Page 71 - 《水产学报》2026年第2期

2 期 水 产 学 报 50 卷

长度为 2 070 bp，编码 689 个氨基酸，预测蛋白分 基酸 (图 1)，预测蛋白分子量为 50.6 ku，理论等
子量为 76.4 ku，理论等电点为 6.1，不具有信号肽 电点为 6.6。ScPHD2B ORF 长 1 305 bp，编码 434 个
氨基酸，预测蛋白分子量为 49.2 ku，理论等电点
和跨膜区。蛋白结构域分析结果显示，ScHIF-1α
和 ScHIF-1β 有 相 同 的 5 个 功 能 结 构 域 ， HLH、 为 7.5。ScPHD2A 和 ScPHD2B 不具有信号肽和跨
膜区，且 ScPHD2A 和 ScPHD2B 均含有 zf-MYND
PAS-A、PAS-B、PAC 和 C-TAD，ScHIF-1α 还具
和 P4Hc2 个功能结构域。ScPHD2A 与 ScPHD2B
有 ODDD 和 N-TAD 结 构 域 (图 1)。 ScHIF-1α 与
蛋白序列全长一致性为 23.6%，功能结构域 zf-
ScHIF-1β 蛋白序列全长一致性为 12.0%，功能结
MYND 一致性为 52.6%，P4Hc 为 42.6%。
构 域 间 的 保 守 性 较 高 ， HLH 一 致 性 为 27.8%，
2.2 缢蛏 HIF-1 和 PHD2 系统发育分析
PAS-A 为 33.8%，PAS-B 为 27.9%，PAC 为 27.3%，
C-TAD 为 7.9%。 利用 ScHIF-1α 和 ScHIF-1β 的氨基酸序列构
ScPHD2A 的 ORF 长 1 365 bp，编码 454 个氨 建系统进化树，得到了相似的拓扑结构 (图 2，

85 324
ScHIF-1α HLH PAS-A PAS-B PAC

17 70 151 252 318 367 733
181 436
ScHIF-1β HLH PAS-A PAS-B PAC
113 166 248 363 430 477 689
Zf-MYND
ScPHD2A P4Hc

19 56 237 422 454
Zf-MYND
ScPHD2B P4Hc

13 50 145 339 434
图 1 ScHIF-1 和 ScPHD 蛋白结构域示意图
Fig. 1 Schematic diagram of protein domain of ScHIF and ScPHD proteins

100 人`H. sapiens HIF-3α (XP_016882621.1)
94 小鼠`Mus musculus HIF-3α (NP_001156422.1) HIF-3α
斑马鱼`Danio rerio HIF-3α (XP_005157628.2)
100 海七鳃鳗`Petromyzon marinus HIF-2α-like (XP_032820789.1)
100 人`H. sapiens HIF-2α (NP_001421.2)
100 小鼠`Mus musculus HIF-2α (XP_030105331.1) HIF-2α
74 88 斑马鱼`Danio rerio HIF-2α (XP_695262.6)
海七鳃鳗`Petromyzon marinus HIF-2α (XP_032803933.1)
52 74 100 人`H. sapiens HIF-1α (NP_001521.1)
小鼠`Mus musculus HIF-1α (XP_006515541.1)
98 斑马鱼`Danio rerio HIF-1α (NP_001295488.1)
89 中华绒螯蟹`Eriocheir sinensis HIF-1α (AHH85804.1)
52 光肩星天牛`Anoplophora glabripennis HIF-1α (XP_023312868.1)
黑腹果蝇`Drosophila melanogaster HIF-1α (NP_524584.2)
94 长牡蛎`C. gigas HIF-1α (BAG85183.1) HIF-1α
72 78 魁蚶`S. broughtonii HIF-1α (QCI03228.1)
缢蛏`S. constricta HIF-1α
99 加州海兔`Aplysia californica HIF-1α (XP_012941668.1)
秀丽隐杆线虫`C. elegans HIF-1α (NP_001023893.1)
海葵 Exaiptasia diaphana HIF-1α (KXJ20783.1)
`
0.1
图 2 NJ 法构建的 HIF-α 系统进化树
黑色三角形示 ScHIF-1α。
Fig. 2 Phylogenetic tree of HIF-α constructed with Neighbor-Joining method
ScHIF-α is indicated with black triangle.

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