Page 51 - 《水产学报》2026年第04期
P. 51
4 期 水 产 学 报 50 卷
中的 FATTYACIDBP1/3 (PRINTS 登录号: PR00178) 两 种 形 式 , FABP10 仅 含 Motif2, FABP1 和
(图 2)。与配体结合密切相关的 FATTYACIDBP2 FABP6 则由独特的 Motif5 构成。序列比对发现,
在鱼类 FABP 基因中存在 4 种变异形式 (图 2-a), 位于 6 号染色体的 FABP7.1 和 FABP7.2 基因存在
即 Motif2、Motif2+Motif3、Motif2+Motif6 和 Motif5。 Motif 3 和 Motif 4 的缺失,这主要由该区域部分
上述 4 种变异形式与 FABP 基因进化树上的 3 个 碱基缺失导致。基因结构分析显示,大多数 FABP
分支高度吻合:支 2 基因包含 Motif2+Motif3 组合, 基因含有 4 个外显子,结构相对保守 (图 2-a)。
支 3 基因包含 Motif2+Motif6组合,而支 1 分化为
FABP2.1 鳀 E. japonicus colored ranges
FABP2b 金钱鱼 S. argus
FABP2b 鳜 S. chuatsi FABP1
FABP2.2 鳀 E. japonicus FABP2
FABP2 大西洋鲑 S. salar FABP3
FABP2 斑马鱼 D. rerio cluster3 FABP4
FABP6
FABP2 裸盖鱼 A. fimbria FABP7
FABP2a 金钱鱼 S. argus FABP10a
FABP2 日本花鲈 L. japonicus
FABP2 鳜 S. chuatsi Motif 1
FABP10a 鳀 E. japonicus Motif 2
FABP10a 斑马鱼 D. rerio Motif 3
FABP10 鳜 S. chuatsi Motif 4
FABP10 线鳢 C. striata Motif 5
FABP1 蟾蜍 R. arenarum Motif 6
FABP1 狭口短唇沟鲨 S. bivius
FABP1 美洲肺鱼 L. paradoxa FABP superfamily
FABP1 乌鳢 C. argus
FABP1a 斑马鱼 D. rerio cluster1
FABP1 大西洋鲑 S. salar
FABP1b 斑马鱼 D. rerio
FABP1 ޣᶺתٚ吟 T. rubripes
FABP1 ׄջെϪ E. coioides
FABP1 鳜 S. chuatsi
FABP1.1 鳀 E. japonicus
FABP1.2 鳀 E. japonicus
FABP6 鳀 E. japonicus
FABP4 斑马鱼 D. rerio
FABP4 鳜 S. chuatsi
FABP4 鳀 E. japonicus
FABP4 鲤 C. carpio
FABP3 斑马鱼 D. rerio
FABP3 黄颡鱼 T. fulvidraco
FABP3 白斑狗鱼 E. lucius
FABP3 大西洋鲑 S. salar
FABP3.1 鳀 E. japonicus
FABP3 鳜 S. chuatsi
FABP3b 革首南极鱼 N. coriiceps
FABP3b 驼背 南极鱼 G. gibberifrons
FABP3b 扁嘴副带腭鱼 P. charcoti
FABP3b 黑鳍冰鱼 C. aceratus
FABP3b 南极小带腭鱼 P. antarcticus
FABP3.2 鳀 E. japonicus
FABP3.3 鳀 E. japonicus
FABP3 翘嘴鲌 C. alburnus cluster2
FABP3 鲫 C. auratus
FABP3.4 鳀 E. japonicus
FABP3 虹鳟 O. mykiss
FABP3a 大西洋鲑 S. salar
FABP3 裸盖鱼 A. fimbria
FABP3a 南极小带腭鱼 P. antarcticus
FABP3a 革首南极鱼 N. coriiceps
FABP3a 黑鳍冰鱼 C. aceratus
FABP3a 驼背 南极鱼 G. gibberifrons
FABP7.1 鳀 E. japonicus
FABP7.2 鳀 E. japonicus
FABP7.3 鳀 E. japonicus
FABP7b 美洲胡瓜鱼 O. mordax
FABP7 白斑狗鱼 E. lucius
FABP7 虹鳟 O. mykiss
FABP7a美洲胡瓜鱼 O. mordax
FABP7 裸盖鱼 A. fimbria
FABP7 鳜 S. chuatsi
