Page 53 - 《水产学报》2026年第04期
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4 期 水 产 学 报 50 卷
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(d) (e) (f) (g)
图 4 鳀 FABP 蛋白三级结构预测图
Fig. 4 3D structure prediction of the E. japonicus FABP protein
(a) FABP1, (b) FABP2, (c) FABP3, (d) FABP4, (e) FABP6, (f) FABP7, (g) FABP10a.
着核心角色,但其在众多具有特殊生态位和经
济价值的鱼类中尚未得到充分解析。本研究首
次在海洋关键种——鳀中完成了该基因家族的
全基因组鉴定、分子特征与表达谱的系统分析,
揭示了其独特的进化历史和表达模式,为理解
鳀适应高脂食性与洄游生活的分子机制提供了
新见解。
3.1 鳀 FABP 基因家族的结构保守性与特异性
图 5 FABP7 3D 结构示意图
黄色为 Motif3 缺失部分,在 βH 和 βI-折叠链的交界处以及 βG-折 本研究在鳀基因组中鉴定出 7 个亚型共 14 个
叠链;紫色为 Motif4 缺失部分,在 βI-折叠链。
FABP 基因。系统进化分析将其清晰地划分为三
Fig. 5 3D structure diagram of FABP7
个进化支,与脊椎动物 FABP 家族的经典分类一
The yellow part is the missing part of Motif3 at the junction of the βH
致 ,表明该家族在进化上的高度保守性。所有预
[10]
and βI-folded chains and the βG-folded chains, and the purple part is the
missing part of Motif4 at the βI-folded chains. 测的鳀 FABP 蛋白均具备典型的 β-桶状三级结构,
长呈正相关。④多拷贝基因的表达分化:同一亚 这是其执行脂质结合与转运功能的结构基础 。
[43]
型不同拷贝数基因其表达模式存在差异,提示功 在保守的框架下,本实验发现了鳀 FABP 家
能分化的可能。FABP3.1 主要在心脏和肌肉表达, 族的特异性。首先,在保守基序 (Motif) 组成上存
FABP3.2 高表达于肌肉,而 FABP3.3则主要在肝 在分支特异性变异。关键功能域 FATTYACIDBP2
脏中表达;FABP7.1 和 FABP7.2 特异性地在精巢 在不同进化支中由不同的 Motif 组合构成,这种
中 高 表 达 , 而 FABP7.3 在 肝 脏 表 达 更 突 出 ; 变异可能与不同亚型间配体结合特异性的分化有
FABP2.1 在雌性肝脏中特异性表达,而 FABP2.2 关 。其次,部分基因出现了结构变异。位于 6 号
[11]
主要在肌肉特别是雌性肌肉中表达 (图 6)。 染色体的 FABP7.1 和 FABP7.2 基因发生了 Motif 3
3 讨论 和 Motif 4 的缺失。序列分析表明这主要由编码区
序列缺失引起。由于在大多数硬骨鱼中仅鉴定到
FABP 基因家族在脊椎动物脂质代谢中扮演 2 个 FABP7 基因,且在经历第四次全基因组复制
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