Page 72 - 《水产学报》2026年第2期

2 期 李治平，等：缢蛏 HIF-1 和 PHD2 基因鉴定及其在低氧胁迫下的表达 50 卷

图 3)。在 HIF-α 进化树中， 进化树明显分为脊椎 HIF 拷贝。
动物和无脊椎动物两大支系，海葵和秀丽隐杆线 与 HIF-α 进化树拓扑结构相似， HIF-β 进化
虫位于进化树的基部，在无脊椎动物支系中，主 树也分为脊椎动物和无脊椎动物两大支系，海葵
要分为软体动物和节肢动物两个亚支，缢蛏 HIF- 和秀丽隐杆线虫位于进化树的基部；HIF-β 无脊
1α 与长牡蛎和魁蚶双壳贝类 HIF-1α 先聚在一起， 椎动物分支与 HIF-α 无脊椎动物分支完全一致
然后再与腹足类加州海兔 HIF-1α 聚在一起，形成 (图 3)；而在脊椎动物分支中，除海七鳃鳗鉴定到
软体动物 HIF-1α 亚支 (图 2)。节肢动物亚支包括 2 个 HIF 拷贝外，人、小鼠和斑马鱼 3 个物种均
中华绒螯蟹、光肩星天牛和黑腹果蝇；在脊椎动 有 3 个 HIF 基因拷贝。
物分支中，除海七鳃鳗鉴定到 2 个 HIF 拷贝外， PHD 进化树显示，秀丽隐杆线虫位于进化树
其他 3 个物种包括人、小鼠和斑马鱼均有 3 个 的基部 (图 4)，贝类中缢蛏、长牡蛎和美洲牡蛎

海七鳃鳗`P. marinus HIF-2β-like (XP 032831697.1)

100 100 100 人`H. sapiens HIF-2β (NP 055677.3) HIF-2β
小鼠`M. musculus HIF-2β (XP 006507302.1)
斑马鱼`D. rerio HIF-2β (XP 009301213.1)
66 100 人`H. sapiens HIF-1β (XP 047276696.1)
小鼠`M. musculus HIF-1β (NP 001032826.1)
96 51 斑马鱼`D. rerio HIF-1β (XP 005157909.1)
60 中华绒螯蟹`E. sinensis HIF-1β (XP 050732911.1)
100 光肩星天牛`A. glabripennis HIF-1β (XP 018573507.1)
黑腹果蝇`D. melanogaster HIF-1β (NP 731308.1) HIF-1β
89 长牡蛎`C. gigas HIF-1β (XP 011419460.2)
99 85 魁蚶`S. broughtonii HIF-1β (QCI03229.1)
100 缢蛏`S. constricta HIF-1β
加州海兔`A. californica HIF-1β (XP 005096897.1)
秀丽隐杆线虫`C. elegans HIF-1β (NP 001251327.1)
`
海葵 E. diaphana HIF-1β (KXJ26018.1)
0.05
图 3 NJ 法构建的 HIF-β 系统进化树
黑色三角形示 ScHIF-1β。
Fig. 3 Phylogenetic tree of HIF-1β constructed with Neighbor-Joining method
ScHIF-1β is indicated with black triangle.

100 人`H. sapiens PHD1 (NP_542770.2)
100 小鼠`M. musculus PHD1 (XP_030097849.1) PHD1
斑马鱼`D. rerio PHD1 (XP_688016.4)
95 100 人`H. sapiens PHD3 (NP_071356.1)
98 小鼠`M. musculus PHD3 (NP_082409.2) PHD3
斑马鱼`D. rerio PHD3 (NP_998475.1)
92 41 100 人`H. sapiens PHD2 (NP_071334.1)
小鼠`M. musculus PHD2 (NP_444437.2)
100
斑马鱼`D. rerio PHD2 (XP_002664281.2)
100 长牡蛎`C. gigas PHD2A (AVE14374.1)
86
美洲牡蛎`C. virginica PHD2 (XP_022331376.1)
99 缢蛏`S. constricta PHD2A
48 黑腹果蝇`D. melanogaster PHD2 (NP_649525.1) PHD2
赤拟谷盗`Tribolium castaneum PHD2 (NP_001164091.1)
61
日本沼虾`Macrobrachium nipponense PHD2 (AMZ03509.1)
93 缢蛏`S. constricta PHD2B
砂海螂`Mya arenaria PHD2 (XP_052766666.1)
99
长牡蛎`C. gigas PHD2B (AVE14375.1)
秀丽隐杆线虫`C. elegans PHD (NP_741621.1)
0.05
图 4 NJ 法构建的 PHD 系统进化树
黑色三角形示 ScPHD2A，黑色正方形示 ScPHD2B。
Fig. 4 Phylogenetic tree of PHD based on Neighbor-Joining method
The black triangles are marked with ScPHD2A, black squares are marked with ScPHD2B.

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