Page 47 - 《水产学报》2026年第04期
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4 期                                     水    产    学    报                                 50 卷

              蛋白 (iLBP) 家族的重要成员，作为细胞内脂质分                       为阐明鳀     FABP  基因家族的分子特征、表达模式
              子伴侣参与调节脂肪酸的细胞内运输、代谢及信                            及其适应性演化潜力，本研究综合利用基因组与
                           [9]
              号转导等过程 。在脊椎动物中， FABP                基因家族         转录组数据，对鳀         FABP  基因家族进行了全面鉴
              起源于同一祖先基因，经历多次复制与分化，通                            定与分析，为深入理解鳀脂质代谢的分子基础及
              常可分为     3  个主要进化支 ，分支          1  包括  FABP1     其对海洋生态系统物质循环的贡献提供依据。
                                      [10]
              和  FABP6；分支    2  是最大的亚家族，包括          FABP3、
                                                                1    材料与方法
                                                     [11]
              FABP4、FABP5、FABP7、FABP8       和  FABP9 ；分
              支   3  仅 包 含  FABP2； 而   FABP10、 FABP11   和
                                                                1.1    实验材料
              FABP12  的进化地位尚不明确。在物种进化过程中，
              FABP  基因家族成员存在基因丢失与新增现象，                             实验用鳀于      2024  年  5  月采自黄海资源调查航
              故不同物种通常仅保留部分成员，如                   FABP10  和     次  (“北斗”号)。捕获后立即现场测量叉长，并解
                                                        [12]
              FABP11  主要存在于硬骨鱼等非哺乳类脊椎动物 ，                      剖取耳石、心脏、肝脏、性腺和背部白肌组织样
              而  FABP12  则在哺乳动物中进化出现           [13-14] 。       品。所有组织样品迅速置于液氮中冷冻，后转移
                   FABP  是最重要的脂肪酸载体之一，通过其                      至−80℃  超低温冰箱保存备用。返航后，根据耳
              保守的    β-桶状结构结合长链脂肪酸等疏水性配体，                      石区分年龄，将        1  龄性成熟个体，按性别和叉长
              降低其胞内浓度，介导转运至特定细胞器进行代                            (110~120、120~130  和  130~140 mm) 分为  6  个组，
                       [15]
              谢或储存 。不同          FABP  成员在组织分布和配体               每组设置     3  个生物学重复。本研究获得了中国水
              偏好上存在差异，从而在脂质代谢、炎症反应等                            产科学研究院黄海水产研究所实验动物伦理审查
              生理病理过程中发挥特定功能                 [11, 16] 。哺乳动物     委员会批准      (审查编号: YSFRI-2024002)，实验过
                                          [16]
              FABP  功能与结构已有深入研究 ，相比之下，鱼                        程中操作人员严格遵守中国水产科学研究院黄海
              类  FABP  的相关信息了解较少。而鱼类由于碳水                       水产研究所实验动物伦理审查委员会伦理规范，
              化合物代谢能力不足，通常更偏好以脂质作为主                            并按照中国水产科学研究院黄海水产研究所实验
              要能量来源      [17-20] ，因此作为重要的脂肪酸载体，                动物伦理审查委员会制定的规章制度执行。
              鱼类   FABP  的研究正得到更多的关注，FABP             基因
                                                                1.2    鳀  FABP  基因家族成员的鉴定与序列获取
                                             [21]
              成 员 相 继 在 斑 马 鱼     (Danio  rerio) 、 日 本 花 鲈
                                  [22]
              (Lateolabrax  japonicus) 、 点 带 石 斑 鱼 (Epineph-       鳀基因组数据来自本课题组已测序组装的染色
                                                                           [33]
                          [23]
                                                [18]
              elus coioides) 、青鳉  (Oryzias latipes) 、三刺鱼       体级别基因组 (NCBI 登录号: GCA_040112795.1)，
              (Gasterosteus  aculeatus) 、 大 西 洋 鲑    (Salmo    在  EBI 网 站  (https://www.ebi.ac.uk) 下 载  FABP  基
                                   [18]
              salar) 、 金 鱼   (Carassius  auratus) 、 卵 形 鲳 鲹    因家族保守结构域         (PF00061) 的隐马尔可夫模型
                   [19]
                                             [24]
                                                                                           [34]
              (Trachinotus  ovatus) 、 矛 尾 复 虾 虎 鱼  (Synecho-   (HMM)。使用     HMMER 3.0  软件 ，以默认参数，
                               [25]
              gobius hasta) 、大菱鲆    (Scophthalmus maximus) [27]  e-value＜1.2×10 −22  在鳀基因组蛋白序列中进行搜
                         [26]
              和红鳍东方鲀         (Takifugu rubripes) [27]  等物种中被   索。将初步获得的候选蛋白序列提交至                      NCBI
              克隆并鉴定，这加快了鱼类             FABP  的研究进程。            CDD  数据库   (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/
                   鳀 (Engraulis japonicus) 是一种广泛分布于西太          cdd/)，以默认参数进行保守结构域预测，并通过
              平洋温带水域的中上层小型鱼类，作为黄海、东                            SMART BLAST (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/smart-
              海单种资源生物量最大的鱼种，是海洋生态系统                            blast/) 进行同源性验证，结合人工核查，最终确
              能量传递的关键种，具有极高的生态和经济价值                            定可靠的鳀      FABP  家族成员名单及蛋白、核酸序
              [28-29] 。鳀以浮游动物为食，其个体脂肪含量丰富               (平     列 。为进一步确保基因模型的准确性，利用本
                                                                 [35]
              均约   15%，最高可达      43%)，且富含多不饱和脂肪                课题组已获得的鳀鱼各组织转录组数据 ，使用
                                                                                                   [33]
              酸  (占总脂肪酸比例高达         23%) [30-32] 。鉴于鳀在高营       IGV-GSAman  软件对鉴定出的        FABP  基因结构进
              养级生物能量供给中的关键作用及其自身的高脂                            行可视化核对与手动修正。
              特性，深入解析其脂肪积累与动员的分子机制具
                                                                1.3    系统进化树构建与蛋白理化性质分析
              有重要意义。而         FABP  基因家族作为脂质代谢的
              核心参与者，在鳀中的系统研究尚属空白。因此，                               在  NCBI 数据库下载已报道的其他硬骨鱼

              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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