar

                                  FABP3 裸盖鱼 A. fimbria

                                  FABP3a 南极小带腭鱼 P. antarcticus

                                  FABP3a 革首南极鱼 N. coriiceps

                                  FABP3a 黑鳍冰鱼 C. aceratus
                                  FABP3a 驼背  南极鱼   G. gibberifrons
                                  FABP7.1 鳀 E. japonicus
                                  FABP7.2 鳀 E. japonicus
                                  FABP7.3 鳀 E. japonicus

                                  FABP7b 美洲胡瓜鱼 O. mordax

                                  FABP7 白斑狗鱼 E. lucius

                                  FABP7 虹鳟 O. mykiss

                                  FABP7a美洲胡瓜鱼 O. mordax

                                  FABP7 裸盖鱼 A. fimbria
                                  FABP7 鳜 S. chuatsi
                                                   5'                 3' 5'                3'
                                                   0  30 60 90 120 150 180  0  30 60 90 120 150 180
                                                             (a)
                   4             4           4            4      4                    4
                                                                                          12K
                   3             3           3            3      3                    3
                                                                        17 KK A R V K FREDNAKLMC EFDNYVYI REFADEK E N M T I
                   2 bits  S  HV VR  2 bits  Q K  16E  N T IV V KDG NL  1 V M V L T  LK G  DR  1 T C L T L MGD  V  1 V 2 bits  4T  Q TE  L  TV  QME  1LSG M S GLEG ELMMG AFA NRKDNNK ILKTVR
                                             2 bits
                                                                       MT E V
                                                          2 bits
                   0F VG K Y N K M K E S Q S D E F D E YL LG L V P N FAL K V I K M  0 S I L EGG V VQ T K  S  E S T  S  T C  S RS P I A S GRNV  13 DF  18 V TF  0 S K Y NF D G I V D V S A KR H I T S Y V KK N K S I K A LET I DG DRFNG I T IV N H L R GN  T KV S LKGI T ESVT L VG G D A  V  0 VA S AW FN I M ML T T G V T V 27T
                                                                                      2 bits
                                                                                        N
                         PF
                                                                                        T
                             DMT
                                 AVADDTMAY Q SW G DGKKT K F L EI
                                 1T M DN
                    C
                       I
                                                                          S
                                                                  T
                                                           I
                    M A
                                                                                  Q
                                                                               VN
                         D
                                                 Q L
                                                                                           V
                                                                     9 S
                      EV T D
                                                                                        E
                                                            TNA Q MT T K F E M R
                       E
                                                                                               Q
                                                                             VA V KL RF SH
                                                                              Q NPK
                             A
                                                                          C
                     S
                                                                              K T
                                                                         L IK A
                                                                              F S E
                                                                        R
                                                 SDFECN FDALYEH Y AL
                                                           K
                                    HHT
                         K
                                                                                       T
                        Q
                                                                                        V
                                                             T
                                                                                           K
                                                                                           L
                                                                                               L
                             V
                                                                                  T
                            S
                                                                      12 D
                                               L
                                               NT K L Q
                                                    TAA
                                                                  LHE
                                                    D
                                                      V MM
                                                    17 I
                                                      23 I
                                                             E L
                                                       S
                                                  TQ L
                                                  M T
                                               K
                                                                                 S
                   1 TWQL V V NVNYEAL C M A K Q A I D I D G MD K I Q L
                    LN
                                          Q
                                          N
                                          22 D M A
                    I
                      H C YR
                      T D
                           R EVE
                    T
                    FA NFDAAT AKGM
                     Y
                                              Q
                                              S
                                              H
                                                           VE S
                                              1 I T V E V N HP S K T N N ST M
                                              K
                                             0
                                            RK
                                           26 D G M
                                                           A
                                                            5
                                                            PEL
                                                           3
                                                            4
                                                            6
                                                                      11
                                                                     10
                                                                    8
                                                                      13
                                                                                   47
                                                                                  43
                                                                                 42
                                                                    7
                                                                  1
                                                             8
                                                             7
                                                                  2
                                                                    6
                                                                   5
                                                                   3
                                          23
                                          24
                                           25
                                        19
                                         20
                                         21
                                           27
                                              2
                                               3
                                               4
                                            28
                                            29
                                              GV AA
                           18
                        10 8  9  11  12  13  G S 14  15  16  17 E LM N G S 22  23  L EF I 24  25  26  27  T 28  A 29  N K 1  2  NS 3  4  5KL M 6  7  I 8  S 9  10  C 11  12  13 E D 14  15  TS I 17  I 18  HVER S LMG T N A K K E S V Q TFK TTE V I S KLN K E P E D E S TTADK G K T 27  28  29  MK S Y S N P T I Y I C 9  MK 10  R 11  S 12  13  R A 14  T 15  0 S T Y NF SVGEECDM I T S F G P N V 14  15  16  N 18  19  20  21  22  23  S 24  T 25  26  27 DG 28  29  30  31  32 I  33  34
                      7
                            21
                            20
                           19
                      6
                    2
                    1
                                        R
                      5
                     4
                     3
                                               5
                                                     21
                                                      22
                                                       24
                                                     20
                                                    Q
                                                     19
                                                     S
                                                          T
                                                          1 M V
                                                           2
                                                          N
                                                       I
                                                       25
                                                       26
                                                 10
                                                  11
                                                  12
                                                 9
                                                6
                                                7
                                                 8
                                                   15
                                                    16
                                                   14
                                                             (b)
                                               图 2    FABP  基因家族  Motif 分布
              (a) 从左到右分别为  FABP  基因进化树、Motif 分布情况与结构域分布情况;(b) 6     个  Motif 的标志图,从左到右分别为   Motif 1~6。
                                        Fig. 2 Putative conserved motifs of the FABP genes
              (a) the phylogenetic tree, Motif and domain of the E. japonicus FABP genes from left to right; (b) the logos of Motifs 1-6, from left to right.
              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
                                                            6
   46   47   48   49   50   51   52   53   54   55   56