5' 3' 5' 3'
0 30 60 90 120 150 180 0 30 60 90 120 150 180
(a)
4 4 4 4 4 4
12K
3 3 3 3 3 3
17 KK A R V K FREDNAKLMC EFDNYVYI REFADEK E N M T I
2 bits S HV VR 2 bits Q K 16E N T IV V KDG NL 1 V M V L T LK G DR 1 T C L T L MGD V 1 V 2 bits 4T Q TE L TV QME 1LSG M S GLEG ELMMG AFA NRKDNNK ILKTVR
2 bits
MT E V
2 bits
0F VG K Y N K M K E S Q S D E F D E YL LG L V P N FAL K V I K M 0 S I L EGG V VQ T K S E S T S T C S RS P I A S GRNV 13 DF 18 V TF 0 S K Y NF D G I V D V S A KR H I T S Y V KK N K S I K A LET I DG DRFNG I T IV N H L R GN T KV S LKGI T ESVT L VG G D A V 0 VA S AW FN I M ML T T G V T V 27T
2 bits
N
PF
T
DMT
AVADDTMAY Q SW G DGKKT K F L EI
1T M DN
C
I
S
T
I
M A
Q
VN
D
Q L
V
9 S
EV T D
E
TNA Q MT T K F E M R
E
Q
VA V KL RF SH
Q NPK
A
C
S
K T
L IK A
F S E
R
SDFECN FDALYEH Y AL
K
HHT
K
T
Q
V
T
K
L
L
V
T
S
12 D
L
NT K L Q
TAA
LHE
D
V MM
17 I
23 I
E L
S
TQ L
M T
K
S
1 TWQL V V NVNYEAL C M A K Q A I D I D G MD K I Q L
LN
Q
N
22 D M A
I
H C YR
T D
R EVE
T
FA NFDAAT AKGM
Y
Q
S
H
VE S
1 I T V E V N HP S K T N N ST M
K
0
RK
26 D G M
A
5
PEL
3
4
6
11
10
8
13
47
43
42
7
1
8
7
2
6
5
3
23
24
25
19
20
21
27
2
3
4
28
29
GV AA
18
10 8 9 11 12 13 G S 14 15 16 17 E LM N G S 22 23 L EF I 24 25 26 27 T 28 A 29 N K 1 2 NS 3 4 5KL M 6 7 I 8 S 9 10 C 11 12 13 E D 14 15 TS I 17 I 18 HVER S LMG T N A K K E S V Q TFK TTE V I S KLN K E P E D E S TTADK G K T 27 28 29 MK S Y S N P T I Y I C 9 MK 10 R 11 S 12 13 R A 14 T 15 0 S T Y NF SVGEECDM I T S F G P N V 14 15 16 N 18 19 20 21 22 23 S 24 T 25 26 27 DG 28 29 30 31 32 I 33 34
7
21
20
19
6
2
1
R
5
4
3
5
21
22
24
20
Q
19
S
T
1 M V
2
N
I
25
26
10
11
12
9
6
7
8
15
16
14
(b)
图 2 FABP 基因家族 Motif 分布
(a) 从左到右分别为 FABP 基因进化树、Motif 分布情况与结构域分布情况;(b) 6 个 Motif 的标志图,从左到右分别为 Motif 1~6。
Fig. 2 Putative conserved motifs of the FABP genes
(a) the phylogenetic tree, Motif and domain of the E. japonicus FABP genes from left to right; (b) the logos of Motifs 1-6, from left to right.
https://www.china-fishery.cn 中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries
6

